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논문 상세정보

은어, Plecoglossus altivelis 난소에서 발현하는 Connexin 35 cDNA의 해석

Molecular Cloning and Nucleotide Sequence of Connexin 35 cDNA in the Ovary from the Sweetfish, Plecoglossus altivelis

초록

기존의 Cx 배열을 참고로 종내${cdot}$종간을 통하여 잘 보존되어져 있는 영역에서 primer를 설계하고, 은어의 난소를 재료로 하여 PCR을 실시하였다. 증폭된 cDNA 단편을 이용하여, 5'RACE 및 3'RACE법에 의해 미지의 영역을 cloning하여 난소에서 발현하는 Cx cDNA의 전염기배열을 결정하였다. 기존의 Cx 배열과 상동성을 비교한 결과, 대서양산 민어의 Cx32.7과 $63.8{\%}$, bovine의 Cx44와 $61.6{\%}$ 및 대서양산 민어의 Cx32.2와는 $56.7{\%}$의 상동성이 나타났다. 본 cDNA는 35,028 Da의 분자량을 code하는 open reading frame (ORF)으로 구성되어 있어, 은어 Cx35로 명명되었다. 또한 아미노산 배열의 친수성${\cdot}$소수성 영역의 분포예측 결과, 4곳의 소수성 영역과 4곳의 친수성 영역을 교차하는 전형적인 Cx의 구조와 일치하였으며, Cx family의 공통${\cdot}$필수적인 배열인 제1세포외 domain의 consensus 배열 및 제2세포외 domain의 consensus 배열도 존재하였다.

Abstract

Mixed primers based on the high sequence homology of selected regions of known connexins (Cxs) was used for PCR reaction. A full-length connexin cDNA of sweetfish (Plecoglossus altivelis) was cloned by rapid amplification of cDNA 5'and (5'RACE) and 3'RACE method. When compared to other known Cx sequences, homology of sweetfish Cx cDNA to Atlantic croaker, Mycropogonias undulatus Cx32.7, bovine, Bos taurus Cx44 and Atlantic croaker Cx32.2 were $63.8{\%},\;61.6{\%}\;and\;56.7{\%}$, respectively. This cDNA encoded 308 amino acids (35,028 dalton) and named as sweetfish Cx35. Hydropathicity analysis of predicted amino acid sequences indicated that sweetfish Cx35 have four major hydrophobic regions and four major hydrophilic regions, suggesting its topology is similar to that of known Cxs. The presence of a tfical Cx consensus sequences were identified in each of the extracellular loops (first loop and second loop).

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