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신약후보물질 발굴을 위한 가상 스크리닝 방법의 개발 원문보기

BT news : 한국생물공학회소식지, v.13 no.4, 2006년, pp.14 - 22  

박황서 (세종대학교 생명공학과)

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문제 정의

  • 유전상수가 내부보다는 크며 단백질에 따라 다양한 값을 가질 것이다. 따라서 단백질의 구조와 기능에 밀접한 관련이 있는 단백질 외부의 유전상수 &를 집중적으로 다루고자 한다. 단백질 내부는 운동성이 별로 없는 부분이므로 식 (5)에서 K 값을 0으로 근사할 수 있다.
  • 따라서 단백질과 화합물 사이의 결합에너지에서 가장 중요한 요소인 정전기적 상호작용을 정확하게 기술하기 위해서는 특정 단백질의 활성자리에 대한 8값을 정확히 계산해내는 일이 필수적으로 요구된다. 우리는 구형 단백질의 내부와 외부에 대한 유전상수 값들을 얻을 수 있는 방법을 개발하고 이를 효과적으로 이용하고자 한다.
  • 이와 관련하여. 우리는 현재 유전 알고리즘 (genetic algorithm) 을 효과적으로 적용하여 새로운 S 와 %들을 개발하고 있는데, 이에 대해 간단히 소개하고자 한다.

가설 설정

  • 첫째, 특정 분자의 수화에너지는 아래 식과 같이, 그 구성원자들이 원자상태에서 기여하는 수화에너지들의 합으로 볼 수 있다. 둘째, 가 구싱원사의 수화에너지는원사의 .但다 아普叫너, 와 :L 원자가용매에 노출된 부분부피의 곱으로 근사할 수 있다.
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