[논문]Quantitative Structure Determinations of Glycine/Cu(100) and Cu(110)

강지훈

doi:10.4283/jkms.2006.16.1.079

Quantitative Structure Determinations of Glycine/Cu(100) and Cu(110) 원문보기

韓國磁氣學會誌 = Journal of the Korean Magnetics Society, v.16 no.1, 2006년, pp.79 - 83

초록
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광전자 회절을 이용한 정량적 구조 결정이 Cu(100)/glycine $(NH_2CH_3COOH)$ 흡착 계에 대하여 얻어졌다. $Cu(100)(2\times4)$pg-glycine $(NH_2CH_3COOH)$에서 분자는 아미노기의 질소원자, 카복실기의 두 개의 산소원자가 기판원자와 결합에 참여하고 있음이 얻어졌다. 질소원자, 산소원자 모두 atop site에 흡착을 한다. 질소원자와 산소원자 모두 atop 정 위치에서 각각 $5^{\circ}\pm4^{\circ},\;9^{\circ}\pm2^{\circ}$ 벗어난 위치에 있는 사실을 얻었다. 화학결합 길이는 Cu-N와 Cu-O모두 $2.05\pm0.02\;{\AA}$ 결정되었다. 두 개의 산소가 화학결합에 개입된 것으로 보이며, 이 결과는 Cu(110)에서 얻은 결과와 유사하다. Cu(110)$(2\times3)$ pg-glycine에서 얻은 결과를 재해석한 결과 두 산소는 동등하지 않고 한 산소원자는 다른 산소원자 보다 $0.29\;{\AA}$ 결합 높이가 차이가 있음을 보였다.

Abstract ▼ AI-Helper

The first quantitative structure determination has been obtained for Cu(100)/glycine $(NH_2CH_3COOH)$. The molecule is adsorbed on the surface via two functional groups: the nitrogen of the amino group and one or both two oxygen atoms of the carboxylate group are bonded in near atop site. The Cu-N is tilted $5^{\circ}\pm4^{\circ}C$, away from the surface normal whilst the Cu-O is tilted by $9^{\circ}\pm2^{\circ}C$. The chemical bonding lengths are determined with $2.05\pm0.02\;{\AA}$ for both Cu-N and Cu-O. This bonding geometry is similar to that of glycine on Cu(110). A reanalysis of O Is from the Cu(110)$(2\times3)$pg-glycine show two oxygen atoms are inequivalent, with one being offset $0.29\;{\AA}$ more than the other.

주제어

AI 본문요약
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문제 정의

기법으로 이해 하고 자 한다는 점을 들 수 있다. 본 논문은 광전자 회절 분석을 통하여 글리신 분자의 표면 흡착구조를 정량적 결정에 관한 것이다. 아미노산은 단백질의 기본 구성 단위이다.

가설 설정

2. (a) Tridentate adsorption of glycine: the nitrogen and two oxygen atoms are bonded to the surface, (b) Bidentate adsorption of glycine: the nitrogen and one oxygen are dbonded to the surface.
07A 약간 이동한 것이다 [5丄 이점은 Cu(100)의 상황과 유사하다.기존 결과의 재해석은 두 산소 원자가 동등하지 않다고 가정하고 최적화를 진행한 것이다. 결과는 R-factor 값이 0.
bindentate 흡착인 경우는 tri dentate 흡착에 비하여 modulation function 진폭은 반으로 줄어든다. 초기에는 두 개의 산소가 화학결합에 참여 하고 있고, 동등한 흡착 위치에 있다는 가정 하에 해석을 진행하였다. 진동변수를 포함한 여러 변수에 대하여 최적화를 진행한 결과 R-factor는 0.

제안 방법

Cu( 100)/glycinate의 구조 결정은 N Is, O Is의 데이터를 분석하여 진행하였고, 7개의 질소 데이터에서 질소를 emitter, 8개의 산소데이터 (Fig. 3)에서 산소를 emitters. 취급하여 각각 독립적으로 구조 결정을 진행하였다.
흡착에는 두 개의 기능성 기가 화학결합에 참여하고 있을 것으로 기대되며, 이를 확인하였다. Cu(100)에서의 흡착구조와 기존의 Cu(110>의 흡착구조의 차이를 비교하였다.
질소데이터를 해석할 때에는 산소는 광전자 방출원이 아니라 기판원자와 같이 N Is 방출 광전자의 탄성산란 진폭을 주는 산란자의 역할만 하였다. Ni(110)/C₆H(계 [2] 의 경우와 달리 분자내부산란 효과는 기판원자에 비하여 작을 것으로 예상되어 초기에는 고려하지 않았으나, 내부 산란 효과 및 분자 간 산란효과 c(2X4) 까지 고려한 경우에서도 큰 변화가 없었으며, fitting] 개선을 주지 못하였기 때문에 탄소에 의한 효과는 무시하고 구조해석을 진행하였다. fitting의 goodness는 다음의 R-fhctor로정의하며, 1인 경우 완전 일치, 0: 상관관계가 없는 경우, 2: 반 상관관계 (anti-correlation)로 해석한다.
LEED 의 전자 빔 효과에 의한 영향은 LEED 측정 후 XPS를 통하여 확인 하였는데, N Is, 0 Is, C Is의 peak 높이와 기판 Cu 2p의 peak 높이의 비율의 변화로 확인하였고 매우 안정함을 확인하였다. 광전자 회절 구조해석은 120K에서 얻어진 N Is, 0 Is 방출을 이용하였으며, 실온에서 얻은 결과보다 더 강하게, 잘 구분되는 modulation function 주는 저온결과로 해석하였다. 실험결과는 0°~50° 사이의 각도에서 10。간격으로 [011], [001] 의 방위 방향(Fig.
본 논문에서는 광전자 회절 방법을 가지고 Cu(100)/글리신의 표면 구조 결정이 연구되었고, Cu(110)의 표면 실험결과를 재 해석하였다.
3)에서 산소를 emitters. 취급하여 각각 독립적으로 구조 결정을 진행하였다. 질소데이터를 해석할 때에는 산소는 광전자 방출원이 아니라 기판원자와 같이 N Is 방출 광전자의 탄성산란 진폭을 주는 산란자의 역할만 하였다.

성능/효과

즉 Cu(100)/ glycinate의 형태로 표면에 흡착하게 된다. LEED 의 전자 빔 효과에 의한 영향은 LEED 측정 후 XPS를 통하여 확인 하였는데, N Is, 0 Is, C Is의 peak 높이와 기판 Cu 2p의 peak 높이의 비율의 변화로 확인하였고 매우 안정함을 확인하였다. 광전자 회절 구조해석은 120K에서 얻어진 N Is, 0 Is 방출을 이용하였으며, 실온에서 얻은 결과보다 더 강하게, 잘 구분되는 modulation function 주는 저온결과로 해석하였다.
14를 얻었다. 사용한 기판 원자(구리원자)의 진동은 0.005 A2, 산소의 진동은 표면과 평행한 방향은 0.010 A2, 표면과 직교한 방향은 0.005 A2로 표면과 평행한 방향의 성분이 최적화되었다. 이론적 Modulation 진폭은 진동변수의 선택에 크게 의존한다.
Liebsch의초기 연구로부터 비롯되었다[1]. 이 연구에 의하면 표면에 홉착된 기체의 구조 정보는 흡착된 기체의 core에서 방출된 광전자는 즉정장치에서 photoemission current 변화를 주는데 이 변화는 광전자 방출된 전자가 홉착기체의 core에서 나온 후 주위원자와 탄성산란에 의한 성분(elastically scattered component)과 방출 후 탄성산란 없이 (directly emitted) 측정 장치에 도달한 성분 간의 간섭에 의한 photoemission current 의 변화를 분석하여 얻어질 수 있다는 것이었다. 초기 광전자 회절의 연구는 원자 흡착 기체의 흡착에 대한 구조 연구가 주로 되었다.

참고문헌 (7)

A. Liebsch, 32, 1203(1974)
J.-H. Kang, R. L. Toomes, J. Robinson, D. P. Woodruff, O. Schaf, R. Terborg, R. Lidsay, P. Baumgartel, and A. M. Bradshaw, Surf. Sci. 448, 23(2000)

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N. A. Booth, R. Davis, R. Toomes, D. P. Woodruff, C. Hirschmugl, K.-M. Schindler, O. Schaff, V. Fernandez, A. Theobald, Ph. Hofmann, R. Lindsay, T. GieBel, P. Baumgartel, and A. M. Bradshaw, Surf. Sci. 387, 152(1997)

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L. G M. Pettersson, private communication
N. A. Booth, D. P. Woodruff, O. Schaff, T. GieBel, R. Lindsay, P. Baumgartel, and A. M. Bradshaw, Surf. Sci. 397, 258(1998)

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J. Hasselstrorn, O. Karis, M. Weinelt, N. Wassdahl, A. Nilsson, M. Nyberg, L. G. M. Pettersson, M. G. Samant, and J. Stahr, Surf. Sci. 407, 221(1998)

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J. Hasselstrorn, A. Fohlisch, O. Karis, N. Wassdahl, M. Weinelt, A. Nilsson, M. Nyberg, L.G. M. Pettersson, and J. Stohr, J. Chem. Phys. 110, 4880(1999)

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표제어: PCR

동의어: Packet Collision Rate

용어 설명 출처 목록 (6)

용어 설명: PCR은 세균 특이성이 있는 primer를 이용하여 적은 수의 세균이 있을지라도 쉽게 검출할 수 있는 유용한 방법이며, 이를 이용하여 구강 내 치면세균막이나 타액에서 직접 세균을 검출할 수 있게 되었다[8].

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