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D2GSNP: a web server for the selection of Single Nucleotide Polymorphisms within human disease genes 원문보기

Genomics & informatics, v.4 no.1, 2006년, pp.45 - 47  

Kang Hyo-Jin (National Genome Information Center, Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology) ,  Hong Tae-Hui (National Genome Information Center, Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology) ,  Chung Won-Hyong (National Genome Information Center, Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology) ,  Kim Young-Uk (National Genome Information Center, Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology) ,  Jung Jin-Hee (National Genome Information Center, Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology) ,  Hwang So-Hyun (National Genome Information Center, Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology) ,  Han A-Reum (National Genome Information Center, Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology) ,  Kim Young-Joo (National Genome Information Center, Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology)

Abstract ▼ AI-Helper 아이콘AI-Helper

D2GSNP is a web-based server for the selection of single nucleotide polymorph isms (SNPs) within genes related to human diseases. The D2GSNP is based on a relational database created by downloading and parsing OMIM, GAD, and dbSNP, and merging it with positional information of UCSC Golden Path. Tota...

주제어

#SNP   #disease gene   #association study  

AI 본문요약
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제안 방법

  • For example, a researcher who is interested in several diseases with limited reso니rces may use D2GSNP to pick a gene-dense region of chromosomes with a few clicks and select effective SNPs for his/her disease association study. To automate the selection step, D2GSNP constructed a local relational database which integrated four public databases, OMIM (Online Mendelian Inheritance in Man), GAD (Genetic Association Database), dbSNP, and UCSC G이denPath. The web­ based interface was implemented using JavaServer Faces (JSF) technology which has an advantage of constructing a clearly defined architecture by separating application logic and presentation.
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참고문헌 (15)

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