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정보처리학회논문지. KIPS transactions on software and data engineering. 소프트웨어 및 데이터 공학, v.2 no.2, 2013년, pp.123 - 130
임경열 (한양대학교 전자컴퓨터통신과) , 김동오 (한국전자통신연구원) , 김홍연 (한국전자통신연구원) , 박기한 (한양대학교 전자컴퓨터통신과) , 최민석 (한양대학교 전자컴퓨터통신과) , 원유집 (한양대학교 전자컴퓨터통신공학과)
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As size of genomic data is increasing rapidly, the needs for high-performance computing system to process and store genomic data is also increasing. In this paper, we captured I/O trace of a system which analyzed 500 million sequence reads data in Genome analysis pipeline for 86 hours. The workload ...
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| 핵심어 | 질문 | 논문에서 추출한 답변 |
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| 바이오 워크로드 분석 도구는 어떻게 구성되는가? | Fig. 2에서 보듯이 바이오 워크로드 분석 도구는 수집된 워크로드 데이터를 저장, 관리, 분석하기 위한 바이오 워크 로드 분석 서버, 바이오 워크로드 응용에서 발생되는 I/O 워크로드를 수집하기 위한 바이오 워크로드 분석 클라이언트, 분석된 결과를 사용자가 이해하기 쉽게 보여주기 위한 바이오 워크로드 분석 웹 GUI 3가지 컴포넌트로 구성된다. | |
| SSD의 장단점은 무엇인가? | 오래전부터 저장 장치는 컴퓨팅 시스템의 병목지점이 되어왔지만 최근 플래시 메모리를 사용한 SSD가 사용되면서 저장장치 기술이 빠르게 발전하고 있다. SSD가 빠른 접근 속도, 저전력, 무소음, 뛰어난 내구성 등 많은 장점을 갖고 있지만 HDD와 비교했을 때는 아직도 단위 저장 공간 당 가격이 높고 플래시 메모리의 특성상 제자리 쓰기(in-placeupdate)가 불가능한 점, 블록의 지움 횟수 제한과 같은 단점이 있다[1]. | |
| SNP 정보 추출 단계에서는 어떤 과정이 포함되는가? | SNP 정보 추출은 SNP calling 단계로써 시퀀스 매핑의 결과를 SAM(Sequence Alignment/Map)형식[7]으로 변환하는 역할을 담당한다. 이 단계에서 Genomic 위치에 따른 정렬 과정이 포함된다. |
J. Kang, H. Jo, J. Kim, and J. Lee, "A superblock-based flash translation layer for nand flash memory," pp.161-170, 2006.
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