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논문 상세정보

블록순환 행렬에 의한 이중나선 DNA 구조 (II

A Double Helix DNA Structure Based on Block Circulant Matrix (II)

초록

본 논문에서는 4개의 유전자 핵염기 C, U(T), A, G를 행렬로 표시하고, $4{\times}4$ RNA(ribose nucleic acid)에서 $8{\times}8$ DNA(deoxyribose nucleic acid)로의 행렬 구조에 대해 서술한다. BCHJM (block circulant Hadamard-Jacket matrix)에 의해 DNA 이중나선 구조(double helix)를 해석한다. 직교 BCHJM은 비대칭 쌍 상보성(complementary)을 보이고 있다. 블록순환(block circulant) RNA 쌍 손상(damage) 신뢰성(reliability)은 기존 이중나선 보다 우수함을 보이고 있다. k=4, N=1인 경우 블록 순환 상보 쌍 신뢰도는 93.75%이고, k=4, N=4인 경우 신뢰도는 98.44%로 기존 이중나선의 경우 보다 4.69% 개선된다.

Abstract

In this paper, we present the four genetic nitrogenous bases of C, U(T), A, G to matrices and describe the structures from $4{\times}4$ RNA(ribose nucleic acid) to $8{\times}8$ DNA((deoxyribose nucleic acid) matrices. we analysis a deoxyribose nucleic acid (DNA) double helix based on the block circulant Hadamard-Jacket matrix (BCHJM). The orthogonal BCHJM is anti-symmetric pair complementary of the core DNA. The block circulant ribonucleic acid (RNA) repair damage reliability is better than the conventional double helix. In case of k=4 and N=1, the reliability of block circulant complementarity is 93.75%, and in case of k=4 and N=4, it is 98.44%. Therefore it improves 4.69% than conventional case of double helix.

질의응답 

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핵심어 질문 논문에서 추출한 답변
상보성 시퀀스 종류
상보성 시퀀스 종류는 무엇이 있는가?
DNA나 RNA를 감지하거나 감지하지 못하는 두 가지가 있다

상보성 시퀀스 종류에는 DNA나 RNA를 감지하거나 감지하지 못하는 두 가지가 있다. 감지하지 못하는 경우는 감지 시퀀스와 상보 관계에 있다.

순환 부행렬
순환 부행렬의 특징은?
모든 행은 첫째행의 주기적천이(cyclic shift)가 이루어지며, 모든 열은 첫 번째 열의 주기적 천이가 이루어지는 성질을 각 부행렬이 갖도록 한다

순환 부행렬(submatrix)의 크기는 2 × 2이다. 즉 모든 행은 첫째행의 주기적천이(cyclic shift)가 이루어지며, 모든 열은 첫 번째 열의 주기적 천이가 이루어지는 성질을 각 부행렬이 갖도록 한다. 이러한 부행렬을 순환 블록(circulant block)이라 한다.

자연계에서 상보성
자연계에서 상보성이란?
DNA(deoxyribose nucleic acid) 복제 기본 원리이고, DNA나 RNA(ribonucleic acid) 시퀀스(sequence) 간에 사용되는 성질을 표현하는 원리이며, DNA와 RNA가 서로 비대칭으로 할당되면 시퀀스의 각 위치에서 nucleotide base는 거울에서 보는 것처럼 거꾸로 보이는 상보성이 된다

분자생물학(molecular biology)에서 상보성(complementarity)은 각각 lock-and key 원리를 따르는 두 구조간의 관계를 설명한다. 자연계에서 상보성은 DNA(deoxyribose nucleic acid) 복제 기본 원리이고, DNA나 RNA(ribonucleic acid) 시퀀스(sequence) 간에 사용되는 성질을 표현하는 원리이며, DNA와 RNA가 서로 비대칭으로 할당되면 시퀀스의 각 위치에서 nucleotide base는 거울에서 보는 것처럼 거꾸로 보이는 상보성이 된다. 이처럼 상보성 base를 쌍으로 만들면 세포(cell)들이 한세대에서 다음 세대로 정보를 복사하고, 심지어는 시퀀스에 저장된 정보를 인식하고 정보손상을 개선하기도 한다.

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