[논문]식품에서 분리된 Salmonella Enteritidis MFDS1004839의 유전체 서열 분석

이우정; 박세욱; 유란희; 주인선; 곽효선; 김순한

doi:10.7845/kjm.2018.8008

식품에서 분리된 Salmonella Enteritidis MFDS1004839의 유전체 서열 분석
Complete genome sequence of Salmonella Enteritidis MFDS1004839 isolated from food 원문보기

Korean journal of microbiology = 미생물학회지, v.54 no.2, 2018년, pp.164 - 166

이우정 (식품의약품안전처 식품의약품안전평가원 미생물과) , 박세욱 (식품의약품안전처 식품의약품안전평가원 미생물과) , 유란희 (식품의약품안전처 식품의약품안전평가원 미생물과) , 주인선 (식품의약품안전처 식품의약품안전평가원 미생물과) , 곽효선 (식품의약품안전처 식품의약품안전평가원 미생물과) , 김순한 (식품의약품안전처 식품의약품안전평가원 미생물과)

초록
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본 연구에서는 2014년 국내에서 식중독 원인식품인 김밥으로부터 분리된 Salmonella Enteritidis의 유전체 분석을 수행하였다. Salmonella Enteritidis MFDS1004839는 한 개의 chromosome (4,679,649 bp)과 plasmid (96,994 bp)로 구성되어있고, 각각의 G + C contents는 52.2%와 49.3%로 확인되었다. chromosome와 plasmid DNA에 예측된 유전자의 총 수는 4,482개의 단백질 코딩유전자와 84개 tRNA, 그리고 22개의 rRNA였다.

Abstract ▼ AI-Helper

Salmonella enterica subsp. enterica is a foodborne pathogen that has been detected throughout the world. Here, we present the complete genome sequence of Salmonella Enteritidis isolated from a commercial kimbap that caused foodborne illness in the Republic of Korea in 2014. Complete genome sequence analysis of Salmonella Enteritidis MFDS1004839 revealed a 4,679,649 bp chromosome and a 96,994 bp plasmid, with G + C contents of 52.2% and 49.3%, respectively. The chromosome and plasmid genome included 4,482 predicted protein-coding sequences, 84 tRNAs and 22 rRNAs genes.

주제어

AI 본문요약
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문제 정의

본 연구에서는 2014년 국내에서 식중독 원인식품인 김밥으로부터 분리된 Salmonella Enteritidis의 유전체 분석을 수행하였다. Salmonella Enteritidis MFDS1004839는 한 개의 chromosome (4,679,649 bp)과 plasmid (96,994 bp)로
대상 데이터
- enterica Serovar Enteritidis (also known as Salmonella Enteritidis) MFDS1004839 was isolated from a commercial kimbap that caused foodborne disease in the Republic of Korea in 2014. The isolate has been deposited at Korean Culture Collection for Foodborne Pathogens under the strain number MFDS1004839. Here, we report the complete genome sequence of Salmonella Enteritidis MFDS1004839.
- 3%로 확인되었다. chromosome와 plasmid DNA에 예측된 유전자의 총 수는 4,482개의 단백질 코딩유전자와 84개 tRNA, 그리고 22개의 rRNA였다.

성능/효과

3%, respectively. As a result of gene prediction, this strain was found to possess 4,359 CDSs, 84 tRNAs and 22 rRNAs in the chromosome and 123 CDSs in pSE1004839. The serovar of Salmonella Enteritidis MFDS1004839 was predicted to be 9:g,m:-(O antigen: 9, H antigen phase1: g,m, H antigen phase2: not detected) Enteritidis using SeqSero software (Zhang et al.
후)원인 식품인">원인식품인 김밥으로부터 분리된 Salmonella Enteritidis의 유전체 분석을 수행하였다. Salmonella Enteritidis MFDS1004839는 한 개의 chromosome (4,679,649 bp)과 plasmid (96,994 bp)로 구성되어 있고, 각각의 G + C contents는 52.2%와 49.3%로 확인되었다. chromosome와 plasmid DNA에 예측된 유전자의 The complete genome sequence of Salmonella Enteritidis MFDS1004839 consisted of a 4,679,649 bp chromosome and a circular 96,994 bp plasmid (pSE1004839), with G + C contents of 52.2% and 49.3%, respectively. As a result of gene prediction, this strain was found to possess 4,359 CDSs, 84 tRNAs and 22 rRNAs in the chromosome and 123 CDSs in pSE1004839.

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