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HQSAR Study on Imidazo[1,2-b]pyridazine Derivatives as p38 MAP Kinase Antagonists 원문보기

Journal of the Chosun Natural Science = 조선자연과학논문집, v.11 no.2, 2018년, pp.107 - 112  

Bhujbal, Swapnil P. (Department of Biomedical Sciences, College of Medicine, Chosun University) ,  Keretsu, Seketoulie (Department of Biomedical Sciences, College of Medicine, Chosun University) ,  Cho, Seung Joo (Department of Biomedical Sciences, College of Medicine, Chosun University)

Abstract ▼ AI-Helper 아이콘AI-Helper

p38 MAP kinase belongs to the Mitogen-activated protein (MAP) kinase family; a serine/threonine kinase. It plays an important role in intracellular signal transduction pathways. It is associated with the development and progression of various cancer types making it a crucial drug target. Present stu...

주제어

#p38 MAP Kinase   #HQSAR   #Pyridazine Derivatives   #p38 MAP Kinase Antagonists  

AI 본문요약
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제안 방법

  • and were shown in Table 1. All the 20 compounds were sketched and optimized by energy minimization with tripos force field using SYBYL-X 2.1[14]. Gasteiger-Hückel charges were applied as partial charges.
  • The best possible HQSAR model was generated from screening through the 12 default HL values ranging from 53-401. The parameters such as atom (A), bond (B), connection (C), chirality (Ch), hydrogen (H) and donor/acceptor (DA) were used for the model development. The validity of the model depends on statistical parameters such as r2, q2 by Leave-one-out (LOO)[15].
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참고문헌 (15)

  1. K. P. Wilson, M. J. Fitzgibbon, P. R. Caron, J. P. Griffith, W. Chen, P. G. McCaffrey, S. P. Chambers, and M. S.-S. Su, "Crystal structure of p38 mitogen- activated protein kinase", J. Biol. Chem., Vol. 271, pp. 27696-27700, 1996. 

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  2. R. J. Davis, "Transcriptional regulation by MAP kinases", Mol. Reprod. Dev., Vol. 42, pp. 459-467, 1995. 

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  14. M. Clark, R. D. Cramer III, and N. V. Opdenbosch, "Validation of the general purpose tripos 5.2 force field", J. Comput. Chem., Vol. 10, pp. 982-1012, 1989. 

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  15. R. Kumar, B. Langstrom, and T. Darreh-Shori, "Novel ligands of Choline Acetyltransferase designed by in silico molecular docking, hologram QSAR and lead optimization", Sci. Rep., Vol. 6, p. 31247, 2016. 

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