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문제 정의
- 여기에는 이미 많은 훌륭한 프로그램듈이 개발되어 사용되고 있으며 성능상으로도 입종된 것들이 많이 있다. 그러므로 우리는 새로운 알고리즘의 개발보다는 데이터베이스와 연동을 통한 사용자의 편의성에 목적 두었다. 유사 서열 검색을 위해 NCBI에서 제공하는 BLAST 모듈을 이용하며 BLAST의 결과롤 파싱하여 결과를 재생성하여 사용자로 하여금 이해를 높이도록 하였다.
- 본 논문에서는 생명과학 실험실에서 발생하는 유전자 데이터롤 하나의 시스템 안에서 효율적으로 관리하고 다양한 서열분석 작업을 수행할 수 있는 웹 기반의 서열분석 및 관리시스템인 GWB롤 설계하고 구현하였다. 향후 계획으로는 DNA서열 수준의 정보 관리 뿐만 아니라 단백질 형태의 정보를 관리하고 이용할 수 있는 시스템으로의 업그레이드를 시도하는 것이다.
- 본 논문에서는 유전자 데이터를 다루는 일반적인 생명과학실험실에서 자체적으로 유전자 서열 데이터를 저장 관리하면서, 다양한 서열 분석작업을 수행해볼 수 있는 소프트웨어시스템을 설계 구현하고자 한다. 오랫동안 기존의 생명과학 실험실에서의 데이터 관리는 정확한 표준안이 마런되어 있지 않은 상태에서 일정한 양식을 정하여 그 양식에 맞도록 작성된 텍스트 파일 형태로 이루어져 왔다.
- 또 서열분석에 사용되는 분석프로그램의 종류도 매우 다양하며, 처리 데이터 양식이나 수행환경, 구현 프로그래밍 언어도 조금씩 차이가 있卫 프로그램 간의 연동도 되지 않아 분석작업이 어렵고 불편하였다. 본 논문에서는 이와 같은 문제점을 보완하여 하나의 시스템 안에서 효율적인 유전자 데이터의 관리와 다양한 서열 분석작업이 가능한 웹 기반의 서열 분석 및 관리 시스템인 GWB(Gene Workbench)를 설계하고 구현하였다. GWB는 로컬데이터베이스 관리뿐만 아니라 GenBank, EMBL, SWISSPROT와 같은 외부 공공 데이터베이스에 대한 접근 기능도 제공하며, 권한을 가진 내부 이용자와 그렇지 못한 외부 이용자들을 구분하여 일부 유용한 기능들은 외부 사용자들도 이용할 수 있도록 설계되었다.
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