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단백질 구조 정보 분석을 위한 바이오 온톨로지

Bio-ontology for Analyzing Protein Structure Information

한국정보과학회 03 가을학술발표논문집(2), 2003 Oct., 2003년, pp.799 - 801  

남덕우 (경기대학교 전자계산학과) ,  예형석 (경기대학교 전자계산학과) ,  진훈 (경기대학교 전자계산학과) ,  김인철 (경기대학교 전자계산학과)

초록
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생물정보학 분야에서의 온톨로지는 다양한 생물학적 의미들을 표현하는 구조로 되어 있으며, 생물학 데이터의 의미를 효과적으로 해석할 수 있는 매우 중요한 기술로 인식되고 있다. 특히 바이오 온톨로지는 생물학 데이터베이스로부터 정보에 대한 탐색과 추론 등 의미 전달 과정에서 중심적인 역할을 수행한다. 본 논문에서는 단백질 구조 예측을 지원하는 다중 에이전트시스템인 APSS내에서 각 구성원 에이전트들간에 온톨로지에 기초한 정확한 구조 정보의 전달을 통해 효과적인 단백질 구조 예측 작업을 지원하고자 한다. 이를 위하여 먼저 단백질 구조 관련 바이오 온톨로지의 설계방법을 제시하고, 이것에 기초한 실제 바이오 온톨로지의 설계에 대해 설명한다. 그리고 이렇게 구축된 단백질 구조 온톨로지를 APSS시스템 안에서 어떻게 응용하였는가에 대해서도 설명한다.

AI 본문요약
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문제 정의

  • APSS는 크게 자원, 분석, 관리 및 조정, 제어, 사용자 인터페이스 에이전트들로 구성되며 본 논문에서는 자원 에이전트인 PDB 에이전트와 관리 및 조정 에이전트인 CODY 에이전트 사이에서 동작하는 온톨로지에 관하여 설계하고 응용에 대하여 기술하고자 한다. 2장에서는 생물학 정보를 다루는 온톨로지 시스템들에 관하여 소개하고 3장에서는 바이오 온톨로지 및 APSS 내에서 PDB 에이전트가 수행하는 데이터를 온톨로지로 구축하기 위한 설계과정, 마지막으로 4장에서는 이와 같이 구축된 바이오 온톨로지 응용시스템으로서의 APSS에 관해 기술하고자 한다.
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