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생물정보학 데이터베이스를 활용한 플라비바이러스 구별 진단 방법
Distinct Diagnosis of Flavivirus Using Bioinformatics Database 원문보기

한국콘텐츠학회 2017년도 춘계 종합학술대회 논문집, 2017 May 12, 2017년, pp.109 - 110  

최재원 (충북대학교) ,  김민정 (충북대학교) ,  조병관 (충북대학교) ,  허재린 (충북대학교) ,  김학용 (충북대학교)

초록
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본 연구에서는 2016년 전 세계에 공포를 안겼던 지카 바이러스(Zika virus)와 최근 아열대성 기후의 확대로 인해 향후 대유행이 예상되는 뎅기 바이러스(Dengue virus)의 구별 진단 방법에 대해 논의하고자 한다. 두 바이러스는 모두 플라비바이러스 속(Flavivirus genus)에 해당되며, 동일한 단백질 도메인(domain)으로 구성되어 있다. 본 연구에서는 여러 도메인 중에서도 진단에 유리하다고 판단되는 비구조단백질 1(NS1, non-structural protein 1)을 선정하였으며, UniProt (Universal Protein Resource) 데이터베이스를 활용하여 지카 바이러스와 뎅기 바이러스의 비구조단백질 1의 아미노산 서열을 상호 비교 분석 하였다. 더 나아가 IEDB (Immune Epitope Database) 데이터베이스를 활용하여 비구조단백질 1의 아미노산 중, 진단에 용이한 에피토프로 예상되는 5개의 후보를 도출하였다. 최종적으로 후보군으로부터 지카 바이러스와 뎅기 바이러스를 구별하여 진단할 수 있다고 판단되는 에피토프(펩타이드)를 제안하였다.

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문제 정의

  • 따라서 지카 바이러스 및 뎅기 바이러스를 구별하여 진단할 수 있는 방법이 요구되고 있다. 본 연구에서는 생물정보학 데이터베이스를 활용하여 두 종류의 바이러스를 구별하여 진단할 수 있는 방법을 제안하고자 한다.
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