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제안 방법
- 백신 후보 펩타이드 서열의 에피토프 분석은 IEDB를 통해 진행하였다. 그 결과 3가지 후보서열 중 1번 서열(DRGWGNGCGLF)이 다른 후보서열 대비 4종류 바이러스 모두에서 에피토프로써 강하게 작용할 수 있음을 확인하였다[그림 3].
대상 데이터
- 지구온난화로 인해 주요 모기 서식지인 아열대성 지역의 확장에 따라, 모기 매개 감염 바이러스 예방 및 치료 개발 또한 시급해졌다. 본 연구를 통해 1) 공통 백신 바이러스 단백질 선정, 2) 선정 단백질 서열 비교 분석, 3) 상동서열의 에피토프 예측 세 가지 단계를 거쳐 대표적인 플라비바이러스인 지카 바이러스, 뎅기 바이러스, 황열 바이러스, 일본뇌염 바이러스에 공통적으로 적용 가능한 펩타이드 백신 후보(DRGWGNGCGLF)를 선정하였다. 도출된 펩타이드를 활용한다면, 향후 연구를 통해, 4 종의 플라비바이러스 감염 예방에 대처하기 위한 백신이 될 수 있을 것으로 기대된다.
- 적어도 다섯 개 이상의 아미노산이 4종류의 바이러스에서 연속해서 공통적으로 나타나는 공통 백신 후보 서열을 선정하였다. 그 결과 외피단백질 공통 백신 후보로 적합한 펩타이드 서열 3개를 선정하였다[표 1].
- 최근 바이러스의 구조 단백질인 외피단백질(Envelope Protein, E)에 대한 항체가 바이러스의 세포 방출 혹은 감염력 감소의 효과를 나타난다고 보고되었다[2]. 따라서 본 연구에서는 네 종류 바이러스의 공통 백신을 위한 단백질로써 외피 단백질을 선정하였다.
- 적어도 다섯 개 이상의 아미노산이 4종류의 바이러스에서 연속해서 공통적으로 나타나는 공통 백신 후보 서열을 선정하였다. 그 결과 외피단백질 공통 백신 후보로 적합한 펩타이드 서열 3개를 선정하였다[표 1].
- 지카 바이러스, 뎅기 바이러스, 황열 바이러스, 일본뇌염 바이러스의 외피단백질 아미노산 서열 정보는 단백질 정보 DB인 UniProt을 통해 얻었다. 바이러스 외피단백질의 공통 서열을 분석하기 위하여 다중서열비교분석(Multiple alignment)을 진행하였다[그림 2].
데이터처리
- 지카 바이러스, 뎅기 바이러스, 황열 바이러스, 일본뇌염 바이러스의 외피단백질 아미노산 서열 정보는 단백질 정보 DB인 UniProt을 통해 얻었다. 바이러스 외피단백질의 공통 서열을 분석하기 위하여 다중서열비교분석(Multiple alignment)을 진행하였다[그림 2].
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