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특허 상세정보

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Predicting folded structures of proteins

특허상세정보
국가/구분 United States(US) Patent 등록
국제특허분류(IPC7판) G01N-033/00    G06F-015/00   
미국특허분류(USC) 436/086 ; 436/089 ; 364/413.1
출원번호 US-0857224 (1992-03-25)
발명자 / 주소
  • Benner Steven Albert,CHX
인용정보 피인용 횟수 : 20  인용 특허 : 2
초록
▼

A method is presented for predicting the folded structure of proteins that comprises obtaining an alignment of the sequences of a set of homologous proteins, using patterns of conservation and variation of the sequence between proteins with clearly defined evolutionary relationships to assign positions in the alignment to the surface of the folded structure, the inside of the folded structure, active site, or parsing segments, assigning secondary structures by identifying periodicity in said assignments, and then assembling the secondary structural units...

대표
청구항
▼

[ What is claimed is:] [1.] A method for predicting the folded structure of proteins that comprises obtaining an alignment of the sequences of a set of homologous proteins, using patterns of conservation and variation of the sequence between proteins with clearly defined evolutionary relationships to assign positions in the alignment to the surface of the folded structure, the inside of the folded structure, active site, or parsing segments, assigning secondary structural units by identifying periodicity in said assignments, and assembling said secondary...

이 특허에 인용된 특허 (2)

  1. Eisenberg David (Los Angeles CA) Bowie James U. (Culver City CA) Luthy Roland (Los Angeles CA), Method to identify protein sequences that fold into a known three-dimensional structure.
  2. Skolnick Jeffrey (Encinitas CA) Kolinski Andrzej (San Diego CA), System and method for determining three-dimensional structures of proteins.

이 특허를 인용한 특허 (20)

  1. Hoffman, Paul, Chemically-sensitive field effect transistors, systems and methods for manufacturing and using the same.
  2. Hoffman, Paul, Chemically-sensitive field effect transistors, systems, and methods for manufacturing and using the same.
  3. Cheever, Martin A; Disis, Mary L, Compounds for eliciting or enhancing immune reactivity to HER-2/neu protein for prevention or treatment of malignancies in which the HER-2/neu oncogene is associated.
  4. Cheever, Martin A; Disis, Mary L, Compounds for eliciting or enhancing immune reactivity to HER-2/protein for prevention or treatment of malignancies in which the HER-2/oncogene is associated.
  5. Balakrishnan, Raju, Disulphide bond connectivity in protein.
  6. Hoffman, Paul, Graphene FET devices, systems, and methods of using the same for sequencing nucleic acids.
  7. Hoffman, Paul; Lerner, Mitchell; van Rooyen, Pieter, Graphene FET devices, systems, and methods of using the same for sequencing nucleic acids.
  8. van Rooyen, Pieter; Lerner, Mitchell; Hoffman, Paul, Graphene FET devices, systems, and methods of using the same for sequencing nucleic acids.
  9. Cheever, Martin A.; Disis, Mary L., Immune reactivity to HER-2/neu protein for diagnosis and treatment of malignancies in which the HER-2/neu oncogene is associated.
  10. Cheever,Martin A; Disis,Mary L, Immune reactivity to HER-2/neu protein for diagnosis and treatment of malignancies in which the HER-2/neu oncogene is associated.
  11. Cheever, Martin A; Disis, Mary L, Immune reactivity to HER-2/protein for diagnosis and treatment of malignancies in which the HER-2/oncogene is associated.
  12. Gan,Weiniu; Ye,Jane; Di Francesco,Valentina; Beasley,Ellen M., Isolated human kinase proteins, nucleic acid molecules encoding human kinase proteins, and uses thereof.
  13. Johnson,Scott C., Methods for detecting multiple species and subspecies of.
  14. Moser, Michael James, Methods for detection and typing of nucleic acids.
  15. Moser, Michael James, Methods for detection and typing of nucleic acids.
  16. Moser, Michael James, Methods for detection and typing of nucleic acids.
  17. Prudent, James R.; Johnson, Scott C.; Moser, Michael J.; Marshall, David J., Nucleic acid amplification using non-standard bases.
  18. Moser, Michael James; Marshall, David J.; Prudent, James R.; Van Hout, Christopher V.; Larsen, Christine A., Polymerase inhibitor and method of using same.
  19. Moser, Michael James; Marshall, David J.; Prudent, James R.; Van Hout, Cristopher V.; Larsen, Christine A., Polymerase inhibitor and method of using same.
  20. Glaser, Scott; Demarest, Stephen; Miller, Brian Robert; Snyder, William B.; Wu, Xiufeng; Wang, Norman; Croner, Lisa J.; Lugovskoy, Alexey Alexandrovich, Stabilized polypeptide compositions.

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