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NTIS 바로가기주관연구기관 | 중앙대학교 Chung Ang University |
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연구책임자 | 김성권 |
참여연구자 | 김순석 |
보고서유형 | 최종보고서 |
발행국가 | 대한민국 |
언어 | 한국어 |
발행년월 | 2005-10 |
과제시작연도 | 2003 |
주관부처 | 과학기술부 |
과제관리전문기관 | 한국과학재단 Korea Science and Engineering Foundtion |
등록번호 | TRKO200900070460 |
과제고유번호 | 1350014913 |
사업명 | 기초연구지원 |
DB 구축일자 | 2013-04-18 |
키워드 | SNP.Haplotype.생물정보학.알고리즘.유전자.SNP.Haplotype.Bioinformatics.Algorithm.Gene. |
O 대규모 haplotype 추론 시스템의 개발 및 구현
대용량 데이터를 처리하기 위해서 일배체형 재구성 시스템과 tagSNP선택 시스템을 설계할 때 공통적으로 고민했던 부분은 효율적인 메모리 관리였다. 그리고 일배체형 재구성에는 데이터 변환의 성격이 있기 때문에 빠른 처리에 비중을 두었고, tagSNP 선택 시스템은 검색에 필요한 인덱스를 만드는 성격이 있기 때문에 tagSNP의 적합성에 비중을 두었다. 그래서 구현한 두 시스템은 각각 Clark 알고리즘과 엔트로피 개념을 모델로 삼고 생물학적 의미를 부여하기 위하여 노력하
O Development and implementation of haplotype inference system for large set of genotypes
Common problem was an efficient memory management in order to process the large data set when we design for common haplotype reconstruction system and tagSNP selection system. We placed a great deal of impor
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