보고서 정보
주관연구기관 |
한국해양연구원 Korea Ocean Research & Development Institute |
연구책임자 |
김상진
|
참여연구자 |
이정현
,
현정호
,
권개경
,
양성현
,
임재규
,
김은아
,
김윤재
,
변기득
,
배승섭
,
전정호
,
강지현
,
서해점
,
김준태
,
황영옥
,
정홍배
,
이정희
,
박정애
,
우정희
,
이희순
,
이숙영
,
강성균
,
정병철
,
이한기
,
이혁
,
최우식
,
김용호
,
김형권
,
이성아
,
박효정
,
조재창
|
보고서유형 | 최종보고서 |
발행국가 | 대한민국 |
언어 |
한국어
|
발행년월 | 2005-05 |
과제시작연도 |
2003 |
주관부처 |
과학기술부 |
사업 관리 기관 |
한국과학재단 Korea Science and Engineering Foundtion |
등록번호 |
TRKO201000012038 |
과제고유번호 |
1350004443 |
사업명 |
21C프론티어연구개발사업 |
DB 구축일자 |
2013-04-18
|
초록
▼
1. 해양?특수환경, 상호작용 미생물 분리
? 국내 해양탐사 프로그램으로부터 연안시료의 확보;
연안퇴적물, 연안해수, 해양생물체(해면, 산호)
? 국제공동 해양탐사 프로그램을 통하여 대양시료의 확보;
심해퇴적물, 열대 해양생태계, 북극 기지 연안 생물시료,
해양특수환경(냉용수, 열수구) 생물
? 해양미생물, 특수미생물 분리;
종속영양미생물, 극한미생물(저온성, 고온성, 초고온성), 공생미생물
2. 신규/유용 미생물자원 확보 및 등록
? 난배양성 미생물의 순수 분리 및 배양;
농후
1. 해양?특수환경, 상호작용 미생물 분리
? 국내 해양탐사 프로그램으로부터 연안시료의 확보;
연안퇴적물, 연안해수, 해양생물체(해면, 산호)
? 국제공동 해양탐사 프로그램을 통하여 대양시료의 확보;
심해퇴적물, 열대 해양생태계, 북극 기지 연안 생물시료,
해양특수환경(냉용수, 열수구) 생물
? 해양미생물, 특수미생물 분리;
종속영양미생물, 극한미생물(저온성, 고온성, 초고온성), 공생미생물
2. 신규/유용 미생물자원 확보 및 등록
? 난배양성 미생물의 순수 분리 및 배양;
농후 배양법, 선택배지, Extinction 배양법 등을 이용한 신규 미생물의 분리
? 분리된 미생물의 예비동정;
16S rRNA 유전자의 부분적 염기서열 결정
계통분석 및 문(phylum) 수준의 분류적 위치 결정
? 분리된 미생물의 효소 생성능 검색;
리파제, 단백질분해능
? 신규 혹은 유용 미생물의 상세 동정과 등록;
분자계통분석, 생리?생화학적 특성, 형태적 특징
? 해양미생물, 특수미생물 보존
3. 해양 메타게놈 확보 및 분석
? 효율적 메타게놈 추출 및 클로닝 기술 확보;
유기물과 다양성이 높은 퇴적물과 생물체 시료로부터 HMW DNA 추출 및 정제,
포스미드 벡터를 이용한 오페론 크기의 DNA 클론 확보
? 해양환경 메타게놈 라이브러리 구축;
마이크로플레이트와 클론 풀 형태로 라이브러리 구축
? 미생물?메타게놈 자원의 일차 분석;
계통학적 마커 분석, 말단 염기서열 결정, 염기서열 상동성 조사
? 메타게놈 자원의 정보관리
4. 메타게놈 유용성 탐색 및 분석
? 구축된 메타게놈 라이브러리의 유용성 검색;
효소활성(리파제, 프로테아제, 락타마아제)과 색소 생성능 탐색
? 활성 클론의 sub-클로닝 및 활성클론 확보;
플라스미드 분리 및 활성 유전자 검출
? 활성 클론의 염기서열 결정;
활성유전자의 DNA 염기서열 결정 및 상동성 검색
? 활성 유전자의 대량발현 시스템 구축;
pET 벡터를 이용한 발현체계 구축
? 발현된 효소의 특성 분석;
기질특이성, 최적 활성조건, 안전성
Abstract
▼
1.The Objective
Marine ecosystem is closely related with human activity, and consists of various environmental systems including deap sea, arctic and hydrothermal vent. In this respect, microbes living in marine environment are providing the useful tool to study how the microbe adapts itself to t
1.The Objective
Marine ecosystem is closely related with human activity, and consists of various environmental systems including deap sea, arctic and hydrothermal vent. In this respect, microbes living in marine environment are providing the useful tool to study how the microbe adapts itself to the extreme environment, how the symbiont communicates with the host, the distribution and movement of marine microbes, the transfer mechanism of genetic materials. However, the study on marine environment needs a lot of effort due to marine inaccessibility, and the research is only prone to a limited number of people, making the study not very productive. So, to resolve the current problem, the resource library of marine microorganism and metagenome needs to be constructed.
2. Contents
- Investigation and sampling of marine and extreme ecosystems
- Isolation and cultivation of unknown marine microbes
- Access of microbiological and genetical diversity from marine environments by cloning the collective genomes of uncultured prokaryotes
- Evaluation of marine microbiological diversity
- Setting-up high-througput screening system
- Discovery of useful genes from diverse marine ecosystems
- Construction of distrbution system for marine microbial resources
목차 Contents
- 표지 ...1
- 제출문 ...2
- 요약문 ...4
- SUMMARY ...14
- CONTENTS...21
- 목차 ...23
- 제1장 연구개발과제의 개요 ...36
- 제1절 연구 목적 ...36
- 제2절 필요성 ...38
- 1. 경제.산업적 배경 ...38
- 2. 사회.문화적 배경 ...38
- 제3절 범위 ...40
- 제2장 국내외 연구개발 현황 ...44
- 제1절 국외기관 연구동향 ...44
- 1. 미국 ...44
- 2. 일본 ...45
- 3. 유럽 국가 ...46
- 제2절 국내기관 연구동향 ...48
- 제3절 연구 전망 및 연구 수준 평가 ...49
- 제3장 연구개발수행 내용 및 결과 ...52
- 제1절 해양 미생물 분리 분야 ...52
- 1. 해양 미생물 분리 배경 ...52
- 2. 국외 미생물 분리 ...53
- 3. 국내 해양 시료확보 ...83
- 제2절 메타게놈 분야 ...127
- 1. 메타게놈(metagenome)의 배경 ...127
- 2. 강화도 갯벌 시료에서의 메타게놈 구축 ...145
- 3. 남태평양 시료에서의 메타게놈 구축 ...169
- 4. 북극 시료에서의 메타게놈 구축 ...182
- 제3절 메타게놈 응용 분야 ...188
- 1. 연구 목표 ...188
- 2. 연구 방법 ...188
- 3. 연구 결과 ...197
- 제4절 해양미생물 유래의 유용 생물촉매 탐색기술 개발 ...224
- 1. 연구 방법 ...224
- 2. 연구 결과 ...227
- 제5절 Polymerase chain reaction을 이용한 metagenome library 구축 ...243
- 1. 연구 배경 ...243
- 2. 연구 방법 ...243
- 3. 연구 결과 ...249
- 제4장 목표 달성도 및 관연분야에의 기여도 ...252
- 제1절 연구목표 및 연구내용 ...252
- 제2절 연구목표 및 평가착안점에 입각한 연구개발목표 달성도 ...253
- 제3절 연구개발성과 현황 ...257
- 1. 특허 등록 ...257
- 2. 논문게재 및 학술발표 실적 ...258
- 제5장 연구개발결과의 활용계획 ...264
- 제1절 연구개발결과의 대표적 사례 ...264
- 1. 연구개발성과의 질적 우수성 ...264
- 2. 대표적 연구개발성과 ...265
- 3. 기술력 제고 정도 ...265
- 제2절 활용계획 ...266
- 제6장 연구개발과정에서 수집한 해외과학기술정보 ...270
- 제1절 북극 다산기지의 미생물 다양성 확보 ...270
- 제2절 유럽해양생명공학 컨퍼런스 참석 ...270
- 제3절 국제해양생명공학 컨퍼런스 참석 ...272
- 제4절 한.일 해양생명공학 조인트 컨퍼런스 개최 ...274
- 제7장 참 고 문 헌 ...276
- 특정연구개발사업 연구결과 활용계획서 ...288
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