리간드 및 표적 단백질 구조 기반의 분자설계 기법을 활용하여 본 사업단의 선도물질 도출 과제 지원 및 3D-QSAR 및 가상탐색을 위한 프로그램의 개발과 선진 프로그램 도입 및 최적화를 통한 분자설계 기반기술 구축하며, 협동과제인 “B약동력학/독성 예측기술 개발”B과제를 통해 1단계에서 개발된 PreADME 프로그램을 통한 예측 지원, metagenicity, carcinogenicity 및 hERG inhibition 등 독성 관련 예측 모델 개발, bioavailability, volume of distribution, rena
리간드 및 표적 단백질 구조 기반의 분자설계 기법을 활용하여 본 사업단의 선도물질 도출 과제 지원 및 3D-QSAR 및 가상탐색을 위한 프로그램의 개발과 선진 프로그램 도입 및 최적화를 통한 분자설계 기반기술 구축하며, 협동과제인 “B약동력학/독성 예측기술 개발”B과제를 통해 1단계에서 개발된 PreADME 프로그램을 통한 예측 지원, metagenicity, carcinogenicity 및 hERG inhibition 등 독성 관련 예측 모델 개발, bioavailability, volume of distribution, renal excretion, metabolic stability, half-life 등 약동력학 관련 예측 모델 개발, 대사 관련 성질인 P450 3A4, 2D6 저해 모델 개발 등이 이루어졌고, 이 모델들은 모두 사업단 내에 웹 서비스 형태로 설치되어, 원하는 연구자들이 쉽게 접근하여 사용할 수 있는 형태로 제공되었다. (주)이큐스팜은 국내연구 실정에 적합하면서도, 연구자의 경험을 최대한 반영한 가상검색용 프로그램을 21세기 프론티어 연구개발사업 1단계연구에서 자체적으로 개발하였으며, 2단계 연구에서는 이를 이용하여 실제 신약개발 연구를 수행하고자 하였다. 당사가 개발한 가상검색 연구프로그램 ($IDPharmo^{TM}$)을 이용하여 2단계 연구에서는, 생체기능조절물질개발 사업단에서 수행하고 있는 후보물질 창출과제의 하나인 허혈성 질환치료제 개발 연구에 참여하여 후보물질 최적화 및 선도물질 발굴 연구를 수행하였다.
Abstract▼
Molecular Modeling Platform Technologies were established through the construction of modelling technologies by the development of preADME, WeP, FlexSEAL programs and vHTS, which is automatically evaluating enormous databases of compounds at a short time. Molecular modeling studies for Lead Discover
Molecular Modeling Platform Technologies were established through the construction of modelling technologies by the development of preADME, WeP, FlexSEAL programs and vHTS, which is automatically evaluating enormous databases of compounds at a short time. Molecular modeling studies for Lead Discovery & Optimization were carried out by the fine-tuning of lead optimization strategy via SBDD (structure-based drug design) & LBDD (ligand-based drug design), the technology support for drug development via the systematic research network by organization of task force team to support other research projects, and early elimination of hit compounds expected to have the poor in silico ADME/Tox properties. Virtual High throughput screening (vHTS) is one of the most promising tools to reduce the time and cost of drug discovery process. In this project, the binding mode of a series of competitive PARP-1 inhibitors was investigated employing a molecular docking approach by using IDPharmoTM and commercial available docking tools. And also, we were designed for new molecule of PARP-1 inhibitors that most likely act on ischemic stroke. At that same time, we developed an our own chemical library management system, IDPriceTM, that up-to-date information contains almost all commercial available compounds in stock and single non-redundant set of compound with a list of suppliers and supplier-ID for each unique compound. The chemical library management system have several functions which are composed of chemical structure search, real time database update and ordering system. Also, we update for 2D and 3D chemical database, $PharmoLib^{TM}$, which is the current available number of 5.14M compounds. We expect to identify new lead compounds using compound library management system with drug discovery tools $IDPharmo^{TM}$.
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