초록 ▼

III. 연구개발의 내용 및 범위
넙치 유전체 전체를 완전 해독하기 위하여 1) 넙치 고밀도 연관 유전자 지도 작성 2) 상세물리지도 구축을 위한 넙치 유전체를 2배 이상 커버할 수 있는 BAC 클론의 양쪽 말단 염기서열 (BES) 확보 3) 차세대 염기서열 분석기를 이용한 대용량 넙치 유전체 및 유전자 정보 확보 4) 상세물리지도를 바탕으로 한 bridge BAC 클론의 탐색 및 염기 서열 결정 5) rRNA 영역 및 고밀도 반복 염기서열 영역을 확인 및 검증 6) 해독한 유전체 염기서열의 정확도 검증(넙치 전체 유전체의 9

III. 연구개발의 내용 및 범위
넙치 유전체 전체를 완전 해독하기 위하여 1) 넙치 고밀도 연관 유전자 지도 작성 2) 상세물리지도 구축을 위한 넙치 유전체를 2배 이상 커버할 수 있는 BAC 클론의 양쪽 말단 염기서열 (BES) 확보 3) 차세대 염기서열 분석기를 이용한 대용량 넙치 유전체 및 유전자 정보 확보 4) 상세물리지도를 바탕으로 한 bridge BAC 클론의 탐색 및 염기 서열 결정 5) rRNA 영역 및 고밀도 반복 염기서열 영역을 확인 및 검증 6) 해독한 유전체 염기서열의 정확도 검증(넙치 전체 유전체의 95% 이상 물리지도 완성) 7) 유전자 정보 확보와 정보 주석 달기 8) 유전체 정보 활용 강화를 위한 웹 브라우즈 시스템을 구축한다.

Abstract ▼

III. Research outcomes and scope
To complete the full genome sequence for olive flounder, the current project 1) constructed a high-density genetic linkage map, 2) secured both end sequencing of BAC clones, an approach that can cover more than two times of the full genome size of flounder, to con

III. Research outcomes and scope
To complete the full genome sequence for olive flounder, the current project 1) constructed a high-density genetic linkage map, 2) secured both end sequencing of BAC clones, an approach that can cover more than two times of the full genome size of flounder, to construct a high-density physical gene map, 3) generated massive amounts of genomic and transcriptomic information using next generation sequencing technologies, 4) investigated bridge BAC clones and determined sequencing based on the high-density physical map, 5) identified and confirmed rRNA regions and high-density repetitive sequence regions at the genome level, 6) verified accuracy of the structure of the full decoded olive flounder genome, 7) secured full genome sequence information and functional annotation, and 8) constructed a web browser system to enhance the application of full genome sequence information.

목차 Contents

• 표지 ... 1
• 보고서 요약 ... 3
• 요약문 ... 4
• SUMMARY ... 6
• 목차 ... 8
• CONTENTS ... 9
• 그림 목차 ... 10
• FIGURE LISTS ... 12
• 표 목차 ... 14
• TABLE LISTS ... 15
• 제1장 연구개발 과제의 개요 ... 16
• 제1절 목적 및 필요성 ... 16
• 제2절 연구개발 내용 및 범위 ... 16
• 제2장 국내외 기술개발 현황 ... 18
• 제3장 연구개발 수행 내용 및 결과 ... 20
• 제1절 연구개발 수행 내용 ... 20
• 1. 넙치 microsatellite 마커 분리, 특성 및 연관 유전자 지도 작성 ... 20
• 2. 넙치 유전체를 2배 이상 커버할 수 있는 BAC End Sequencing(BES) 정보 확보 ... 20
• 3. 상세 물리지도를 바탕으로 한 bridge BAC 클론의 탐색 및 염기서열 결정 ... 21
• 4. 해독한 유전체 염기서열의 정확도 검증 ... 24
• 5. 성 결정 관련 유전자 영역의 BAC clone 탐색 및 검증 ... 29
• 6. rRNA 영역 및 고밀도 반복염기서열 영역의 확인 및 검증 ... 30
• 제2절 연구개발 수행 결과 ... 33
• 1. 넙치 microsatellite (MS) 마커 분리 및 특성 규명 ... 33
• 2. 넙치 유전체를 2배 이상 커버할 수 있는 BAC End Sequencing(BES) 정보 확보 ... 34
• 3. 상세 물리지도를 바탕으로 한 bridge BAC 클론의 탐색 및 염기서열 결정 ... 35
• 4. 해독한 유전체 염기서열의 정확도 검증 ... 39
• 5. 성 결정 관련 유전자 영역의 BAC clone 탐색 및 검증 ... 58
• 6. rRNA 영역 및 고밀도 반복염기서열 영역을 확인 및 검증 ... 60
• 7. 넙치 유전체정보 활용강화를 위한 웹브라우저시스템 구축 ... 69
• 제4장 목표달성도 및 관련분야에의 기여도 ... 71
• 제1절 목표의 달성도 ... 71
• 제2절 관련분야에의 기여도 ... 72
• 제5장 연구개발결과의 활용계획 ... 75
• 제6장 참고문헌 ... 77