초록 ▼

III. 연구개발의 내용 및 범위
◦ 차세대 바이오 연구 환경 구축 및 서비스
- 가상세포응용시스템 서비스
- 질병관리본부, 아모레 퍼시픽 등 가상세포응용시스템 활용연구 지원
- 차세대 바이오분야 핵심 분석 파이트라인 구축
◦ 비주얼 슈퍼컴퓨팅 기술 개발 적용
- 비주얼 슈퍼컴퓨팅 기술 프로토타입 설계 및 개발
- GLOVE 안정화/최적화 및 서비스
- 핵심기술 시범분야 적용
◦ 국가 슈퍼컴퓨팅 인프라 활용 서비스 기술 개발 및 연구
- 폐르미연구소 CDF 실험 및 KEK Bel

III. 연구개발의 내용 및 범위
◦ 차세대 바이오 연구 환경 구축 및 서비스
- 가상세포응용시스템 서비스
- 질병관리본부, 아모레 퍼시픽 등 가상세포응용시스템 활용연구 지원
- 차세대 바이오분야 핵심 분석 파이트라인 구축
◦ 비주얼 슈퍼컴퓨팅 기술 개발 적용
- 비주얼 슈퍼컴퓨팅 기술 프로토타입 설계 및 개발
- GLOVE 안정화/최적화 및 서비스
- 핵심기술 시범분야 적용
◦ 국가 슈퍼컴퓨팅 인프라 활용 서비스 기술 개발 및 연구
- 폐르미연구소 CDF 실험 및 KEK Belle/Belle- II실험 활용연구
- Belle- II Data Handing 기술개발
- PLSI 기반 대규모 계산처리 프로그램 개발 및 응용활용
- 국제공동 슈퍼컴퓨팅 활용환경 기술개발: EMI-2 배포, Belle II AMGA Manager 제공
- 고에너지물리 포함 슈퍼컴퓨팅 활용 연구를 통한 국제공동연구 수행

Abstract ▼

III. Content and scope of the study
◦ Development and service of cyber biology research environment.
- The insilicoCell system service
- Supporting insilicoCell system application research at Korea centers for disease control and prevention and at Amore pacific.
- Building core analysis

III. Content and scope of the study
◦ Development and service of cyber biology research environment.
- The insilicoCell system service
- Supporting insilicoCell system application research at Korea centers for disease control and prevention and at Amore pacific.
- Building core analysis pipeline on next generation biology
◦ Development application of visual supercomputing technologies
- Design and development of visual supercomputing technobgy prototype
- Stabilizing, optimizing, and providing GLOVE service
- Denonstmtion area application of core technologies
◦ Development and research of national supercomputing infra application service technology
- Application research on CDF experiments at Fermiab and KEK Belle/Belle-II
- Development of Belle-II data handling technology
- Development and application of large scale computation processing program based on PlSI
- Development of international cooperation supercomputing application environment technobgy such as distributing EMI-2 and providing Bello II AMGA Manager.
- International cooperation research through supercomputing application research including high energy physics

목차 Contents

• 표지 ... 1
• 제출문 ... 3
• 보고서 초록 ... 4
• 요약문 ... 5
• Summary ... 8
• Contents ... 12
• 목차 ... 15
• 표차례 ... 18
• 그림차레 ... 20
• 제1장 과제 개요 ... 30
• 제1절 연구목적 및 필요성 ... 30
• 1. 차세대 바이오 연구환경 구축 및 서비스 ... 30
• 2. 비주얼 슈퍼컴퓨팅 기술개발 적용 ... 32
• 3. 국가 슈퍼컴퓨팅 인프라 활용 서비스 기술 개발 및 연구 ... 33
• 제2절 연구내용 및 범위 ... 39
• 1. 차세대 바이오 연구환경 구축 및 서비스 ... 39
• 2. 비주얼 슈퍼컴퓨팅 기술개발 적용 ... 41
• 3. 국가 슈퍼컴퓨팅 인프라 활용 서비스 기술 개발 및 연구 ... 44
• 제3절 추진전략 ... 50
• 1. 차세대 바이오 연구환경 구축 및 서비스 ... 50
• 2. 비주얼 슈퍼컴퓨팅 기술개발 적용 ... 51
• 3. 국가 슈퍼컴퓨팅 인프라 활용 서비스 기술 개발 및 연구 ... 52
• 제2장 국내외 기술개발 현황 분석 ... 56
• 제1절 국내 동향 ... 56
• 1. 차세대 바이오 연구환경 구축 및 서비스 ... 56
• 2. 비주얼 슈퍼컴퓨팅 기술개발 적용 ... 62
• 3. 국가 슈퍼컴퓨팅 인프라 활용 서비스 기술 개발 및 연구 ... 63
• 제2절 해외 동향 ... 69
• 1. 차세대 바이오 연구환경 구축 및 서비스 ... 69
• 2. 비주얼 슈퍼컴퓨팅 기술 개발 및 적용 ... 76
• 3. 국가 슈퍼컴퓨팅 인프라 활용 서비스 기술 개발 및 연구 ... 83
• 제3장 연구개발 수행 및 결과 ... 97
• 제1절 차세대 바이오 연구환경 구축 및 서비스 ... 97
• 1. 서론 ... 97
• 2. NGS분석용 핵심기술개발 ... 99
• 3. 슈퍼컴퓨팅기반 신호전달 네트워크 구축 ... 110
• 4. 가상세포 응용시스템구축 및 서비스 ... 137
• 제2절 비주얼 슈퍼컴퓨팅 기술 개발 및 적용 ... 156
• 1. 비주얼 슈퍼컴퓨팅 프로토타입 설계 및 기술 개발 ... 156
• 2. GLOVE 안정화 및 최적화 ... 180
• 3. 핵심기술 시범 분야 적용 ... 216
• 제3절 국가 슈퍼컴퓨팅 인프라 활용 서비스 기술 개발 및 연구 ... 222
• 1. 대규모 계산처리 기술 개발 ... 222
• 2. 그리드 메타데이터 카달로그 기술 개발 ... 287
• 3. 고에너지물리 연구 환경 개발 및 활용 연구 ... 313
• 4. 슈퍼컴퓨팅 활용 기술 및 응용 연구 ... 334
• 제4절 국제 협력 ... 354
• 1. 환태평양지역(PRAGMA) 활동 ... 354
• 2. 고에너지물리분야 국제협력 ... 354
• 제4장 결론 ... 361
• 제1절 기대 효과 ... 361
• 1. 차세대 바이오컴퓨팅 기술 개발 ... 361
• 2. 비주얼 슈퍼컴퓨팅 기술개발 및 적용 ... 361
• 3. 국가 슈퍼컴퓨팅 인프라 활용 서비스 기술 개발 및 연구 ... 362
• 제2절 활용 방안 ... 365
• 1. 차세대 바이오 연구환경 구축 및 서비스 ... 365
• 2. 비주얼 슈퍼컴퓨팅 기술개발 및 적용 ... 365
• 3. 국가 슈퍼컴퓨팅 인프라 활용 서비스 기술개발 및 연구 ... 365
• 참고문헌 ... 367
• <부록> 연구논문 및 지재권 실적 ... 379
• 끝페이지 ... 391