본 연구보고서는 국내 바이오연구개발에 필수적인 국내외 유전자변형마우스(GEM) 활용/공유 기반구축 및 운용을 목표로 1) GEM(gene-targeting 및 gene-trap 기반) 제작기반 구축 및 생산, 2) GEM 보존, 품질관리 기반구축 및 지원, 3) GEM 표현형분석, 정보 기반구축 및 운용, 4) GEM 자원, 표준화, 표현형, 정보 국제공유 기반구축 및 운용을 내용으로 총 2단계 6년 중 1단계 3년의 수행결과를 정리한 것임. 구체적 사업수행 내용은 다음과 같음. ○ 국내 GEM 제작 기반구축 및 생산 -
본 연구보고서는 국내 바이오연구개발에 필수적인 국내외 유전자변형마우스(GEM) 활용/공유 기반구축 및 운용을 목표로 1) GEM(gene-targeting 및 gene-trap 기반) 제작기반 구축 및 생산, 2) GEM 보존, 품질관리 기반구축 및 지원, 3) GEM 표현형분석, 정보 기반구축 및 운용, 4) GEM 자원, 표준화, 표현형, 정보 국제공유 기반구축 및 운용을 내용으로 총 2단계 6년 중 1단계 3년의 수행결과를 정리한 것임. 구체적 사업수행 내용은 다음과 같음. ○ 국내 GEM 제작 기반구축 및 생산 - Gene-targeting 기반 GEM 제작 기반구축 및 생산 - Gene-trap 기반 GEM 제작 기반구축 및 생산 ○ GEM 자원 및 품질관리 체계구축 및 지원 - GEM 보존, 표준화, 품질관리, 공급체계 구축 및 지원 ○ 유용유전자의 in vivo 기능규명을 위한 표현형분석 기반구축 - 기본표현형분석 파이프라인 구축 및 심층표현형 분석 core-lab 구축 ○ GEM마우스 정보 DB구축 - 국제표준 표현형정보 DB 구축 ○ GEM 국제교류 - GEM 자원, 표준화, 표현형분석, 정보 국제공유 기반 구축
Abstract▼
Ⅳ. Results Contents Results Production of domestic GEM and establishment of infrastructure for GEM Part 1 - Chimera (4 genes) using mutant ES cell clones, Tg (5 genes) - Establishment of techniques to produce GEM with high quality-low cost utilizing 2i midia and aggregation method
Ⅳ. Results Contents Results Production of domestic GEM and establishment of infrastructure for GEM Part 1 - Chimera (4 genes) using mutant ES cell clones, Tg (5 genes) - Establishment of techniques to produce GEM with high quality-low cost utilizing 2i midia and aggregation method Part 2 - KO mouse: completion (15 strains), on-going (6 strains), suspension (5 strains); total 26 strains - Tg mouse: completion (19 strains), on-going (5 strains); total 24 strains - Establishment of TALEN-mediated gene-targeting technique - Production of mouse utilizing RNA-guided genome editing technique Part 3 - Gene trap mouse (3 strains), conventional KO mouse (3 strains), conditional KO (3 strains), conditional KI (1 strains); total 14 GEM strains Establishment and support of quality control of GEM resources Part 1 - Preservation of domestic GEM resources (14 strains) - Establishment of IKMC (KOMP) stem cell lines (6 genes) and mouse (2 strains) - Cryopreservation of GEM resources (115 strains; international) - Establishment of culture condition for IKMC mouse embryo stem cells - Establishment of GEM genotyping using SNPs (12 SNPs , 28 SNPs, and 96 SNPs) - Establishment of GEM genotyping using SNPs for analysis of stains (SNPs 12 variants) - Disease monitoring on domestic GEM (3,238 mice from 164 facilities) by health monitoring - Cleaning of infected animals (58 strains) Part 2 - Cryopreservation of sperms (132 cases), thaw and implantation of fertilized eggs (86 cases) - Provision of GEM (Tg 105 cases, KO 106 cases) Establishment of infrastructure for GEM phenotyping to identify the function of target genes in vivo Part 1 - Establishment of facilities and instruments based on the criteria of international consortium (basic phenotyping 22 items suggested by EUMODIC or IMPC) - Establishment of SOP for GEM phenotyping and translation the SOP to Korean (suggested by EUMODIC or IMPC) (Part1: attachment 1 and 2) - Performance of basic phenotyping (recommendation from EUMODIC or IMPC) for mouse 6 stains Part 2 - Establishment of networking for advanced phenotyping Part 3 -Management of histopathologic lab for mouse cancer phenotyping Part 3 -Establishment of phenotyping system for activity, metabolic and sensory systems in mouse Establishment of DB for GEM resources Part 1 - Establishment of KGEMC website ㆍRegistration of domestic GEM resources and DB search /open SOP (GEM phenotyping platform; 20 protocols) for the pubilc on the website - Establishment of DB for GEM resources (preperation for IMPC) ㆍIntroducing system of MRC Harwell (England) International exchange of GEM resources (techniques/information) Part 1, 2, 3, 4 - Visiting IMPC facilities (3 times) - Attending EU Infrfrontier I3 meeting (once) - Consulting with MRC Harwell for introduction of LIMS (once) - Attending IMPC meeting (5 times) - Attending KOMP2 meeting (once) - Attending AMPC meeting (4 times) - Attending AMMRA conference (4 times) - Technical training from RIKRN JMC (4 times) - Consulting with TMC (once) - Hosting international symposium - Attendance at AMPC workshop (Nanjing): Analysis of sense organs of GEM resources (once) - Attendance at TCP workshop (once) - Attendance at Jackson Laboratory workshop (once) - Hosting KRIBB-CIEA joint meeting (twice) - Visiting Taiwan Mouse Clinic (once) - Attending AFLAS (once) - Attending Mouse Genetics Meeting (once) - Attending AMPC/AMMRA conference (4 times) - Attending IMPC meeting (once) - Attending NLAC rodent patho-phenotying worksop (Taiwan) (once) - Attending RIKEN Symposium (once) - Hosting GEM phenotying human resources workshop (once)
목차 Contents
표지 ... 1
제 출 문 ... 2
보고서 요약서 ... 3
요 약 문 ... 4
SUMMARY ... 7
CONTENTS ... 10
목 차 ... 11
제1장 연구개발과제의 개요 ... 13
제2장 국내외 기술개발 현황 ... 16
1. 국제현황 ... 16
2. 국내현황 ... 19
제3장 연구개발수행 내용 및 결과 ... 22
제1절 1단계 3년 연구개발 결과 종합 요약표 ... 22
제2절 국내 GEM 제작 기반구축 및 생산 ... 23
제3절 GEM 자원 및 품질관리 체계구축 및 지원 ... 105
제4절 유용유전자의 in vivo 기능규명을 위한 표현형분석 기반구축 ... 145
제5절 GEM마우스 정보 DB구축 ... 298
제6절 GEM 국제교류 ... 309
제4장 목표달성도 및 관련분야에의 기여도 ... 320
(1) 연구개발의 최종목표 ... 320
(2) 연차별 연구개발 목표 및 내용 ... 320
(3) 계획대비 달성도 ... 322
(4) 위 연구목표(총연구기간)에서 중요도 순으로 4∼5개 목표 추출 및 가중치 부여 ... 323
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