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한우 유전체 정보를 활용한 육질관련 DNA chip 및 산업화 시스템 개발
Development of DNA chip and industrialized system associated with meat quality of Korean cattle using bovine genome information 원문보기

보고서 정보
주관연구기관 (주)에스엔피제네틱스
보고서유형최종보고서
발행국가대한민국
언어 한국어
발행년월2007-12
과제시작연도 2007
주관부처 농림부
Ministry of Agriculture and Forestry
과제관리전문기관 농림기술관리센터
Agricultural Research & development Promotion Center
등록번호 TRKO201400022910
과제고유번호 1385006847
사업명 농림기술개발
DB 구축일자 2014-11-10

초록

○ 연구결과
한우 육질관련 유전자 21개에서 SNP 535개를 발굴하고, DB SNP 3,072개를 선정하여 한우 437두에서 genotyping하였으며, 통계분석을 통하여 한우 육질관련 DNA chip contents를 대량 발굴하였음. 생물 정보학을 이용하여 대량의 SNP 탐지 기술을 개발하였으며 탐지기법의 정교화함. 또한 단백질 도메인 특이적 SNP 패턴 추출 기법 개발 및 육질 지방대사관련 유전자의 SNP변이에 따른 단백질 구조변화를 모델링하고 육질 관련 QTL 영역 내의 SNP를 추출함

Abstract

In the study, we will obtain a useful gene contents through a functional analysis by bioimformatics against candidate genes in relating with adipose or muscle cell differentiation. And then, we will construct a Hanwoo specific SNP database after obtain Hanwoo specific SNP informations by genetic ma

목차 Contents

  • 제출문 ... 1
  • 요약문 ... 2
  • SUMMARY ... 3
  • CONTENTS ... 4
  • 목차 ... 6
  • 제1장. 연구개발과제의 개요 ... 8
  • 제1절 한우 육질관련 DNA chip contents 개발 (제1세부) ... 8
  • 1. 연구개발의 필요성 ... 8
  • 2. 목적 ... 9
  • 제2절 생물정보학을 이용한 육질관련 SNP의 탐색 (제1협동) ... 10
  • 1. 연구개발의 필요성 및 목적 ... 10
  • 제3절 연구목표 ... 11
  • 제4절 추진내용 ... 11
  • 제2장. 국내외 기술개발 현황 ... 12
  • 1. 국외현황 ... 12
  • 2. 국내현황 ... 12
  • 제3장. 연구개발수행 및 결과 ... 13
  • 제1절 한우 육질관련 DNA chip contents 개발 (제1세부) ... 13
  • 1. 연구수행 내용 ... 13
  • 2. 연구결과 ... 20
  • 가. 대표연구성과(논문 및 특허) ... 20
  • 1) 발표논문 목록 ... 20
  • 2) 특허출원 목록 ... 20
  • 3) 발표논문 요약 ... 21
  • 나. Sequence Variants Discovery 및 genotyping 분석결과 목록 ... 36
  • 다. 육질관련 후보유전자 Sequence Variants Discovery 결과 ... 37
  • 라. 육질관련 SNP 발굴 유전자 genotyping 및 통계분석 결과 ... 70
  • 마. DB SNP를 이용한 근내지방도(marbling score) 관련 SNP 대량 발굴 결과 ... 97
  • 제2절 생물정보학을 이용한 육질관련 SNP의 탐색 (제1협동) ... 102
  • 1. 연구내용 ... 102
  • 가. 대량 SNP 탐지 ... 102
  • 나. 단백질 도메인 특이적 SNP 패턴 추출 ... 103
  • 다. 육질 지방대사관련 유전자의 SNP변이에 따른 단백질 구조변화 모델링 ... 104
  • 라. 소의 SNP 탐지기법 정교화 ... 105
  • 마. 육질 관련 QTL 영역 내의 SNP추출 ... 106
  • 2. 연구결과 ... 107
  • 가. 육질 관련 QTL 영역 내의 SNP 후보 ... 107
  • 나. cSNPer : EST에 생기는 SNP의 종류 판별 ... 108
  • 다. BtSNPdb : 소의 QTL 중심의 인터페이스에 기반한 SNP 데이터베이스 ... 110
  • 라. 구조 모델링에 근거한 nsSNP의 annotation ... 112
  • 제4장. 목표달성도 및 관련분야에의 기여도 ... 115
  • 제5장. 연구개발결과의 활용계획 ... 115
  • 제6장. 연구개발과정에서 수집한 해외과학기술정보 ... 117
  • 제7장. 참고문헌 ... 118
  • 끝페이지 ... 121

연구자의 다른 보고서 :

참고문헌 (25)

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