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대용량 생물학적 네트워크 분석 기술 연구

(Research of Big Data Analysis for Biological Networks)

보고서 정보
주관연구기관 KAIST
연구책임자 강유
참여연구자 임용섭 , 김민주 , 박하명 , 전병수 , 정진홍 , Jaya Thomas , 유인재 , 이슬
보고서유형최종보고서
발행국가대한민국
언어 한국어
발행년월2015-08
주관부처 미래창조과학부
KA
사업 관리 기관 한국과학기술정보연구원
Korea Institute of Science and Technology Information
등록번호 TRKO201600000584
DB 구축일자 2016-04-16
키워드 생물학 네트워크,군집화,매칭,병렬 알고리즘Bio network,clustering,matching,parallel algorithm

초록

대용량 생물학적 네트워크 분석을 위한 두 가지 핵심 기술 연구
생물학 네트워크 클러스터링
- 실세계 네트워크 특성을 반영해서 더 좋은 클러스터링 기술 개발
* 멱함수 차수 분포를 이용한 빠르고 효과적인 그래프 coarsening 기술 개발
* 클러스터 단편화 문제 해결, 적당한 크기의 클러스터를 많이 생성
- 알고리즘 병렬화를 통해 수행 속도 향상
* CSC 포맷 행렬의 곱셈에 대한 효율적인 병렬화
* 쓰레드 개수를 늘림에 따라 효과적으로 수행 속도 감소
생물학 네트워크 매칭
- 실세

Abstract

Ⅳ. Result of the study
Network Clustering: Our proposed methods resolve the two main problems in MCL and its variations. First, ours resolves the cluster fragmentation problem, i.e. the number of clusters of a extremely small size is reduced (problem in MCL and B-MCL). Second, ours does not make

목차 Contents

  • 표지 ... 1
  • 제출문 ... 2
  • 보고서 요약서 ... 3
  • 요약문 ... 4
  • Summary ... 7
  • Contents ... 10
  • 목차 ... 11
  • 표(그림)목차 ... 12
  • 제1장 연구개발과제의 개요 ... 16
  • 제1절 생물학 네트워크 클러스터링 ... 16
  • 제2절 생물학 네트워크 매칭 ... 17
  • 제2장 국내외 기술개발 현황 ... 19
  • 제1절 생물학 네트워크 클러스터링 ... 19
  • 제2절 생물학 네트워크 매칭 ... 29
  • 제3장 연구개발수행 내용 및 결과 ... 31
  • 제1절 생물학 네트워크 클러스터링 ... 31
  • 제2절 생물학 네트워크 매칭 ... 43
  • 제4장 목표달성도 및 관련분야에의 기여도 ... 58
  • 제1절 생물학 네트워크 클러스터링 ... 58
  • 제2절 생물학 네트워크 매칭 ... 58
  • 제5장 연구개발결과의 활용계획 ... 60
  • 제1절 생물학 네트워크 클러스터 활용계획 ... 60
  • 제2절 생물학 네트워크 매칭 활용계획 ... 61
  • 제6장 연구개발과정에서 수집한 해외과학기술정보 ... 62
  • 제1절 멱법칙 차수 분포 그래프를 위한 METIS ... 62
  • 제2절 Symmetry-braking에 기반한 subgraph enumeration ... 62
  • 제3절 뇌질환 생물학 네트워크 분석에의 활용 사례 ... 62
  • 제4절 뇌질환 브레인 네트워크 분석에의 활용 사례 ... 64
  • 제7장 참고문헌 ... 66
  • 끝페이지 ... 67

표/그림 (41)

연구자의 다른 보고서 :

참고문헌 (25)

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