초록 ▼

○ 연구목표
- 제2형 당뇨병에 대한 유전 효과를 평가할 수 있는 분류 기준 수립
- 기능 검증을 위한 유전변이를 선별 및 임상적용 기반자료를 확보
- 상기 결과를 공개함으로써 궁극적으로 한국형 EGAPP를 구현

○ 연구내용 및 범위
1) 전장유전체연관분석을 통해 발굴된 제2형 당뇨 연관 유전변이 정보 수집 및 정리
- GWAS catalog, OMIM, GAD 등 공개 데이터베이스(DB) 정보 통합 및 제2형 당뇨 연관 유전변이 정보 추출
- 유전좌위(locus), 형질, 분석대상자 정

○ 연구목표
- 제2형 당뇨병에 대한 유전 효과를 평가할 수 있는 분류 기준 수립
- 기능 검증을 위한 유전변이를 선별 및 임상적용 기반자료를 확보
- 상기 결과를 공개함으로써 궁극적으로 한국형 EGAPP를 구현

○ 연구내용 및 범위
1) 전장유전체연관분석을 통해 발굴된 제2형 당뇨 연관 유전변이 정보 수집 및 정리
- GWAS catalog, OMIM, GAD 등 공개 데이터베이스(DB) 정보 통합 및 제2형 당뇨 연관 유전변이 정보 추출
- 유전좌위(locus), 형질, 분석대상자 정보(인종, 표본수), 연구설계(candidate approach, genome-wide approach 등), 분석도구(Affymetrix, Illumina 등), 검증연구 여부, 유전적 효과(유의수준, OR) 등에 따라 체계적으로 분류 및 정리

2) 한국인을 대상으로 제2형 당뇨병 연관 유전변이 재검증
- 한국인칩 데이터를 활용하여 제2형 당뇨병 및 관련 형질 통계 분석
- 공개DB 결과와 비교·분석 및 유전적 효과 검증
- 검증된 결과를 기반으로 다음과 같은 형태로 세부 분류
∙ 검증 완료(유전적 효과 있음, 유전적 효과의 인종 간 차이 명시)
∙ 미검증 (유전적 효과 없음, 인종간 유전체 구조적 차이 세부 정보 등 명시)
∙ 미검증 (통계 검정력 부족, 요구되는 최소 샘플 수 등 세부 정보 명시)
- GERP(Genomic Evolutionary Rate Profiling) conservation score, ENCODE 등의 정보를 활용한 annotation 분석을 수행하여 관련 생물학적 기능 정리 및 기능 검증을 위한 우선순위 부여
- 분석결과 DB화 및 기 구축 데이터베이스를 통해 공개

3) 한국형 EGAPP 제안
- 국내·외 유전변이 정보 공개 DB 현황 조사 및 DB 형태(포맷) 정리
- 한국형 EGAPP 또는 GWAS catalog 형태 제안

○ 기대효과 및 활용방안
- 한국인에 특이적으로 영향을 미치는 유전변이 정보 확보를 통해 질환연구 기반자료로 활용
- 유전자 기능에 직접적인 영향을 미치는 유전변이를 선별함으로써 기능실험을 통한 질병원인 규명에 활용
- 구축된 유전체 근거 지식 정보는 향후 임상적용을 위한 정보로 활용

( 출처 : 요약서 )

목차 Contents

• 표지 ... 1
• 연구최종보고서 ... 2
• 내부연구과제 요약서 ... 3
• 내부연구과제 연구결과 요약서 ... 4
• 목차 ... 5
• 제1장 연구의 목적 및 필요성 ... 6
• (1) 연구의 목적 ... 6
• (2) 연구의 배경 ... 7
• (3) 연구 필요성 ... 12
• 제2장 연구의 연구목표 및 달성도, 관련 분야에의 기여도 ... 13
• 제3장 국내·외 기술개발 현황 ... 14
• (1) 한국인, 아시아 인종에 대한 연구결과 부족 ... 14
• (2) 발굴된 유전변이에 대한 생물학적 연관성 부족 ... 15
• (3) 오류: Publication bias, selective outcome reporting ... 16
• (4) 통계적 검정력 부족으로 인한 위양성 가능성 ... 17
• 제4장 연구 내용 및 결과 ... 18
• (1) 연구내용 및 방법 ... 18
• (2) 한국인을 대상으로 제2형 당뇨병 연관 유전변이 재검증 ... 21
• (3) 한국형 GWAS catalog 또는 EGAPP 기반 자료 구축 ... 27
• (2) 연구 결과 ... 29
• 제5장 연구개발결과의 활용계획 ... 44
• 제6장 주요 연구 성과 ... 45
• 제7장 기대성과 ... 46
• 제8장 주요 연구 변경사항 ... 47
• 제9장 연구비 집행 실적 내역 ... 48
• 제10장 참여연구원 ... 49
• 제11장 참고문헌 ... 50
• 제12장 첨부문서 ... 56
• 끝페이지 ... 61