보고서 정보
주관연구기관 |
(주)마크로젠 |
연구책임자 |
인용호
|
참여연구자 |
오승현
,
이응룡
,
백규흠
,
정정희
,
이형일
,
박유미
,
곽윤호
|
보고서유형 | 최종보고서 |
발행국가 | 대한민국 |
언어 |
한국어
|
발행년월 | 2016-07 |
과제시작연도 |
2015 |
주관부처 |
보건복지부 [Ministry of Health & Welfare(MW)(MW) |
등록번호 |
TRKO201700005013 |
과제고유번호 |
1465019429 |
사업명 |
한국인유전체분석기반연구 |
DB 구축일자 |
2017-09-20
|
키워드 |
멀티오믹스.차세대염기서열분석법.에피유전체.Multi-omics.Next generation sequencing.Epigenome.
|
DOI |
https://doi.org/10.23000/TRKO201700005013 |
초록
▼
1. 연구 개발 목표
당뇨 관련 표적 세포(췌장, 지방, 신장 세포) 인체유래물 19종에 대해 Whole genome bisulfite sequencing, ChIP sequencing, RNA sequencing, Small RNA sequencing 및 당뇨 연관시료 400건에 대한 Infinium 450K chip을 시행하여 멀티오믹스 데이터를 생산하여 국제에피유전체컨소시엄(IHEC)기준에 맞게 분석 파이프라인을 구축하고 에피유전체 연구자 중심의 분석 효율성 증대를 위해 DB-연동 분석 파이프라인 보조 툴을 개발함.
1. 연구 개발 목표
당뇨 관련 표적 세포(췌장, 지방, 신장 세포) 인체유래물 19종에 대해 Whole genome bisulfite sequencing, ChIP sequencing, RNA sequencing, Small RNA sequencing 및 당뇨 연관시료 400건에 대한 Infinium 450K chip을 시행하여 멀티오믹스 데이터를 생산하여 국제에피유전체컨소시엄(IHEC)기준에 맞게 분석 파이프라인을 구축하고 에피유전체 연구자 중심의 분석 효율성 증대를 위해 DB-연동 분석 파이프라인 보조 툴을 개발함.
2. 연구 개발 내용
○ 기 확보된 당뇨 관련(췌장, 지방, 신장 세포) 조직 등의 인체유래물 1,000건을 대상으로 멀티오믹스 데이터 생산을 위한 DNA 시료 추출 예정임.
○ 당뇨 관련 (췌장, 지방, 신장 세포) 인체유래물 (DNA, RNA, ChIP-Sequencing용 DNA fragment) 19종과 당뇨 연관 샘플 (DNA) 400건을 대상으로 멀티오믹스 정보생산 예정임. (멀티오믹스: 1. WGBS, 2. ChIP-Sequencing, 3. RNA-Sequencing, 4. Small RNA-Sequencing 이상 각 19건, 5. Infinium 450k Chip 400건)
3. 연구 개발 성과 및 활용 방안
○ 당뇨 및 비만 등의 만성 복합질환 환자의 임상 네트워크 구축, 대규모 시료 확보를 통한 연구 기반구축 및 연관된 유전체 또는 에피유전체 연구가 활성화됨.
○ 본 사업을 통해 생산된 당뇨 관련 표적 세포의 멀티오믹스 데이터를 국제에피유전체컨소시엄 (IHEC) 기준에 맞게 분석 파이프라인 구축을 완료하였으므로 국내 연구자들에게 만성 복합질환의 원인, 치료 효과, 치료 결과 등에 관여하는 에피유전체의 데이터 공유와 활용을 원활하게 함.
( 출처 : 요약문 )
Abstract
▼
1. Purpose for Research & Development
Multi-omics data and analysis pipeline will be developed via whole genome bisulfite sequencing (WGBS), ChIP sequencing, RNA sequencing, Small RNA sequencing for 19 different human specimens obtained from diabetes-related target cells (pancreatic, fat, kidney
1. Purpose for Research & Development
Multi-omics data and analysis pipeline will be developed via whole genome bisulfite sequencing (WGBS), ChIP sequencing, RNA sequencing, Small RNA sequencing for 19 different human specimens obtained from diabetes-related target cells (pancreatic, fat, kidney cells), and Infinium 450K chip for 400 diabetes-related RNA samples according to the IHEC guideline. This will contribute to increase the efficiency for epigenomics research.
2. Contents
○ 1000 human DNA samples from diabetes-related tissues (pancreatic, fat, kidney cells) will be extracted for multi-omics data development.
○ Multi-omics data will be developed via WGBS, ChIP-Seq, RNA-Seq, and Small RNA-Seq from 19 diabetes-related human samples (DNA, RNA, DNA fragment for ChIP-Seq) and via Inifinium 450k Chip from 400 diabetes-related DNA samples.
3. Potential Achievement & Application of Research
○ Clinical network development for chronic complex disease (such as diabetes or obesity) patients, large-scale securement of samples, and genomics and epigenomics research promotion can be expected.
○ By developing the multi-omics data for diabetes-related chronic complex disease according to IHEC guideline, researchers will readily share and utilize epigenomic data for their research.
( 출처 : SUMMARY )
목차 Contents
- 표지 ... 1
- 제출문 ... 2
- 목차 ... 3
- 요약문 ... 4
- Summary ... 5
- 학술연구개발용역과제연구결과 ... 6
- 제1장 최종 목표 ... 6
- 제2장 국내외 기술 현황 ... 16
- 제3장 최종 연구 내용 및 방법 ... 25
- 제4장 최종 연구 결과 ... 60
- 제5장 연구결과 고찰 및 결론 ... 143
- 제6장 연구성과 및 활용계획 ... 145
- 제7장 연구용역과제 진행과정에서 수집한 해외과학기술정보 ... 147
- 제8장 기타 중요변경사항 ... 148
- 제9장 연구비 사용 내역 및 연구원 분담표 ... 149
- 제10장 참고문헌 ... 151
- 제11장 첨부서류 ... 154
- 끝페이지 ... 156
※ AI-Helper는 부적절한 답변을 할 수 있습니다.