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NTIS 바로가기주관연구기관 | 연세대학교 Yonsei University |
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연구책임자 | 김가경 |
보고서유형 | 최종보고서 |
발행국가 | 대한민국 |
언어 | 한국어 |
발행년월 | 2016-11 |
과제시작연도 | 2015 |
주관부처 | 과학기술정보통신부 Ministry of Science and ICT |
등록번호 | TRKO201800006658 |
과제고유번호 | 1345239323 |
사업명 | 이공학개인기초연구지원 |
DB 구축일자 | 2018-05-12 |
키워드 | 정밀의료.질병 유발 유전체 변이.논코딩 지역.마이크로RNA 표적체.축배열 법칙.유전체.전사체.후성유전체.네트워크 분석.유전병.가계도.Precision medicine.disease-causing genetic variation.non-coding region.microRNA target sites.pivot pairing rule.genomics.transcriptomics.epigenomics.network analysis.genetic disease.pedigree. |
DOI | https://doi.org/10.23000/TRKO201800006658 |
과제 1차년 도에는 다양한 마이크로RNA 배열법칙에 따라 Ago HITS-CLIP 실험 데이터 또는 모든 유전자의 3‘UTR에 위치한 마이크로RNA 표적 위치를 찾아내는 miRTCat 데이터베이스 (Kim 등, bioinformatics, 2013)를 업데이트 하였으며 새로운 버전에서는 마이크로RNA 표적 위치에 관련된 변이와 질병 관련 정보 및 링크를 제공하였음 (2015년 동계 유전체 학회 포스터 발표). 이를 통해 질병 관련 유전체 변이와 마이크로RNA 데이터의 관련성 분석 플랫폼 구축의 기반을 다질 수 있었음.
We previously implement miRTCat based on the established principles: sequence complementarity and evolutional conservation. miRTCat provides comprehensive maps searchable for microRNA target sites, of which locations are not only predicted in all 3’ untranslated regions (3’UTRs; annotated by RefSeq
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