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과제명 | 대용량 유전자 시그너쳐 기반의 조절 네트워크, pathway 및 약물유전체 통합분석 시스템 개발 |
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주관연구기관 |
한국생명공학연구원 Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology |
연구책임자 | 김선영 |
참여연구자 | 남덕우 |
보고서유형 | 최종보고서 |
발행국가 | 대한민국 |
언어 | 한국어 |
발행년월 | 2018-06 |
과제시작년도 | 2017 |
주관부처 | 과학기술정보통신부 Ministry of Science and ICT |
등록번호 | TRKO201800042580 |
과제고유번호 | 1711058674 |
사업명 | 포스트게놈신산업육성을위한다부처유전체사업(미래부) |
DB 구축일자 | 2018-10-13 |
키워드 | 유전자 시그너쳐.네트워크 모듈.pathway 분석.바이클러스터링.약물유전체.gene signature.network module.pathway analysis.bi-clustering.pharmacogenomics. |
○ 연구의 목적 및 내용
대량의 유전자 발현 변화(시그너쳐), 약물반응 데이터 및, 다양한 pathway 데이터를 기반으로 네트워크 구성, 전사 조절 네트워크 모듈, pathway,질병-약물-유전체 네트워크 및 단백질 상호작용 ...
○ 연구의 목적 및 내용
대량의 유전자 발현 변화(시그너쳐), 약물반응 데이터 및, 다양한 pathway 데이터를 기반으로 네트워크 구성, 전사 조절 네트워크 모듈, pathway,질병-약물-유전체 네트워크 및 단백질 상호작용 등을 모두 분석할 수 있는 통합 분석시스템을 구축하고, 수요자 맞춤형 서비스를 제공함
○ 연구개발성과
▪ 유전자 발현 변화(시그너쳐) 데이터의 지속적인 수집, 정리를 통한 데이터 확대
▪ 암 유전자 발현 데이터베이스의 업데이트, 새로운 검색 기능 및 시각화 기능 제공(GENT DB => GENT 2 DB)
▪ 그래프데이터베이스를 바탕으로 한 약물-유전자 네트워크 분석 웹 서버 개발
▪ Gene-set 클러스터링 및 네트워크 시각화 분석 알고리즘 개발(GSAcluster).
▪ GWAS pathway 분석 알고리즘 및 소프트웨어 개발 (GSA-SNP2)
▪ 세포 조건별 전사조절 네트워크 예측 시스템 구축
▪ Genome-wide siRNA, sgRNA 등 유전체 수준의 스크리닝 데이터인 barcode-seq을 분석할 수 있는 분석 파이프라인 개발 및 제공
○ 연구개발성과의 활용계획(기대효과)
▪ 다양한 네트워크 및 pathway 분석 기능을 제공함으로써 다부처 유전체 사업에서 생산되는 대용량 데이터들로부터 생물학적 의미를 찾을 수 있도록 함
▪ 다양한 세포조건에서 조건 특이적인 조절 네트워크를 입체적으로 분석할 수있고, 조건 특이적인 pathway의 변화, 유전자 리스트(약물반응)와 유사한 세포조건 등을 연결시키는 등 동일한 시스템 내의 복합적인 분석이 가능함.
▪ 새로운 조절 타겟 및 관련된 질병의 기작의 이해 확대 및 drug repositioning 등의 응용 연구에 폭넓게 활용 가능함
( 출처: 요약문 4p )
참여 연구원 | 남덕우, |
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대용량 유전자 시그너쳐 기반의 조절 네트워크, pathway 및 약물유전체 통합분석 시스템 개발
주관연구기관 : 한국생명공학연구원
Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology
책임연구자 :
김선영
발행년월 : 2018-06
보고서 내 다른 이미지
과제명(ProjectTitle) : | - |
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연구책임자(Manager) : | - |
과제기간(DetailSeriesProject) : | - |
총연구비 (DetailSeriesProject) : | - |
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과제수행기간(LeadAgency) : | - |
연구목표(Goal) : | - |
연구내용(Abstract) : | - |
기대효과(Effect) : | - |
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구성항목 |
관리번호, 제목(한글), 저자명(한글), 발행일자, 전자원문, 초록(한글), 초록(영문)
관리번호, 제목(한글), 제목(영문), 저자명(한글), 저자명(영문), 주관연구기관(한글), 주관연구기관(영문), 발행일자, 총페이지수, 주관부처명, 과제시작일, 보고서번호, 과제종료일, 주제분류, 키워드(한글), 전자원문, 키워드(영문), 입수제어번호, 초록(한글), 초록(영문), 목차
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