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차세대 감염병 대응기술 확보를 위한 세균성이질균의 SNP 분자역학시험 개발

Development of SNPs for the introduction of next-generation molecular epidemiology method of Shigella sonnei

보고서 정보
주관연구기관 질병관리본부
Korea Center for Diease Control and Prevention
연구책임자 김준영
참여연구자 김수진 , 박정선 , 신은경 , 박애경 , 정현주 , 전정훈 , 황규잠 , 김대원
보고서유형최종보고서
발행국가대한민국
언어 한국어
발행년월2019-01
과제시작연도 2018
주관부처 보건복지부
[Ministry of Health & Welfare(MW)(MW)
등록번호 TRKO201900003729
과제고유번호 1465027438
사업명 감염병관리기술개발연구(R&D)
DB 구축일자 2019-07-13
키워드 세균성이질균.전장염기서열분석.차세대분자역학시험법.단일염기다형성.Shigella sonnei.WGS.SNPs.molecular epidemiology testing.
DOI https://doi.org/10.23000/TRKO201900003729

초록

○ 연구목표
- 세균성이질균 감염병 발생 시 신속한 대응을 위한 최신 분자역학시험법 확보

○ 연구내용 및 범위
- 유전체 전장해독 후보균주 선별
• 대상균주 : Shigella sonnei 150주
• 차세대시퀀서를 이용하여 전장유전체 해독
- SNP 데이터베이스 확보
• 세균성이질균 참조균주의 전장염기서열 비교분석을 통한 변이부위 확인
• 역학 및 유전형, 표현형 정보에 부합되는 SNP 후보군 선별
• 주요 SNP의 특성분석을 통한 병원체 주요 특성 확보
• SNPs와

목차 Contents

  • 표지 ... 1
  • 연구최종보고서 ... 2
  • 내부연구과제 요약서 [총괄] ... 3
  • 내부연구과제 연구결과 요약서 [총괄] ... 4
  • 제1장 연구의 목적 및 필요성 ... 5
  • 제2장 연구의 연구목표 및 달성도, 관련 분야에의 기여도 ... 9
  • 제3장 국내・외 기술개발 현황 ... 10
  • 제4장 연구의 내용 및 결과 ... 14
  • 제1절. SNP 시험법 정립을 한 후보 균주 선별 및 유전체 전장해독 ... 14
  • 제2절. hqSNP 및 wgMLST 데이터베이스 확보 ... 17
  • 제3절. SNPs 및 wgMLST loci 유의성 평가 ... 18
  • 제5장 연구개발결과의 활용계획 ... 59
  • 제6장 연구의 주요 연구 성과 ... 59
  • 제7장 기대성과 ... 60
  • 제8장 주요 연구 변경사항 ... 60
  • 제9장 연구비 집행 실적 내역 ... 61
  • 제10장 참여연구원 ... 65
  • 제11장 참고문헌 ... 65
  • 끝페이지 ... 71

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참고문헌 (25)

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