초록 ▼

• 연구의 목적 및 내용
○ 본 세부 연구과제에서는 대사 면역 질환에 관련된 microbiome 데이터를 포함해 다양한 장내 질환에 관련된 유전체 데이터를 생산하며, 미생물 군집 분석, metagenome shotgun 분석, meta-transcriptome 분석을 수행할 수 있는 시스템을 구축하고, 공생미생물 커뮤니티 데이터베이스를 구축하며, 공생미생물 커뮤니티 제어 인자 발굴 및 검증에 활용할 수 있도록 개발할 예정임.

• 연구개발성과
○ 본 연구과제를 통하여 장내미생물 microbiome 통합 생물정보

• 연구의 목적 및 내용
○ 본 세부 연구과제에서는 대사 면역 질환에 관련된 microbiome 데이터를 포함해 다양한 장내 질환에 관련된 유전체 데이터를 생산하며, 미생물 군집 분석, metagenome shotgun 분석, meta-transcriptome 분석을 수행할 수 있는 시스템을 구축하고, 공생미생물 커뮤니티 데이터베이스를 구축하며, 공생미생물 커뮤니티 제어 인자 발굴 및 검증에 활용할 수 있도록 개발할 예정임.

• 연구개발성과
○ 본 연구과제를 통하여 장내미생물 microbiome 통합 생물정보분석이 가능한 플랫폼 prototype을 개발하였음. 즉, 장내미생물 분석 실험기법을 확립, 표준화하였고, 장내미생물 군집분석 파이프라인을 개선, 최적화하였으며, 클라우드 기반 미생물 군집분석 시스템 개발을 진행하였음
○ 다양한 장내미생물 군집 분석 데이터를 생산하여 이를 meta-data와 연결시켜 장내미생물 데이터베이스에 관한 prototype을 개발하였음.
○ 장내미생물 분석 software에 대한 저작권 등록을 완료하였음.

• 연구개발성과의 활용계획 (기대효과)
○ 본 연구팀이 구축하는 장내 미생물 군집 분석 시스템을 통하여 1,3 세부를 포함하여 전체사업 연구자들이 장내 미생물 연구를 하는데 사용할 수 있도록 클라우드 시스템으로 구축하고 있음.
○ 이를 통해서 생물정보 비전공자도 쉽게 NGS를 통한 미생물 군집 분석을 수행할 수 있고, big data 처리 기술과 IT structure 개발을 통하여 대용량 데이터를 검색, 비교 분석하여 질환과의 연관성 분석을 통해 미생물 군집을 제어할 수 있는 기술을 찾는데 활용할 수 있을 것으로 기대함.


(출처 : 국문 요약문 6p)

Abstract ▼

• Purpose & Contents
○ In this study, we aim to produce microbiome data related to metabolic or immunologic disease. For this purpose, total bioinformatic system which can be applied for microbial analysis, metagenome shotgun and metatrascriptomic research will constructed to find important gut m

• Purpose & Contents
○ In this study, we aim to produce microbiome data related to metabolic or immunologic disease. For this purpose, total bioinformatic system which can be applied for microbial analysis, metagenome shotgun and metatrascriptomic research will constructed to find important gut microbiome species and target immune modulators.

• Results
○ We constructed microbiome database and total bioinformatic analysis system. Also we have set up standard operation procedure for NGS analysis system for microbiome study with various NGS platforms such as Roche 454, Illumina MiSeq, HiSeq and PacBio platform. We have optimized and automatic analysis platform based on cloud system.
○ One software IP has been registered.

• Expected Contribution
○ Our bioinformatic platforms based on cloud system can be used and utilized by other research teams and bioinformatic beginners.
○ Our cloud system can be further updated for commercialization with advacned big data management system and IT structure technology.


(출처 : SUMMARY 6p)

목차 Contents

• 표지 ... 1
• 제출문 ... 2
• 보고서 요약서 ... 5
• 국문 요약문 ... 6
• SUMMARY ... 6
• 목차 ... 7
• 제1장. 연구개발과제의 개요 ... 8
• 제2장. 국내외 기술 개발 현황 ... 9
• 제3장. 연구 수행 내용 및 성과 ... 11
• 가. 마이크로바이옴 통합 생물정보분석 플랫폼 프로토타입 개발 ... 11
• 나. 마이크로바이옴 database 구축 및 확장 ... 17
• 다. 메타지놈 분석 시스템 확장 ... 19
• 제4장. 목표 달성도 및 관련 분야 기여도 ... 24
• 제5장. 연구개발성과의 활용계획 ... 24
• 제6장. 연구 과정에서 수집한 해외 과학기술 정보 ... 24
• 제7장. 연구개발성과의 보안등급 ... 24
• 제8장. 국가과학기술종합정보시스템에 등록한 연구시설·장비 현황 ... 24
• 제9장. 연구개발과제 수행에 따른 연구실 등의 안전 조치 이행 실적 ... 25
• 제10장. 연구개발과제의 대표적 연구 실적 ... 25
• 제11장. 기타 사항 ... 25
• 제12장. 참고 문헌 ... 26
• 끝페이지 ... 27