초록 ▼

4. 연구결과
가. 방사선 내성, 호산성, 호염성, 멸종위기종 및 고유종의 장내, 혐기성, 이탄층등의 환경에서 신종/미기록 후보종 82종 발굴, 배양체 82주
1) 특수 환경 발굴 82종은 1계 5문 10강 20목 35과 50속으로 다양성 확보
2) 방사선 내성, 호염성, 호산성, 이탄층, 혐기성, 멸종위기종 및 고유종 장내 등 원핵생물 배양체 82주는 초저온냉동, 액체질소 보존 및 동결건조 보존

나. Biolog를 이용하여 배양체 82주의 생리학적 특성 (탄소원 이용성, pH, 염도 항생제에 대한 내성

4. 연구결과
가. 방사선 내성, 호산성, 호염성, 멸종위기종 및 고유종의 장내, 혐기성, 이탄층등의 환경에서 신종/미기록 후보종 82종 발굴, 배양체 82주
1) 특수 환경 발굴 82종은 1계 5문 10강 20목 35과 50속으로 다양성 확보
2) 방사선 내성, 호염성, 호산성, 이탄층, 혐기성, 멸종위기종 및 고유종 장내 등 원핵생물 배양체 82주는 초저온냉동, 액체질소 보존 및 동결건조 보존

나. Biolog를 이용하여 배양체 82주의 생리학적 특성 (탄소원 이용성, pH, 염도 항생제에 대한 내성 탐색)
1) 호산성 신종 후보종 Ferrovibrio sp. K5 발굴종은 현재까지 전세계 총 3종으로 pH4.0에서 pH7.0에서 생존하여 내산성의 특징을 가짐
2) 호염성 신종 후보종 Formosa sp. PS13 발굴종은 Starch를 분해하며, 6%(w/v) 고염도의 환경에서도 성장 가능함

다. 원핵생물 신종에 대한 Whole Genome Sequence 유전체 정보 분석
1) 특수 환경 원핵생물 신종 15종의 유전체 정보를 확보하여 근연종과 비교·분석
2) 자생생물 조사·발굴 연구에서 확보한 신종 중에서 생리활성(진세노사이드 전환균주, Lipolytic 활성균주 등)을 갖는 신종 40종에 대한 유전체 분석

(출처 : 요약문 6p)

Abstract ▼

Biogeochemical cycles in extreme environments are largely unknown due to the difficulty in handling extreme conditions at laboratory despite of their prime importance. In extreme environments, extremophilic microorganisms are playing a key part in controlling matter transformation. “Discovering extr

Biogeochemical cycles in extreme environments are largely unknown due to the difficulty in handling extreme conditions at laboratory despite of their prime importance. In extreme environments, extremophilic microorganisms are playing a key part in controlling matter transformation. “Discovering extremophilic microorganisms in Korean Peninsula” is a goal of this project. After agreement on “Nagoya Protocol”, securing national biological resources has chosen the most important issue. However, the problem is that the number of report on the the isolation of extremophilic microorganisms from South Kore is very limited. By progressing this project, various extremophilic microorganisms including acidophiles, halophiles, radiotolerants, microbes in peatland, gut microbiome of endangered wild animals were isolated. Total 82 species of extremophilic microorganisms were obtained: 15 novel species candidates; 67 species unreported in Korea. The properties of isolated extremophilic microorganisms were investigated by physiological and biochemical and genetic access. Complete genome sequence of 15 strains of novel species candidates composed of 7 strains of radiotolerants bacteria, 1 strain of acidophiles, 2 strains of halophiles and 5 strains of bacteria from Endangered animals were obtained. Thus, the aim of this project has been successfully achieved. Continuous surveys and isolations of extremophilic microorganisms are required for contributing to secure biological resources in Korea.

(출처 : Abstract 12p)

목차 Contents

• 표지 ... 1
• 참여 연구진 ... 3
• 요약문 ... 5
• 목차 ... 8
• 표목차 ... 10
• 그림목차 ... 11
• Abstract ... 12
• Ⅰ. 서 론 ... 13
• 1. 방사선 노출 ... 14
• 2. 호산․호염성 ... 16
• 3. 멸종위기종 및 고유종 장내 미생물 ... 17
• 4. 혐기성 ... 18
• 5. 이탄층 ... 19
• II. 연구 방법 ... 20
• 1. 특수 환경 미생물자원 발굴 ... 20
• 가. 시료 채취 지점 ... 20
• 나. 시료 채취 방법 ... 21
• 다. 배양체 확보 방법 ... 23
• 라. DNA 바코드 유전자 분석 ... 27
• 마. 신종 후보종과 미기록 후보종의 기준 ... 27
• 바. 배양체 장기 보존 및 DB입력 ... 28
• 2. 생리학적 특성 정보 확보 ... 28
• 3. 분류 동정을 위한 형태학적, 분자생물학적 특성 분석 ... 29
• 가. G+C mol% 분석 ... 29
• 나. Quinone 분석 ... 29
• 다. Polar lipid 분석 ... 30
• 라. Fatty acid 분석 ... 31
• 마. DAP isomer 분석 ... 32
• 바. DNA-DNA hybridization ... 32
• 사. TEM(Transmission Electron Microscope) 촬영 ... 34
• 아. SEM(Scanning Electron Microscope) 촬영 ... 35
• 자. API test ... 36
• 4. 유전 정보 확보 ... 37
• Ⅲ. 연구결과 ... 38
• 1. 특수 환경 미생물자원 신종 및 미기록 후보종 발굴 ... 38
• 가. 신종 후보종의 분류군 ... 44
• 나. 미기록종 후보종의 분류군 ... 46
• 다. 방사선 내성 미생물 발굴 ... 51
• 라. 호산성·호염성 미생물 발굴 ... 51
• 마. 멸종위기종 및 고유종 장내 미생물 발굴 ... 52
• 바. 혐기성 미생물 발굴 ... 54
• 사. 이탄층 미생물 발굴 ... 56
• 2. 특수 환경 미생물자원 신종 15종의 유전정보 확보 ... 59
• 가. 방사선 내성 미생물 7종의 유전정보 결과 ... 59
• 나. 호산성·호염성 미생물 3종의 유전정보 결과 ... 61
• 다. 멸종위기종 및 고유종의 장내 미생물 5종의 유전정보 결과 ... 62
• 3. 미생물자원 신종 40종의 유전정보 확보 ... 64
• Ⅳ. 고찰 ... 67
• 1. 방사선 내성 미생물의 특징 ... 67
• 2. 호산성·호염성 미생물의 특징 ... 67
• 3. 멸종위기종 및 고유종 장내 미생물의 특징 ... 68
• 4. 혐기성 미생물의 특징 ... 69
• 5. 이탄층 미생물의 특징 ... 70
• Ⅴ. 결 론 ... 71
• Ⅵ. 참고문헌 ... 72
• 부록 1. 특수 환경 미생물자원 신종 후보종의 생리·화학적 정보 결과 ... 76
• 부록 2. 특수 환경 미생물자원 미기록종 후보종의 생리·화학적 정보 결과 ... 172
• 부록 3. 특수 환경 미생물자원 Biolog 분석 결과 ... 366
• 부록 4. 방사선 내성 미생물의 UVC 내성 분석 결과 ... 406
• 부록 5. 특수 환경 미생물자원 신종 15종의 유전정보 확보 결과 ... 420
• 부록 6. 미생물자원 신종 40종의 유전정보 확보 결과 ... 450
• 끝페이지 ... 489