[보고서]돼지열병, 고병원성 PRRS 및 강병원성 PED 변이주 해외 유입대비 진단법 개발 및 유전자원 수집

임성인

돼지열병, 고병원성 PRRS 및 강병원성 PED 변이주 해외 유입대비 진단법 개발 및 유전자원 수집
Development of diagnostic assay to prevent the inflow of foreign CSFV, HP-PRRSV, and V-PEDV and collection of veterinary resources 원문보기

보고서 정보
주관연구기관	농림축산검역본부 Animal and Plant Quarantine Agency
연구책임자	임성인
참여연구자	안동준 , 최세은 , 차상호 , 우인옥 , 조인수 , Le Van Phan , Van Giap Nguyen
보고서유형	연차보고서
발행국가	대한민국
언어	한국어
발행년월	2015-12
과제시작연도	2015
주관부처	농림축산식품부 Ministry of Agriculture, Food and Rural Affairs(MAFRA)
과제관리전문기관	농림축산검역본부 Animal and Plant Quarantine Agency
등록번호	TRKO202000031030
과제고유번호	1545009841
사업명	농림축산검역검사기술개발
DB 구축일자	2020-11-28
키워드	돼지열병.고병원성 PRRS.강병원성 PED.

초록 ▼

4. 당해년도 연구결과 요약

◦ 제1세부과제명 : 돼지열병, 고병원성 PRRS 및 강병원성 PED 변이주 진단법 적용시험 및 유전자원 보존
(검역본부)
1) 베트남에서 분리된 PRRS 11개 분리주의 주요 변이 유전자인 non-structural protein 2 (Nsp2), open reading frame 5 (ORF5) 유전자를 국내 분리주와 염기서열 비교 분석 완료
2) 베트남 PED 장유제 및 분변 시료 총 25건을 수집하고 이 중에서 3개 지역 6개 시료에서 S gene과 ORF3 gene 염기서열 분석하였으며, 그 결과 PED G2b 그룹에 속함을 확인하였으며, Hung Yen 지역의 2주가 기존 베트남주와 다른 변이주로 확인되어 GenBank에 등록함.
3) 베트남 돼지열병 관련 시료(1농가)를 총 8점(혈장)을 수입하고 5‘ NCR, E2-full gene 염기서열 분석 완료한 결과 Group 2에 속함을 확인함
4) 돼지열병, PRRS 및 PED 감별진단법 확립
- 돼지열병 백신주(LOM주)와 야외주 항원 감별 및 유전형 감별을 위하여 PNA probe를 이용한 Melting Array 확립
- 고병원성 PRRS 및 유전형 감별을 위하여 PNA probe를 이용한 Melting Array 적용 및 분석
- PED 유전형 감별을 위하여 PNA probe를 이용한 Melting Array 수행

◦ 제2세부과제명 : 베트남 돼지 가검샘플 수집 및 개발된 진단키트 유효성 평가(베트남)
1) 베트남에서 고병원성으로 의심되는 PRRS가 발생한 11개 농장에서 돼지 가검시료(폐조직)를 채취하여 PRRS 바이러스를 분리하고 Marc-145세포에서 4대까지 계대 후 검역본부에 송부
2) 베트남에서 PED가 발생한 농장(2014년 10월～2015년 4월)의 돼지 가검시료(장조직 또는 분변)를 채취하여 RT-PCR 결과 양성으로 확인된 25점을 검역본부에 송부
3) 베트남 돼지열병 의심 농장에서 돼지 가검 시료(전혈)를 채취하여 RT-PCR 결과 양성으로 확인된 가검 시료 8점을 검역본부에 송부
4) 돼지열병 바이러스 신속진단키트의 유효성 평가를 위한 항원 패널 구축을 목적으로 베트남 돼지혈장(돼지열병, PRRS, PED 음성) 총 68점을 검역본부에 송부

(출처 : 요약 1p)

목차 Contents

표지 ... 1
Ⅰ. 연구배경 및 목표 ... 3
1. 연구배경 ... 3
2. 연구최종목표 ... 5
3. 연차별 연구개발 목표 및 내용 ... 5
Ⅱ. 연구방법 및 수행전략 ... 6
1. 재 료 ... 6
2. 연구전략 및 방법 ... 7
Ⅲ. 연구결과 ... 9
1. 제1세부과제명 : 돼지열병, 고병원성 PRRS 및 강병원성 PED 변이주 진단법 적용 시험 및 유전자원 보존(검역본부) ... 9
2. 제2세부과제명: 베트남 돼지 가검샘플 수집 및 개발된 진단키트 유효성 평가(베트남) ... 22
Ⅳ. 연구결과요약 ... 31
1. 제1세부과제명 : 돼지열병, 고병원성 PRRS 및 강병원성 PED 변이주 진단법 적용시험 및 유전자원 보존(검역본부) ... 31
2. 제2세부과제명 : 베트남 돼지 가검샘플 수집 및 개발된 진단키트 유효성 평가(베트남) ... 32
Ⅴ. 금후 추진계획 ... 32
Ⅵ. 연구결과 활용실적 및 계획 ... 33
Ⅶ. 연구사업 추진상 문제점 및 건의사항 ... 34
Ⅷ. 주요연구 변경사항 ... 34
끝페이지 ... 34

표/그림 (9)

표 Phylogenetic tree for the nucleotide sequences of the ORF5 gene of PRRS viruses isolated in Vietnam compared with those of other PRRSV representatives. A bar represents 0.05 substitutions per nucleotide position
표 Percent similarity of the ORF5 gene sequence of HP-PRRS strains isolated in Vietnam compared with other PEDV presentatives
표 Alignment of the nucleotides of the NSP2 gene of different PRRSV strains isolated in Vietnam. Dot(.) indicates nt identity with the consensus sequence
표 Phylogenetic tree for the nucleotide sequences of the S gene of PED viruses in Vietnam compared with those of other PEDV representatives. A bar represents 0.005 substitutions per nucleotide position
표 Percent similarity of the S gene sequence of PEDV stains isolated in Vietnam compared with other PEDV representatives
표 Alignment of the nucleotide sequences of the spike(S) gene of different PEDV strains isolated in Vietnam. Dot(.) indicates nt identity with the consensus sequence
표 Phylogenetic tree for the nucleotide sequences of the ORF 3 gene of PED viruses in Vietnam compared with those of other PEDV representatives. A bar represents 0.005 substitutions per nucleotide position
표 Alignment of the nucleotide sequences of the ORF 1 gene of HUA-PED 96 compared with different PEDV strains isolated in Vietnam
표 Phylogenetic tree for the nucleotide sequences of the 5'NCR gene of CSG viruses isolated in Vietnam compared with those of other CSFV representatives. A bar represents 0.005 substitutions per nucleotide position

과제명(ProjectTitle) :	-
연구책임자(Manager) :	-
과제기간(DetailSeriesProject) :	-
총연구비 (DetailSeriesProject) :	-
키워드(keyword) :	-
과제수행기간(LeadAgency) :	-
연구목표(Goal) :	-
연구내용(Abstract) :	-
기대효과(Effect) :	-

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