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세포기반 맞춤형 치료제 예측 시스템 개발을 위한 다중오믹스 분석 플랫폼 구축
Establishment of multi-omics analysis platform for cell-based personalized medicine prediction system 원문보기

보고서 정보
주관연구기관 울산과학기술원
Ulsan National Institute of Science and Technology
연구책임자 이세민
보고서유형최종보고서
발행국가대한민국
언어 한국어
발행년월2019-10
과제시작연도 2019
주관부처 과학기술정보통신부
Ministry of Science and ICT
등록번호 TRKO202100002112
과제고유번호 1711082094
사업명 포스트게놈신산업육성을위한다부처유전체사업(R&D)(과기정통부)
DB 구축일자 2021-06-12
키워드 암.오거노이드.다중오믹스.약물반응성.기계학습.Cancer.Organoid.Multiomics.Drug response.Machine learning.

초록

본 과제에서는 3D 오거노이드 배양법을 사용하여 확보된 췌장암, 폐암 환자유래 1차 배양 세포주로부터 차세대 염기서열 분석방법인 whole-exome sequencing, whole-transcriptome sequencing, methyl-seq 기술을 통해 생성된 유전체/전사체/후성유전체 데이터를 분석하는 다중오믹스 분석 파이프라인 구축하였음. 또한 다양한 약물별 반응성 데이터와 다중오믹스 데이터를 연계 분석하여 개인별 약물 반응성에 관련된 유전인자를 발굴하고 기계학습기법을 이용한 항암제 반응성 예측모델을 개발함.

목차 Contents

  • 표지 ... 1
  • 제 출 문 ... 2
  • 보고서 요약서 ... 3
  • 요약문 ... 4
  • 목차 ... 5
  • 1. 연구개발과제의 개요 ... 6
  • 2. 연구수행내용 및 성과 ... 7
  • 가. 대용량 다중오믹스 분석 서버 구축 ... 7
  • 나. 공개된 암유전체 데이터 및 약물 반응성 데이터 확보 ... 7
  • 다. 대용량 다중오믹스 분석 플랫폼 개발 ... 8
  • 라. 다중오믹스 데이터 분석 ... 10
  • 마. 약물반응성관련 유전인자 발굴 및 맞춤형 치료제 예측모델 개발 ... 14
  • 3. 목표 달성도 및 관련 분야 기여도 ... 17
  • 3-1. 목표 ... 17
  • 3-2. 목표 달성여부 ... 17
  • 3-3. 목표 미달성 시 원인(사유) 및 차후대책(후속연구의 필요성 등) ... 21
  • 4. 연구개발성과의 활용 계획 등 ... 22
  • 가. 연구개발 결과의 활용방안 ... 22
  • 끝페이지 ... 22

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참고문헌 (25)

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