초록 ▼

□ 연구개발 목표 및 내용
○ 최종 목표
농생명 다차원 정보 활용 및 연계 시스템 구축

○ 전체 내용
○ 농생명 다차원 정보 표준화 및 서비스 체계 연구
○ 농생명 다차원 정보 활용 및 연계 시스템 구축
○ 인공지능 기반 농생명 유전체 정보 분석 및 활용 연구
○ 농생명 다차원 정보 통합 관리를 위한 신규 기능 개발
○ 농생명 다차원 정보 간 연관 분석 및 활용 연구
○ 농생명 다차원 정보 통합 관리를 위한 신규 기능 개발
○ 농생명 다차원 정보 간 연관 분석 및 활용 연

□ 연구개발 목표 및 내용
○ 최종 목표
농생명 다차원 정보 활용 및 연계 시스템 구축

○ 전체 내용
○ 농생명 다차원 정보 표준화 및 서비스 체계 연구
○ 농생명 다차원 정보 활용 및 연계 시스템 구축
○ 인공지능 기반 농생명 유전체 정보 분석 및 활용 연구
○ 농생명 다차원 정보 통합 관리를 위한 신규 기능 개발
○ 농생명 다차원 정보 간 연관 분석 및 활용 연구
○ 농생명 다차원 정보 통합 관리를 위한 신규 기능 개발
○ 농생명 다차원 정보 간 연관 분석 및 활용 연구

□ 연구개발성과
□ 1차년도
○ 2차 정보 DB 표준화 – 3종(유전형정보, 피크정보, 발현정보)
○ 유전체 해독 품목별 공유 시스템 구축 - 2단계 23품목
○ 화본과 작물 유전체 비교분석을 통한 synteny block 목록화
○ 화본과 작물의 QTL Database 구축 및 표현형 Ontology 정리
○ 표현체·대사체 정보 등록·관리를 위한 시스템 설계
○ 농생명 빅데이터 수집, 관리 및 활용 시스템 분석
○ 표준유전체에 대한 농업 유용형질 관련 QTL 및 연관 분자표지 정보 수집
○ QTL 유전적 위치의 물리적 위치로의 전환 파이프라인 확립

□ 2차년도
○ 3차 정보 DB 표준화 – 2종(연관정보, 발현 네트워크)
○ 표준 SNP 정보 DB 구축 – 벼 등 국내 주요작물 3품목
○ 인공지능 알고리즘을 이용하여 Synteny block 기반 화본과 작물의 QTL 예측 모델 작성
○ 화본과 작물들의 예측 기반 QTL DB 작성
○ 표현체·대사체 정보 등록·관리·제공을 위한 시스템 개발
○ 차세대 빅데이터 연동 정보 내역 조사
○ 표준유전체와 근연종 간의 synteny block의 위치 정보 확보
○ QTL의 물리적 위치 시각화 파이프라인 확립

□ 3차년도
○ 품목별 유전체 정보 제공 체계 수립
○ 다차원 정보 활용 시스템 구축
○ 인공지능 알고리즘을 이용한 C3/C4 작물 분화관련 변이 발굴
○ 화본과 작물들의 C3/C4 관련변이 DB 작성
○ 표현체·대사체 정보 연동 체계 구축
○ 차세대 빅데이터 정보 연동 체계의 ERD 설계
○ 표준유전체 맵핑 영역에 대한 분자표지 프라이머 디자인
○ 근연종에 대한 synteny block 위치 확립 및 분자표지 선발

□ 4차년도
○ 품목별 유전체 정보 DB 표준화
○ 품목별 유전체 DB 구축 - 국내 주요작물 3품목
○ 인공지능 알고리즘을 이용하여 화본과 작물의 전사체 기반 유전자 네트워크 작성
○ 화본과 작물의 전사체 기반 유전자 네트워크 DB 작성
○ 농생명 다차원 정보 대국민 제공 서비스 개발
○ 차세대 빅데이터 정보 연동 체계의 화면단 설계
○ 후보 분자표지군의 육종집단 또는 핵심집단에의 검정
○ 다차원 농생명 빅데이터를 활용한 오믹스 통합 연계 시스템의 개발

□ 연구개발성과 활용계획 및 기대 효과
□ 활용 계획
○ 본 과제를 통해서 확보된 데이터 및 시스템의 지속적인 관리·운영을 통해 연구자에게 안정적으로 서비스를 제공함으로서 농생명 R&D에 기여하고자 함

□ 기대 효과
○ 다양한 농생명 다차원 정보를 통합·제공할 수 있는 기반을 구축을 통한 국내 농생명정보 데이터베이스 서비스 수준 향상
○ 최근 급속도로 발전하고 있는 인공지능 기반의 정보 분석 도구를 효율적으로 개발·활용하기 위한 빅데이터 기반을 제공함으로서 연구 경쟁력 강화에 기여
○ 농생명 다차원 정보의 통합관리 및 분석활용 인프라 확보를 통해 국가 농산업 R&D 경쟁력 확보

(출처 : 요약문 2p)

목차 Contents

• 표지 ... 1
• 요 약 문 ... 2
• 목차 ... 4
• 1. 연구개발과제의 개요 ... 5
• 2. 연구개발과제의 수행 과정 및 수행내용 ... 8
• □ 1차년도 ... 8
• □ 2차년도 ... 8
• □ 3차년도 ... 9
• □ 4차년도 ... 10
• 3. 연구개발과제의 수행 결과 및 목표 달성 정도 ... 12
• 1) 연구 수행 결과 ... 12
• 2) 목표 달성 수준 ... 103
• 4. 목표 미달 시 원인분석 ... 105
• 5. 연구개발성과 및 관련 분야에 대한 기여 정도 ... 106
• 6. 연구개발성과의 관리 및 활용 계획 ... 107
• 붙임 1 주요 결과 요약서 ... 108
• 붙임 2 벼 SSR 분자표지 1 primers 정보 ... 111
• 붙임 3 벼 SSR 분자표지 2 primers 정보 ... 121
• 붙임 4 벼 SSR 분자표지 3 primers 정보 ... 129
• 붙임 5 수수 SSR 분자표지 primers 정보 ... 131
• 끝페이지 ... 157