[학위논문]tuberous sclerosis 환자의 cDNA 염기서열 분석에 의한 돌연변이 분석 Mutation analysis on Korean patients with tuberous sclerosis by whole TSC1 and TSC2 sequencing원문보기
Tuberous sclerosis는 상염색체 우성의 유전질환으로 약 6천명 중에 1명 정도의 환자가 발병한다. 이 질환은 피부의 과오종(過誤腫, Hamartomas)과 중추신경계에서 연구가 되었다. 환자는 간질, 정신지체(mental retardation), 안면 혈관섬유종(facial angiofibromas), 저색소반증(hypomelanotic patches)과 혈관근지방종(angiomyolipomas) 등을 유발한다. 이 질환은 유전적 질환이지만 약 50%의 환자는 새로운 돌연변이에 의해 생기는 sporadic 증상도 보이고 있으며, TSC1과 TSC2의 두개의 유전자로 구성되어 이두 유전자의 돌연변이에 의해서 발병된다. 돌연변이는 특정부위에 집중되어 나타나지는 않고 전체 유전자에 흩어져 있다. 우리는 5환자에서 TSC1과 TSC2 ...
Tuberous sclerosis는 상염색체 우성의 유전질환으로 약 6천명 중에 1명 정도의 환자가 발병한다. 이 질환은 피부의 과오종(過誤腫, Hamartomas)과 중추신경계에서 연구가 되었다. 환자는 간질, 정신지체(mental retardation), 안면 혈관섬유종(facial angiofibromas), 저색소반증(hypomelanotic patches)과 혈관근지방종(angiomyolipomas) 등을 유발한다. 이 질환은 유전적 질환이지만 약 50%의 환자는 새로운 돌연변이에 의해 생기는 sporadic 증상도 보이고 있으며, TSC1과 TSC2의 두개의 유전자로 구성되어 이두 유전자의 돌연변이에 의해서 발병된다. 돌연변이는 특정부위에 집중되어 나타나지는 않고 전체 유전자에 흩어져 있다. 우리는 5환자에서 TSC1과 TSC2 cDNA염기서열 분석을 통하여 유전자의 변이를 관찰하고자 하였으며 3환자에서 돌연변이를 관찰하였으나 두 환자에게도 관찰 할 수 없었다. 첫째 환자는 TSC1에서 245번째 아미노산이 Arginine에서 종료 codon으로 변이가 있었고 두 번째 환자는 TSC2 유전자에서 Arginine이 Tryptophan으로 돌연변이가 관찰되었고 세 번째 환자에서는 TSC2 유전자에서 액손 26번이 결손 되어 있었다. 또한 TSC1 유전자에서 액손 12번의 새로운 splicing 변이도 관찰이 되었다. 일반적으로 genomic DNA의 돌연변이 분석법은 아주 정확하게 유전자의 돌연변이를 관찰할 수 있는 장점이 있으나 유전자의 크기가 너무 크므로 많은 비용과 시간이 필요하다. 그러나 여기에서 적용된 cDNA 염기서열 분석법은 적은 비용과 몇 번의 PCR 반응으로 돌연변이를 알 수 있는 장점이 있다.
Tuberous sclerosis는 상염색체 우성의 유전질환으로 약 6천명 중에 1명 정도의 환자가 발병한다. 이 질환은 피부의 과오종(過誤腫, Hamartomas)과 중추신경계에서 연구가 되었다. 환자는 간질, 정신지체(mental retardation), 안면 혈관섬유종(facial angiofibromas), 저색소반증(hypomelanotic patches)과 혈관근지방종(angiomyolipomas) 등을 유발한다. 이 질환은 유전적 질환이지만 약 50%의 환자는 새로운 돌연변이에 의해 생기는 sporadic 증상도 보이고 있으며, TSC1과 TSC2의 두개의 유전자로 구성되어 이두 유전자의 돌연변이에 의해서 발병된다. 돌연변이는 특정부위에 집중되어 나타나지는 않고 전체 유전자에 흩어져 있다. 우리는 5환자에서 TSC1과 TSC2 cDNA 염기서열 분석을 통하여 유전자의 변이를 관찰하고자 하였으며 3환자에서 돌연변이를 관찰하였으나 두 환자에게도 관찰 할 수 없었다. 첫째 환자는 TSC1에서 245번째 아미노산이 Arginine에서 종료 codon으로 변이가 있었고 두 번째 환자는 TSC2 유전자에서 Arginine이 Tryptophan으로 돌연변이가 관찰되었고 세 번째 환자에서는 TSC2 유전자에서 액손 26번이 결손 되어 있었다. 또한 TSC1 유전자에서 액손 12번의 새로운 splicing 변이도 관찰이 되었다. 일반적으로 genomic DNA의 돌연변이 분석법은 아주 정확하게 유전자의 돌연변이를 관찰할 수 있는 장점이 있으나 유전자의 크기가 너무 크므로 많은 비용과 시간이 필요하다. 그러나 여기에서 적용된 cDNA 염기서열 분석법은 적은 비용과 몇 번의 PCR 반응으로 돌연변이를 알 수 있는 장점이 있다.
Tuberous sclerosis is an autosomal dominant neurocutaneous disorder with the prevalence of about 1:6,000. It is characterized by hamartomas in the skin and central nervous system. The patients have epilepsy, mental retardation, facial angiofibromas, hypomelanotic patches and renal angiomyolipomas. I...
Tuberous sclerosis is an autosomal dominant neurocutaneous disorder with the prevalence of about 1:6,000. It is characterized by hamartomas in the skin and central nervous system. The patients have epilepsy, mental retardation, facial angiofibromas, hypomelanotic patches and renal angiomyolipomas. It is a genetic disorder, but about 60% of the patients are sporadic form, apparently representing new mutations. The disease is caused by the mutations in either of two large genes, TSC1 and TSC2. These mutations are not clustered at some specific sites but are scattered over the entire gene. In this study, we have tried the molecular diagnosis of tuberous sclerosis in five Korean patients by whole TSC1 and TSC2 cDNA sequencing. In three patients, we found previously described mutations(R245X in TSC1, R611W and exon 26 deletion in TSC2), however, mutations were not detected on two patients. The cDNA sequencing approach employed in this study required much less PCR reactions than the other methods which amplified over 60 exons of the TSC1 and TSC2. The present method have potential advantage in identifying large deletions or insertions. If this method is combined with total gene deletion screening, the detection rate of the mutation will be increased. In this study, a new splicing variant in exon 12 of TSC1 was also found.
Tuberous sclerosis is an autosomal dominant neurocutaneous disorder with the prevalence of about 1:6,000. It is characterized by hamartomas in the skin and central nervous system. The patients have epilepsy, mental retardation, facial angiofibromas, hypomelanotic patches and renal angiomyolipomas. It is a genetic disorder, but about 60% of the patients are sporadic form, apparently representing new mutations. The disease is caused by the mutations in either of two large genes, TSC1 and TSC2. These mutations are not clustered at some specific sites but are scattered over the entire gene. In this study, we have tried the molecular diagnosis of tuberous sclerosis in five Korean patients by whole TSC1 and TSC2 cDNA sequencing. In three patients, we found previously described mutations(R245X in TSC1, R611W and exon 26 deletion in TSC2), however, mutations were not detected on two patients. The cDNA sequencing approach employed in this study required much less PCR reactions than the other methods which amplified over 60 exons of the TSC1 and TSC2. The present method have potential advantage in identifying large deletions or insertions. If this method is combined with total gene deletion screening, the detection rate of the mutation will be increased. In this study, a new splicing variant in exon 12 of TSC1 was also found.
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