바위게 Pachygrapsus crassipes(십각목, 바위게과)는 우리나라의 동·남해의 해안가 암석 지대에서 흔하게 볼 수 있는 종으로서, 한국과 일본을 비롯하여 북아메리카 서쪽 해안에 이르기까지 태평양의 동·서쪽 연안을 따라 넓게 분포하고 있다. 동태평양 지역 개체군을 중심으로 바위게의 계통지리학적 연구가 수행된 바 있으나, 서태평양 지역의 바위게 개체군에 대한 연구는 거의 이루어지지 않았다. 본 연구에서는 한국과 일본을 포함한 서태평양 지역의 바위게 개체군에 대한 유전적 다양성과 유전적 구조를 밝히고자 한다. 한국 8개 지역(독도, 울릉도, 강원도 동해시와 ...
바위게 Pachygrapsus crassipes(십각목, 바위게과)는 우리나라의 동·남해의 해안가 암석 지대에서 흔하게 볼 수 있는 종으로서, 한국과 일본을 비롯하여 북아메리카 서쪽 해안에 이르기까지 태평양의 동·서쪽 연안을 따라 넓게 분포하고 있다. 동태평양 지역 개체군을 중심으로 바위게의 계통지리학적 연구가 수행된 바 있으나, 서태평양 지역의 바위게 개체군에 대한 연구는 거의 이루어지지 않았다. 본 연구에서는 한국과 일본을 포함한 서태평양 지역의 바위게 개체군에 대한 유전적 다양성과 유전적 구조를 밝히고자 한다. 한국 8개 지역(독도, 울릉도, 강원도 동해시와 양양군, 경상북도 포항시, 울산, 제주도)과 일본 2개 지역(돗토리현, 대마도)으로부터 총 170개체를 채집하여 미토콘드리아유전체의 COI 유전자 575bp를 대상으로 분석을 실시하였다. 염기서열 다양성 분석 결과, 서태평양 바위게 개체군은 유전적 다양성은 낮았으나(0.0051±0.0003) 염기서열 상에서 특이적인 변이 패턴을 나타냈으며, 최소 4가지 이상의 유전자 형이 존재함을 확인하였다. 4가지 유전자 형은 모든 조사 대상 지역에서 발견되었으며, 각 유전자 형은 유전적 구조로서 유의미함을 확인하였다. 서태평양 지역 바위게 개체군에 대한 분석 결과를 선행 연구 결과와 함께 종합 분석을 실시한 결과, 동·서 태평양 개체군 사이에는 뚜렷한 유전적 분화가 일어나고 있으며, 동태평양 개체군이 서태평양 개체군보다 좀 더 원시적인 계통학적 위치를 가진다는 것을 알 수 있었다. 이는 바위게가 동태평양 연안에서 서태평양 지역으로 이주해 왔다는 종전의 가설을 지지하는 것으로, 이주 후 태평양을 경계로 격리되어 독립적인 유전적 분화가 진행되어 온 것으로 추정된다.
바위게 Pachygrapsus crassipes(십각목, 바위게과)는 우리나라의 동·남해의 해안가 암석 지대에서 흔하게 볼 수 있는 종으로서, 한국과 일본을 비롯하여 북아메리카 서쪽 해안에 이르기까지 태평양의 동·서쪽 연안을 따라 넓게 분포하고 있다. 동태평양 지역 개체군을 중심으로 바위게의 계통지리학적 연구가 수행된 바 있으나, 서태평양 지역의 바위게 개체군에 대한 연구는 거의 이루어지지 않았다. 본 연구에서는 한국과 일본을 포함한 서태평양 지역의 바위게 개체군에 대한 유전적 다양성과 유전적 구조를 밝히고자 한다. 한국 8개 지역(독도, 울릉도, 강원도 동해시와 양양군, 경상북도 포항시, 울산, 제주도)과 일본 2개 지역(돗토리현, 대마도)으로부터 총 170개체를 채집하여 미토콘드리아 유전체의 COI 유전자 575bp를 대상으로 분석을 실시하였다. 염기서열 다양성 분석 결과, 서태평양 바위게 개체군은 유전적 다양성은 낮았으나(0.0051±0.0003) 염기서열 상에서 특이적인 변이 패턴을 나타냈으며, 최소 4가지 이상의 유전자 형이 존재함을 확인하였다. 4가지 유전자 형은 모든 조사 대상 지역에서 발견되었으며, 각 유전자 형은 유전적 구조로서 유의미함을 확인하였다. 서태평양 지역 바위게 개체군에 대한 분석 결과를 선행 연구 결과와 함께 종합 분석을 실시한 결과, 동·서 태평양 개체군 사이에는 뚜렷한 유전적 분화가 일어나고 있으며, 동태평양 개체군이 서태평양 개체군보다 좀 더 원시적인 계통학적 위치를 가진다는 것을 알 수 있었다. 이는 바위게가 동태평양 연안에서 서태평양 지역으로 이주해 왔다는 종전의 가설을 지지하는 것으로, 이주 후 태평양을 경계로 격리되어 독립적인 유전적 분화가 진행되어 온 것으로 추정된다.
The lined shore crab Pachygrapsus crassipes is a small crab found on rocky shores and distributed along the eastern and western coast of Pacific including Korea, Japan and North America. The lined shore crabs were first reported in Korea and Japan in 1890s. They are presumed to have migrated from co...
The lined shore crab Pachygrapsus crassipes is a small crab found on rocky shores and distributed along the eastern and western coast of Pacific including Korea, Japan and North America. The lined shore crabs were first reported in Korea and Japan in 1890s. They are presumed to have migrated from coast of North America and to be moved by ships’ ballast water in the first larval stage called the zoea. The previous phylogeographic study of Cassone and Boulding (2006) about the P. crassipes has been performed focusing on the population of eastern Pacific, whereas researches about populations of western Pacific have not been performed yet. The purposes of the present study are to identify the genetic variation and population structure of western Pacific populations of P. crassipes, and to expand the phylogeographic study concerning genetic differentiation between eastern and western Pacific populations of P. crassipes. Genetic variation and population structure of P. crassipes along the coasts of Korea and Japan were examined using mitochondrial COI gene (575bp in length) of 170 specimens which were collected from 8 sampling sites in Korea (Dokdo Is., Ulleungdo Is., Donghae-si, Yangyang-gun, Yeongdeok-gun, Pohang-si, Ulsan and Jejudo Is.) and 2 sampling sites in Japan (Tsusima Is. and Tottori-ken). Genetic surveys of mitochondrial COI gene in these populations revealed that nucleotide diversity (π) was low (0.0051±0.0003). Nevertheless, the populations of P. crassipes were divided into four distinct genetic lineages (types A, B, C and others) by 5 polymorphic sites. The four genetic types were found in all the collecting localities. These results were also supported by the present phylogenetic analyses, nested clade analyses and genetic structure analyses. The genetic differentiation between eastern and western Pacific populations were assessed by using combined data with the present results and previous results of Cassone and Boulding (2006) for eastern Pacific populations of P. crassipes. The results showed the existence of highly significant genetic differentiation between western and eastern Pacific populations. The present phylogenetic analysis showed that eastern Pacific populations are more primitive than western Pacific populations. This supported the previous hypothesis that P. crassipes may migrate from eastern Pacific to western Pacific.
The lined shore crab Pachygrapsus crassipes is a small crab found on rocky shores and distributed along the eastern and western coast of Pacific including Korea, Japan and North America. The lined shore crabs were first reported in Korea and Japan in 1890s. They are presumed to have migrated from coast of North America and to be moved by ships’ ballast water in the first larval stage called the zoea. The previous phylogeographic study of Cassone and Boulding (2006) about the P. crassipes has been performed focusing on the population of eastern Pacific, whereas researches about populations of western Pacific have not been performed yet. The purposes of the present study are to identify the genetic variation and population structure of western Pacific populations of P. crassipes, and to expand the phylogeographic study concerning genetic differentiation between eastern and western Pacific populations of P. crassipes. Genetic variation and population structure of P. crassipes along the coasts of Korea and Japan were examined using mitochondrial COI gene (575bp in length) of 170 specimens which were collected from 8 sampling sites in Korea (Dokdo Is., Ulleungdo Is., Donghae-si, Yangyang-gun, Yeongdeok-gun, Pohang-si, Ulsan and Jejudo Is.) and 2 sampling sites in Japan (Tsusima Is. and Tottori-ken). Genetic surveys of mitochondrial COI gene in these populations revealed that nucleotide diversity (π) was low (0.0051±0.0003). Nevertheless, the populations of P. crassipes were divided into four distinct genetic lineages (types A, B, C and others) by 5 polymorphic sites. The four genetic types were found in all the collecting localities. These results were also supported by the present phylogenetic analyses, nested clade analyses and genetic structure analyses. The genetic differentiation between eastern and western Pacific populations were assessed by using combined data with the present results and previous results of Cassone and Boulding (2006) for eastern Pacific populations of P. crassipes. The results showed the existence of highly significant genetic differentiation between western and eastern Pacific populations. The present phylogenetic analysis showed that eastern Pacific populations are more primitive than western Pacific populations. This supported the previous hypothesis that P. crassipes may migrate from eastern Pacific to western Pacific.
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