요로 감염은 세균성 감염으로, 전세계적으로 연간 최소 2억 5천만명이 발생되는 것으로 추정된다. 요로 감염은 많은 세균들과 연관되어 있고, 그 중 Escherichia coli가 주요 원인균이다. 요로감염균의 검출에는 중합효소연쇄반응 방법에 의한 독성 유전자가 검출법이 사용되었으나 이 방법은 독성 유전자의 돌연변이의 가능성 때문에 검출 제한을 가진다. 이러한 제한을 극복하기 위하여, 보존된 지역을 가지는 16S rRNA 유전자를 사용하는 정량 ...
요로 감염은 세균성 감염으로, 전세계적으로 연간 최소 2억 5천만명이 발생되는 것으로 추정된다. 요로 감염은 많은 세균들과 연관되어 있고, 그 중 Escherichia coli가 주요 원인균이다. 요로감염균의 검출에는 중합효소연쇄반응 방법에 의한 독성 유전자가 검출법이 사용되었으나 이 방법은 독성 유전자의 돌연변이의 가능성 때문에 검출 제한을 가진다. 이러한 제한을 극복하기 위하여, 보존된 지역을 가지는 16S rRNA 유전자를 사용하는 정량 실시간 중합효소연쇄반응 기법과 다중 중합효소연쇄반응 기법은 진단과 연구에 유용하며, 이 기법들은 높은 특이성과 민감성 등의 장점을 가진다. 본 연구에서는 정량 실시간 중합효소연쇄반응 기법을 이용해 요로감염균의 주 원인균인 E. coli 의 검출과 균수 측정을 16S rRNA 유전자와 독성 유전자인 fimH 유전자를 대상으로 실시하고 비교 분석하였다. 28명의 환자 시료를 대상으로 시험한 결과 16S rRNA 유전자에 대하여 100%, 독성 유전자인 fimH 유전자에 대하여 82.1%의 검출율을 나타내었다. 또한 16S rRNA 유전자는 1.2 x 108 CFU/ml과 fimH 유전자는 6.7 x 106 CFU/ml를 균주 측정이 가능한 것을 확인하였다. 또한 16S rRNA 유전자를 이용하여 많은 요로감염균 중에서, E. coli를 비롯하여 Enterococcus 종, Staphylococcus 종, and Proteus 종을 추가로 선택하여 다중 중합효소연쇄반응 기법을 개발하고 총 200개의 균주를 이용하여 4개의 균종에 대한 특이성을 확인하였다. 본 연구에서 16S rRNA 유전자를 기초로 개발한 정량 실시간 중합효소연쇄반응 기법과 다중 중합효소연쇄반응 기법은 신속하고 정확한 요로 감염의 검사와 진단 기법으로 사용될 수 있을 것이다.
요로 감염은 세균성 감염으로, 전세계적으로 연간 최소 2억 5천만명이 발생되는 것으로 추정된다. 요로 감염은 많은 세균들과 연관되어 있고, 그 중 Escherichia coli가 주요 원인균이다. 요로감염균의 검출에는 중합효소연쇄반응 방법에 의한 독성 유전자가 검출법이 사용되었으나 이 방법은 독성 유전자의 돌연변이의 가능성 때문에 검출 제한을 가진다. 이러한 제한을 극복하기 위하여, 보존된 지역을 가지는 16S rRNA 유전자를 사용하는 정량 실시간 중합효소연쇄반응 기법과 다중 중합효소연쇄반응 기법은 진단과 연구에 유용하며, 이 기법들은 높은 특이성과 민감성 등의 장점을 가진다. 본 연구에서는 정량 실시간 중합효소연쇄반응 기법을 이용해 요로감염균의 주 원인균인 E. coli 의 검출과 균수 측정을 16S rRNA 유전자와 독성 유전자인 fimH 유전자를 대상으로 실시하고 비교 분석하였다. 28명의 환자 시료를 대상으로 시험한 결과 16S rRNA 유전자에 대하여 100%, 독성 유전자인 fimH 유전자에 대하여 82.1%의 검출율을 나타내었다. 또한 16S rRNA 유전자는 1.2 x 108 CFU/ml과 fimH 유전자는 6.7 x 106 CFU/ml를 균주 측정이 가능한 것을 확인하였다. 또한 16S rRNA 유전자를 이용하여 많은 요로감염균 중에서, E. coli를 비롯하여 Enterococcus 종, Staphylococcus 종, and Proteus 종을 추가로 선택하여 다중 중합효소연쇄반응 기법을 개발하고 총 200개의 균주를 이용하여 4개의 균종에 대한 특이성을 확인하였다. 본 연구에서 16S rRNA 유전자를 기초로 개발한 정량 실시간 중합효소연쇄반응 기법과 다중 중합효소연쇄반응 기법은 신속하고 정확한 요로 감염의 검사와 진단 기법으로 사용될 수 있을 것이다.
Urinary tract infection (UTI) is the most bacterial infectious disease. UTI is annually estimated global incidence of at least 250 million. UTI is associated with many bacteria, Escherichia coli is the predominant causative uropathogen. Usually, virulence genes are often used for detection of uropat...
Urinary tract infection (UTI) is the most bacterial infectious disease. UTI is annually estimated global incidence of at least 250 million. UTI is associated with many bacteria, Escherichia coli is the predominant causative uropathogen. Usually, virulence genes are often used for detection of uropathogenic bacteria by PCR methods. However, it has a detection limit because of possibility of mutation. To overcome the limitation of detection, 16S rRNA gene as having a conserved region for identification of bacteria is used. Quantification real-time PCR (qPCR) and multiplex PCR (mPCR) assays are powerful tool for diagnostic and research and these have advantages such as high specificity and sensitivity. In this study, 16S rRNA gene is compared with fimH gene in virulence genes for detection and counting of E. coli as major causative uropathogen using qPCR assay. A result of 28 patient samples have shown 100% detection rate for 16S rRNA gene and 82.1% detection rate for fimH gene. The result also confirmed E. coli cell counting by approximately 1.2 x 108 CFU/ml and 6.7 x 106 CFU/ml 16S rRNA gene and fimH gene, respectively. Furthermore, mPCR assay was developed by using 16S rRNA gene and also can detect in many uropathogen also in this study found the confirmed specificity in 4 out of total 200 strains. For more describing, this specificity of this method especially in E. coli and can detect for other 3 bacteria such as Enterococcus spp., Staphylococcus spp., and Proteus spp.. Therefore, the developed qPCR and mPCR assays based on 16S rRNA gene expect that these will be a useful tool of more rapid and accurate diagnosis and screening in urinary tract infection.
Urinary tract infection (UTI) is the most bacterial infectious disease. UTI is annually estimated global incidence of at least 250 million. UTI is associated with many bacteria, Escherichia coli is the predominant causative uropathogen. Usually, virulence genes are often used for detection of uropathogenic bacteria by PCR methods. However, it has a detection limit because of possibility of mutation. To overcome the limitation of detection, 16S rRNA gene as having a conserved region for identification of bacteria is used. Quantification real-time PCR (qPCR) and multiplex PCR (mPCR) assays are powerful tool for diagnostic and research and these have advantages such as high specificity and sensitivity. In this study, 16S rRNA gene is compared with fimH gene in virulence genes for detection and counting of E. coli as major causative uropathogen using qPCR assay. A result of 28 patient samples have shown 100% detection rate for 16S rRNA gene and 82.1% detection rate for fimH gene. The result also confirmed E. coli cell counting by approximately 1.2 x 108 CFU/ml and 6.7 x 106 CFU/ml 16S rRNA gene and fimH gene, respectively. Furthermore, mPCR assay was developed by using 16S rRNA gene and also can detect in many uropathogen also in this study found the confirmed specificity in 4 out of total 200 strains. For more describing, this specificity of this method especially in E. coli and can detect for other 3 bacteria such as Enterococcus spp., Staphylococcus spp., and Proteus spp.. Therefore, the developed qPCR and mPCR assays based on 16S rRNA gene expect that these will be a useful tool of more rapid and accurate diagnosis and screening in urinary tract infection.
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