미토콘드리아 유전체를 이용한 버들매치속(Abbottina)과 모래주사속(Microphysogobio) 어류의 계통분류학적 연구 The complete mitochondrial genome of Korea gudgeon, Genus Microphysogobio and Genus Abbottina (Cypriniformes: Cyprinidae)원문보기
국내에 서식하는 모래주사속(Microphysogobio)과 버들매치속(Abbottina)의 어류는 형태적으로 유사하여 지속적으로 계통분류에 대한 논란이 있었다. 이후 분자계통학이 발달함에 따라 이들 두 속의 유전자를 이용한 계통 분석 연구결과가 이들의 현재 분류체계에 대한 논란에 힘을 실어주고 있다. 본 연구에서는 기존에 유전체가 규명되지 않은 모래주사속의 어류 4종(배가사리 M. longidorsalis, 돌마자 M. yaluensis, 여울마자 M. rapidus, 됭경모치 M. jeoni)과 버들매치속의 어류 1종(왜매치 A. springeri)의 ...
국내에 서식하는 모래주사속(Microphysogobio)과 버들매치속(Abbottina)의 어류는 형태적으로 유사하여 지속적으로 계통분류에 대한 논란이 있었다. 이후 분자계통학이 발달함에 따라 이들 두 속의 유전자를 이용한 계통 분석 연구결과가 이들의 현재 분류체계에 대한 논란에 힘을 실어주고 있다. 본 연구에서는 기존에 유전체가 규명되지 않은 모래주사속의 어류 4종(배가사리 M. longidorsalis, 돌마자 M. yaluensis, 여울마자 M. rapidus, 됭경모치 M. jeoni)과 버들매치속의 어류 1종(왜매치 A. springeri)의 미토콘드리아 유전체를 규명하였다. 이들 5종과 기존에 연구된 모래주사 M. koreensis, 버들매치 A. rivularis의 미토콘드리아 유전체의 구성, 단백질 암호화 유전자의 분석 및 계통분석을 통해 모래주사속과 버들매치속의 계통 관계를 확인해 본 결과 ND2 유전자의 종결코돈이 버들매치와 그 외 6종이 다른 점, 왜매치의 A+T contents의 경향이 버들매치와는 다르며 모래주사속의 어류와 유사한 점, 단백질 암호화 유전자의 아미노산별 사용 빈도 및 염기서열 유사성의 분석 결과 왜매치는 버들매치보다 모래주사속과 유사한 수치를 나타내는 점, 그리고 본 연구를 통해 미토콘드리아 유전체가 규명된 5종을 포함한 잉엇과 어류 226종과 외군인 메기목의 어류 4종의 미토콘드리아 단백질 암호화 유전자를 이용한 계통분석을 통해 동일속인 왜매치와 버들매치가 측계통을 이루는 반면 왜매치와 모래주사속 어류가 단계통을 형성하는 점 등을 확인하였다. 이러한 연구 결과를 바탕으로 버들매치속의 왜매치는 모래주사속의 어류와 훨씬 유사하다는 것을 알아내었다.
국내에 서식하는 모래주사속(Microphysogobio)과 버들매치속(Abbottina)의 어류는 형태적으로 유사하여 지속적으로 계통분류에 대한 논란이 있었다. 이후 분자계통학이 발달함에 따라 이들 두 속의 유전자를 이용한 계통 분석 연구결과가 이들의 현재 분류체계에 대한 논란에 힘을 실어주고 있다. 본 연구에서는 기존에 유전체가 규명되지 않은 모래주사속의 어류 4종(배가사리 M. longidorsalis, 돌마자 M. yaluensis, 여울마자 M. rapidus, 됭경모치 M. jeoni)과 버들매치속의 어류 1종(왜매치 A. springeri)의 미토콘드리아 유전체를 규명하였다. 이들 5종과 기존에 연구된 모래주사 M. koreensis, 버들매치 A. rivularis의 미토콘드리아 유전체의 구성, 단백질 암호화 유전자의 분석 및 계통분석을 통해 모래주사속과 버들매치속의 계통 관계를 확인해 본 결과 ND2 유전자의 종결코돈이 버들매치와 그 외 6종이 다른 점, 왜매치의 A+T contents의 경향이 버들매치와는 다르며 모래주사속의 어류와 유사한 점, 단백질 암호화 유전자의 아미노산별 사용 빈도 및 염기서열 유사성의 분석 결과 왜매치는 버들매치보다 모래주사속과 유사한 수치를 나타내는 점, 그리고 본 연구를 통해 미토콘드리아 유전체가 규명된 5종을 포함한 잉엇과 어류 226종과 외군인 메기목의 어류 4종의 미토콘드리아 단백질 암호화 유전자를 이용한 계통분석을 통해 동일속인 왜매치와 버들매치가 측계통을 이루는 반면 왜매치와 모래주사속 어류가 단계통을 형성하는 점 등을 확인하였다. 이러한 연구 결과를 바탕으로 버들매치속의 왜매치는 모래주사속의 어류와 훨씬 유사하다는 것을 알아내었다.
Genus Microphysogobio and genus Abbottina found living in Korea are similar in form, resulting in the controversy over the phylogenetic classification which has been around for a long time. As the molecular phylogeny has progressed, the result of phylogenetic analysis using the genes of the two genu...
Genus Microphysogobio and genus Abbottina found living in Korea are similar in form, resulting in the controversy over the phylogenetic classification which has been around for a long time. As the molecular phylogeny has progressed, the result of phylogenetic analysis using the genes of the two genus has been given more weight to the controversy. This study investigated the Mitochondrial genomes of a species (A. springeri) in genus Abbottina and four species (M. longidorsalis, M. yaluensis, M. rapidus, and M.jeoni) in genus Microphysogobio whose genomes had not been discovered. With these five species and M. koreensis and A. rivularis, previously studied, this study also examined the composition of their Mitochondrial genome, analyzed the protein coding gene, and identified the Phylogenetic relationship of Microphysogobio and Abbottina through phylogenetic analysis. As a result, the followings have been revealed. : Stop codon of ND2 gene in A. rivularis differs from that in the other six species. The tendency of A+T contents in A. springeri is similar to the Microphysogobio, while it differs from A. rivularis. The analysis of similarities to polynucleotide and the frequency of use depending on amino acid of the protein coding gene shows that A. springeri is more akin to A. rivularis than Microphysogobio. Finally, the phylogenetic analysis using the mitochondrial protein coding gene in Cypriniformes 226 species including the previous five species and Siluriformes four species in out group shows the fact that A. springeri and A. rivularis are in the same genus construct paraphyly, while A. springeri and Micorphysogobio form monophyly. In conclusion, this study has found that A. springeri is much closer to the Microphysogobio.
Genus Microphysogobio and genus Abbottina found living in Korea are similar in form, resulting in the controversy over the phylogenetic classification which has been around for a long time. As the molecular phylogeny has progressed, the result of phylogenetic analysis using the genes of the two genus has been given more weight to the controversy. This study investigated the Mitochondrial genomes of a species (A. springeri) in genus Abbottina and four species (M. longidorsalis, M. yaluensis, M. rapidus, and M.jeoni) in genus Microphysogobio whose genomes had not been discovered. With these five species and M. koreensis and A. rivularis, previously studied, this study also examined the composition of their Mitochondrial genome, analyzed the protein coding gene, and identified the Phylogenetic relationship of Microphysogobio and Abbottina through phylogenetic analysis. As a result, the followings have been revealed. : Stop codon of ND2 gene in A. rivularis differs from that in the other six species. The tendency of A+T contents in A. springeri is similar to the Microphysogobio, while it differs from A. rivularis. The analysis of similarities to polynucleotide and the frequency of use depending on amino acid of the protein coding gene shows that A. springeri is more akin to A. rivularis than Microphysogobio. Finally, the phylogenetic analysis using the mitochondrial protein coding gene in Cypriniformes 226 species including the previous five species and Siluriformes four species in out group shows the fact that A. springeri and A. rivularis are in the same genus construct paraphyly, while A. springeri and Micorphysogobio form monophyly. In conclusion, this study has found that A. springeri is much closer to the Microphysogobio.
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