VENUS-MSINDO software package를 이용한 QM + MM 직접 동역학 시뮬레이션을 통해 testosterone의 ESI-MS/MS을 시뮬레이션 하였다. 691.8 kcal/mol (30 eV)의 충돌에너지로 10,000개 이상의 trajectories을 구했고, 충돌 후 40 ps가 지나거나 아르곤과 ...
VENUS-MSINDO software package를 이용한 QM + MM 직접 동역학 시뮬레이션을 통해 testosterone의 ESI-MS/MS을 시뮬레이션 하였다. 691.8 kcal/mol (30 eV)의 충돌에너지로 10,000개 이상의 trajectories을 구했고, 충돌 후 40 ps가 지나거나 아르곤과 양이온 사이의 거리가 300 Å가 넘게 되면 반응을 중지시킨다. VMD프로그램을 이용하여 product ions의 구조와 fragmentation pathways를 시각화하였고, 특정 m/z ions를 형성하는 trajectories 수를 도시하여 theoretical mass spectrum를 얻었다. 4.9%의 비율로 reactive trajectories를 얻었고, 그 중 m/z 97, 109, 123를 각각 29.0%, 9.1%, 5.7%씩 형성하였다. 선행 실험 연구결과와 비교해보면, m/z 97, 109, 123, 271 그리고 81 peak들이 theoretical과 experimental mass spectra에서 공통적으로 나타난다. 이 peak들의 세기가 선행연구의 experimental mass spectra와 비교하여 정량적으로 일치하지는 않지만, m/z 97 peak의 세기가 가장 크게 나타나고 m/z 109 and 123 peak들 역시 충분한 세기로 나타난다. Testosterone-H+에서 생성된 m/z 97의 구조는 protonated 3-methyl-2-cyclopentene-1-one으로 추정되고, 밝혀진 mechanisms은 실험적으로 제안된 결과들과 일치한다. m/z 123 peak의 구조와 dissociation mechanisms도 실험적으로 제안된 결과와 잘 일치하는 반면, m/z 109 ion의 구조와 dissociation mechanisms은 실험적으로 제안된 결과와 일치하지 않았다. 전체 reactive trajectories의 대략 50%의 경우에 C9-C10 결합이 끊어졌고, 다른 C-C 결합 역시 C5-C6, C1-C10, C10-C19, C5-C6 결합 순으로 해리가 일어났다. 대부분의 product ions은 C=O-H+를 포함하는 6-탄소 고리를 포함하였으며, 그대로 남거나 5-탄소 고리로 재배열된 구조를 취한다.
VENUS-MSINDO software package를 이용한 QM + MM 직접 동역학 시뮬레이션을 통해 testosterone의 ESI-MS/MS을 시뮬레이션 하였다. 691.8 kcal/mol (30 eV)의 충돌에너지로 10,000개 이상의 trajectories을 구했고, 충돌 후 40 ps가 지나거나 아르곤과 양이온 사이의 거리가 300 Å가 넘게 되면 반응을 중지시킨다. VMD프로그램을 이용하여 product ions의 구조와 fragmentation pathways를 시각화하였고, 특정 m/z ions를 형성하는 trajectories 수를 도시하여 theoretical mass spectrum를 얻었다. 4.9%의 비율로 reactive trajectories를 얻었고, 그 중 m/z 97, 109, 123를 각각 29.0%, 9.1%, 5.7%씩 형성하였다. 선행 실험 연구결과와 비교해보면, m/z 97, 109, 123, 271 그리고 81 peak들이 theoretical과 experimental mass spectra에서 공통적으로 나타난다. 이 peak들의 세기가 선행연구의 experimental mass spectra와 비교하여 정량적으로 일치하지는 않지만, m/z 97 peak의 세기가 가장 크게 나타나고 m/z 109 and 123 peak들 역시 충분한 세기로 나타난다. Testosterone-H+에서 생성된 m/z 97의 구조는 protonated 3-methyl-2-cyclopentene-1-one으로 추정되고, 밝혀진 mechanisms은 실험적으로 제안된 결과들과 일치한다. m/z 123 peak의 구조와 dissociation mechanisms도 실험적으로 제안된 결과와 잘 일치하는 반면, m/z 109 ion의 구조와 dissociation mechanisms은 실험적으로 제안된 결과와 일치하지 않았다. 전체 reactive trajectories의 대략 50%의 경우에 C9-C10 결합이 끊어졌고, 다른 C-C 결합 역시 C5-C6, C1-C10, C10-C19, C5-C6 결합 순으로 해리가 일어났다. 대부분의 product ions은 C=O-H+를 포함하는 6-탄소 고리를 포함하였으며, 그대로 남거나 5-탄소 고리로 재배열된 구조를 취한다.
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