간암세포주에서의 김 추출물 처리에 의한 유전자 발현 분석 Effects of extracts from Porphyra yezoensis on gene expression profiles of human HepG₂ hepatocellular carcinoma cells원문보기
김(Porphyra yezoensis, Laver)의 MeOH 추출에 의한 유기용매별 분획물에서 항산화 활성이 높게 나타난 CHCl3 분획이 간암세포주의 세포증식 억제 효과 및 유전자 발현 양상을 분석하였다. 유기 용매별 분획의 항산화 활성은 시료의 농도가 증가할수록 DPPH에 대한 전자공여능도 증가하였으며, ED50은 CHCl3 분획에서 16.96 μg/ml로 가장 높게 나타났다. CHCl3 분획에 대한 ...
김(Porphyra yezoensis, Laver)의 MeOH 추출에 의한 유기용매별 분획물에서 항산화 활성이 높게 나타난 CHCl3 분획이 간암세포주의 세포증식 억제 효과 및 유전자 발현 양상을 분석하였다. 유기 용매별 분획의 항산화 활성은 시료의 농도가 증가할수록 DPPH에 대한 전자공여능도 증가하였으며, ED50은 CHCl3 분획에서 16.96 μg/ml로 가장 높게 나타났다. CHCl3 분획에 대한 폴리페놀 함량은 10.34 μg/mg으로 13.08 μg/mg의 물 분획 다음으로 높았다. 1,000 μg/ml의 CHCl3 분획이 24 시간 동안 처리된 간암세포주는 50% 세포증식이 억제되었으며, 48 시간 처리에서는 80%의 세포증식을 억제하였다. 50 μg/ml의 CHCl3 분획을 간암세포주에 6 및 24 시간 각각 처리한 유전자 발현 양상은 차이를 보이지 않았으나, 72 개 유전자의 발현 증가 및 34 개 유전자의 발현 감소를 확인하였다. 김의 효능과 연관지은 gene ontology 분석으로 항균작용에 대한 반응, 비타민 D 합성 및 영양물질에 대한 반응에 관련된 유의 유전자들를 탐색하여 IL-6R, CYP1A1, CYP24A1 유전자를 선정하였다. 또한 pathway 분석으로 ARNT와 SMC3 유전자가 상기 유전자들의 upsteam regulator일 가능성을 예측하였다. 한편 50 및 100 μg/ml의 CHCl3 분획이 처리된 간암세포주에서의 IL-6R와 CYP1A1 단백질의 실제 발현은 IL-6R의 경우 무처리구와 비교하여 1.5 배와 2 배의 증가, CYP1A1의 경우 1.7 배와 1.3 배의 발현 감소를 각각 Western blot으로 확인하였다.
김(Porphyra yezoensis, Laver)의 MeOH 추출에 의한 유기용매별 분획물에서 항산화 활성이 높게 나타난 CHCl3 분획이 간암세포주의 세포증식 억제 효과 및 유전자 발현 양상을 분석하였다. 유기 용매별 분획의 항산화 활성은 시료의 농도가 증가할수록 DPPH에 대한 전자공여능도 증가하였으며, ED50은 CHCl3 분획에서 16.96 μg/ml로 가장 높게 나타났다. CHCl3 분획에 대한 폴리페놀 함량은 10.34 μg/mg으로 13.08 μg/mg의 물 분획 다음으로 높았다. 1,000 μg/ml의 CHCl3 분획이 24 시간 동안 처리된 간암세포주는 50% 세포증식이 억제되었으며, 48 시간 처리에서는 80%의 세포증식을 억제하였다. 50 μg/ml의 CHCl3 분획을 간암세포주에 6 및 24 시간 각각 처리한 유전자 발현 양상은 차이를 보이지 않았으나, 72 개 유전자의 발현 증가 및 34 개 유전자의 발현 감소를 확인하였다. 김의 효능과 연관지은 gene ontology 분석으로 항균작용에 대한 반응, 비타민 D 합성 및 영양물질에 대한 반응에 관련된 유의 유전자들를 탐색하여 IL-6R, CYP1A1, CYP24A1 유전자를 선정하였다. 또한 pathway 분석으로 ARNT와 SMC3 유전자가 상기 유전자들의 upsteam regulator일 가능성을 예측하였다. 한편 50 및 100 μg/ml의 CHCl3 분획이 처리된 간암세포주에서의 IL-6R와 CYP1A1 단백질의 실제 발현은 IL-6R의 경우 무처리구와 비교하여 1.5 배와 2 배의 증가, CYP1A1의 경우 1.7 배와 1.3 배의 발현 감소를 각각 Western blot으로 확인하였다.
In the this study, the effects of CHCl3 fractions on anti-proliferation and gene expression profiles of HepG2 cells were analyzed on the basis of antioxidant activity in organic slovent fractions obtained from the main methanolic extract of P. yezoensis. The antioxidant activity estimated by measuri...
In the this study, the effects of CHCl3 fractions on anti-proliferation and gene expression profiles of HepG2 cells were analyzed on the basis of antioxidant activity in organic slovent fractions obtained from the main methanolic extract of P. yezoensis. The antioxidant activity estimated by measuring DPPH free radical scavenging activity increased in a dose-dependent manner, and the ED50 exhibited the highest 16.96 μg/ml in the CHCl3 fractions. The polyphenol content was 10.3 μg/mg in the CHCl3 fractions, and 13.08 μg/mg in the water fractions. The anti-proliferation effects of CHCl3 fractions toward HepG2 cells were 50% when treated for 24 hours at 1,000 μg/ml, and 80% when treated for 48 hours, respectively. Analysis of gene expression patterns shows that 72 genes were up-regulated, whereas 34 genes were down-regulated in HepG2 cells treated with 50 μg/ml of CHCl3 fractions for 6 and 24 hr. In addition, gene ontology analysis shows that CHCl3 fractions of P. yezoensis extracts affects to response to molecule of bacterial origin, vitamin D metabolic process, and response to nutrient. Thus, IL-6R, CYP1A1, CYP24A1 were selected as significant genes based on expression patterns of HepG2. Furthermore, pathway analysis indicates that ARNT and SMC3 might be considered as a upstream regulator. Finally, expression analysis of IL-6R and CYP1A1 in HepG2 cells was analyzed at the protein level after being treated with 50 and 100 μg/ml of CHCl3 fractions. Levels of IL-6R were increased by 1.5 and 2 times. and CYP1A1 decreased by 1.7 and 1.3 times based on Western blot analysis.
In the this study, the effects of CHCl3 fractions on anti-proliferation and gene expression profiles of HepG2 cells were analyzed on the basis of antioxidant activity in organic slovent fractions obtained from the main methanolic extract of P. yezoensis. The antioxidant activity estimated by measuring DPPH free radical scavenging activity increased in a dose-dependent manner, and the ED50 exhibited the highest 16.96 μg/ml in the CHCl3 fractions. The polyphenol content was 10.3 μg/mg in the CHCl3 fractions, and 13.08 μg/mg in the water fractions. The anti-proliferation effects of CHCl3 fractions toward HepG2 cells were 50% when treated for 24 hours at 1,000 μg/ml, and 80% when treated for 48 hours, respectively. Analysis of gene expression patterns shows that 72 genes were up-regulated, whereas 34 genes were down-regulated in HepG2 cells treated with 50 μg/ml of CHCl3 fractions for 6 and 24 hr. In addition, gene ontology analysis shows that CHCl3 fractions of P. yezoensis extracts affects to response to molecule of bacterial origin, vitamin D metabolic process, and response to nutrient. Thus, IL-6R, CYP1A1, CYP24A1 were selected as significant genes based on expression patterns of HepG2. Furthermore, pathway analysis indicates that ARNT and SMC3 might be considered as a upstream regulator. Finally, expression analysis of IL-6R and CYP1A1 in HepG2 cells was analyzed at the protein level after being treated with 50 and 100 μg/ml of CHCl3 fractions. Levels of IL-6R were increased by 1.5 and 2 times. and CYP1A1 decreased by 1.7 and 1.3 times based on Western blot analysis.
주제어
#김 Laver Porphyra yezoensis 유전자 발현 분석 Western blot HepG2
학위논문 정보
저자
오윤정
학위수여기관
호서대학교
학위구분
국내석사
학과
생화학과
지도교수
방인석
발행연도
2017
총페이지
iii, 56장
키워드
김 Laver Porphyra yezoensis 유전자 발현 분석 Western blot HepG2
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