돼지 생식기 호흡기 증후군 바이러스(PRRSV)는 세계적으로 널리 퍼져 있는 바이러스로 양돈산업에 큰 경제적 피해를 주고 있다. PRRSV의 지속적인 진화는 전세계적으로 PRRS 관리와 예방을 어렵게 한다. 이는 돼지농장에서 돌고 있는 PRRSV에 대한 감시의 중요성을 내포한다. 본 연구의 목적은 2012년부터 2017년까지 확인된 한국 PRRSV의 유전적 다양성과 진화를 ORF2-ORF7 서열을 기반으로 알아보았다. 연구 결과는 한국 PRRSV는 모든 구조단백질 유전자에 상당한 다양성이 존재함을 보여줬다. 또한 PRRSV-1과 PRRSV-2는 ...
돼지 생식기 호흡기 증후군 바이러스(PRRSV)는 세계적으로 널리 퍼져 있는 바이러스로 양돈산업에 큰 경제적 피해를 주고 있다. PRRSV의 지속적인 진화는 전세계적으로 PRRS 관리와 예방을 어렵게 한다. 이는 돼지농장에서 돌고 있는 PRRSV에 대한 감시의 중요성을 내포한다. 본 연구의 목적은 2012년부터 2017년까지 확인된 한국 PRRSV의 유전적 다양성과 진화를 ORF2-ORF7 서열을 기반으로 알아보았다. 연구 결과는 한국 PRRSV는 모든 구조단백질 유전자에 상당한 다양성이 존재함을 보여줬다. 또한 PRRSV-1과 PRRSV-2는 계통수 분석에서 독립적인 군을 형성하였다. 이는 한국 PRRSV는 독립적으로 진화함을 의미하였다. 선택압 분석 결과는 다양한 B세포 항원결정기, T세포 항원결정기, 글리코실화 부위의 양성선택적 진화를 확인하였다. 또한 중화 항원결정기에서 새로운 글리코실화가 나타남을 보았다. 종합적으로 본 논문은 한국 PRRSV의 진화에 대한 새로운 이해를 제공하였고, 구조단백질의 다양한 부위에서 중요한 진화적 특징을 확인하였다.
돼지 생식기 호흡기 증후군 바이러스(PRRSV)는 세계적으로 널리 퍼져 있는 바이러스로 양돈산업에 큰 경제적 피해를 주고 있다. PRRSV의 지속적인 진화는 전세계적으로 PRRS 관리와 예방을 어렵게 한다. 이는 돼지농장에서 돌고 있는 PRRSV에 대한 감시의 중요성을 내포한다. 본 연구의 목적은 2012년부터 2017년까지 확인된 한국 PRRSV의 유전적 다양성과 진화를 ORF2-ORF7 서열을 기반으로 알아보았다. 연구 결과는 한국 PRRSV는 모든 구조단백질 유전자에 상당한 다양성이 존재함을 보여줬다. 또한 PRRSV-1과 PRRSV-2는 계통수 분석에서 독립적인 군을 형성하였다. 이는 한국 PRRSV는 독립적으로 진화함을 의미하였다. 선택압 분석 결과는 다양한 B세포 항원결정기, T세포 항원결정기, 글리코실화 부위의 양성선택적 진화를 확인하였다. 또한 중화 항원결정기에서 새로운 글리코실화가 나타남을 보았다. 종합적으로 본 논문은 한국 PRRSV의 진화에 대한 새로운 이해를 제공하였고, 구조단백질의 다양한 부위에서 중요한 진화적 특징을 확인하였다.
Porcine reproductive and respiratory syndrome virus (PRRSV) is widely spread viral pathogen throughout most pig-producing countries and has caused tremendous economic losses in swine industry worldwide. Continuous evolution of PRRSV has made it difficult to control and prevent PRRS worldwide, which ...
Porcine reproductive and respiratory syndrome virus (PRRSV) is widely spread viral pathogen throughout most pig-producing countries and has caused tremendous economic losses in swine industry worldwide. Continuous evolution of PRRSV has made it difficult to control and prevent PRRS worldwide, which emphasizes an importance of monitoring currently circulating PRRSV. The objective of this study was to determine the genetic diversity and evolution of PRRSV circulating between 2012 and 2017 in Korea, through analysis of ORF2 to ORF7 encoding all structural proteins. The results showed that Korean PRRSV had a substantial genetic diversity in all structural genes. ORF2-7-based phylogenetic analysis indicated that both PRRSV-1 and PRRSV-2 between 2012 and 2017 formed unique clades in their phylogenies, implying the independent evolution of Korean PRRSV. Selective pressure profiles suggested the evolution of several B-cell epitopes, T-cell epitopes, and putative glycosylation sites under positive selection. In particular, neutralizing epitopes of minor structural proteins of the two viruses had evolved under positive selection. Furthermore, new potential glycosylation sites emerged in neutralizing epitopes of GP3 and GP4. Taken together, these data provide a novel insight into the evolution of Korean PRRSV and important evolutionary role at various regions of the viral structural proteins.
Porcine reproductive and respiratory syndrome virus (PRRSV) is widely spread viral pathogen throughout most pig-producing countries and has caused tremendous economic losses in swine industry worldwide. Continuous evolution of PRRSV has made it difficult to control and prevent PRRS worldwide, which emphasizes an importance of monitoring currently circulating PRRSV. The objective of this study was to determine the genetic diversity and evolution of PRRSV circulating between 2012 and 2017 in Korea, through analysis of ORF2 to ORF7 encoding all structural proteins. The results showed that Korean PRRSV had a substantial genetic diversity in all structural genes. ORF2-7-based phylogenetic analysis indicated that both PRRSV-1 and PRRSV-2 between 2012 and 2017 formed unique clades in their phylogenies, implying the independent evolution of Korean PRRSV. Selective pressure profiles suggested the evolution of several B-cell epitopes, T-cell epitopes, and putative glycosylation sites under positive selection. In particular, neutralizing epitopes of minor structural proteins of the two viruses had evolved under positive selection. Furthermore, new potential glycosylation sites emerged in neutralizing epitopes of GP3 and GP4. Taken together, these data provide a novel insight into the evolution of Korean PRRSV and important evolutionary role at various regions of the viral structural proteins.
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