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멜론(Cucumis melo L. 2n=2x=24)은 전 세계 생산량이 지속적으로 증가하고 있는 주요 과채류이다. 멜론은 높은 유전적 다양성을 지니고 있으며 다수의 품종군이 보고되어 있다. 본 연구에서는 국내외에서 수집된 144개 멜론 품종을 genotype-by-sequencing(GBS) 하여 총 10,949개의 SNP를 선발하였으며 이를 이용하여 주요 원예형질에 대한 전장유전체연관분석(GWAS)과 유전자형에 따른 품종군 분류를 수행하였다.
총 52가지 원예형질에 대하여 GWAS를 수행한 결과 과형질(과장, 과폭, 과형, 과중)과 높게 연관된 SNP 9개가 탐색되었다. 이들 SNP와 기존 보고된 QTL 간 genome의 물리적 위치를 비교 분석한 결과 6개의 SNP에서 일치성이 확인되었다. 또한 초형형질(마디 길이, 마디 수, 만장, 잎자루 길이, 과경, 과경장)의 경우 37개의 연관 SNP가 탐색되었다. 표현형과 SNP 정보를 기반으로 한 144개 품종의 PCA, ...

멜론(Cucumis melo L. 2n=2x=24)은 전 세계 생산량이 지속적으로 증가하고 있는 주요 과채류이다. 멜론은 높은 유전적 다양성을 지니고 있으며 다수의 품종군이 보고되어 있다. 본 연구에서는 국내외에서 수집된 144개 멜론 품종을 genotype-by-sequencing(GBS) 하여 총 10,949개의 SNP를 선발하였으며 이를 이용하여 주요 원예형질에 대한 전장유전체연관분석(GWAS)과 유전자형에 따른 품종군 분류를 수행하였다.
총 52가지 원예형질에 대하여 GWAS를 수행한 결과 과형질(과장, 과폭, 과형, 과중)과 높게 연관된 SNP 9개가 탐색되었다. 이들 SNP와 기존 보고된 QTL 간 genome의 물리적 위치를 비교 분석한 결과 6개의 SNP에서 일치성이 확인되었다. 또한 초형형질(마디 길이, 마디 수, 만장, 잎자루 길이, 과경, 과경장)의 경우 37개의 연관 SNP가 탐색되었다. 표현형과 SNP 정보를 기반으로 한 144개 품종의 PCA, hierarchical clustering, 그리고 Structure 분석 결과 표현형과 유전자형에 따른 분류 경향이 매우 유사하였으며 모든 분류 방법에서 크게 subsp. melo (Group A)와 subsp. agrestis (Group B)의 2개 아종으로 분류되었다. 하지만 subsp. melo 중 var. inodorus, var. cantalupensis, var. dudaim 등에 속하는 것으로 알려진 소수 품종들에 있어서는 기존 형태학적 분류 결과와 GBS-SNP 유전자형에 의한 분류 결과가 다소 상이 하였다. 본 연구를 통해 밝혀진 주요 원예형질 연관 SNP와 품종군 분류 결과는 향후 분자마커를 이용한 멜론 육종 및 품종분류체계 확립에 유용한 정보를 제공할 것이다.

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