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진화 알고리즘을 사용한 복수 염기서열 정렬
Multiple Sequence Aligmnent Genetic Algorithm 원문보기

Korean journal of microbiology = 미생물학회지, v.35 no.2, 1999년, pp.115 - 120  

김진 (건국대학교 자연과학대학 전산과학과) ,  송민동 (건국대학교 분자생물학과) ,  최홍식 (한림대 컴퓨터공학부) ,  장연아 (한림대 컴퓨터공학부)

초록
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3개 이상의 DNA 혹은 단백질의 염기서열을 정렬하는 복수 염기서열 정렬은 염기서열들 사이의 진화관계, gene regulation, 단백질의 구조와 기능에 관한 연구에 필수적인 도구이다. 복수 염기서열 정렬을 얻기 위한 기존의 방법은 progressive pairwise alignment 와같이 빠른 실행시간 내에 만족할 만한 복수 염기서열 정렬을 제공하는 방법과, 최적의 복수 여기서열 정렬을 제공하나 실행시간이 상대적으로 긴 dynamic programming 과 같은 방법 등이 있다. 본 논문에서는 진화 알고리즘을 사용하여 기존의 방법에서 제공하는 복수 염기서열 정렬을 짧은 시간내에보다 개선된 복수 염기서열 정렬을 획득하게 하는 방법을 제시하였으며, 진화 알고리즘의 구성내용을 설명하였으며, 실제의 염기서열을 사용하여 이 방법의 장점을 보였다.

Abstract AI-Helper 아이콘AI-Helper

Multiple Sequence Alignment of DNA and protem sequences is a imnport'mt tool in the study of molecular evolution, gene regulation. and prolein suucture-function relationships. Progressive pairwise alignment method generates multiple sequence alignment fast but not necessarily with optimal costs. Dyn...

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