[논문]Conformational Dynamics of Heme Pocket in Myoglobin and Hemoglobin

Kim, Seong-Heun; Heo, Jeong-Hee; Lim, Man-Ho

doi:10.5012/bkcs.2005.26.1.151

Conformational Dynamics of Heme Pocket in Myoglobin and Hemoglobin 원문보기

Bulletin of the Korean chemical society, v.26 no.1, 2005년, pp.151 - 156

Kim, Seong-Heun (Department of Chemistry and Chemistry Institute for Functional Materials, Pusan National University) , Heo, Jeong-Hee (Department of Chemistry and Chemistry Institute for Functional Materials, Pusan National University) , Lim, Man-Ho (Department of Chemistry and Chemistry Institute for Functional Materials, Pusan National University)

Abstract ▼ AI-Helper

The conformational dynamics of heme pocket, a small vacant site near the binding site of heme proteins -myoglobin (Mb) and hemoglobin (Hb), was investigated after photolysis of carbon monoxide from MbCO and HbCO in D$_2$O solution at 283 K by probing time-resolved vibrational spectra of photolyzed CO. Two absorption bands, arising from CO in the heme pocket, evolve nonexponentially in time. The band at higher energy side blue shifts and broadens with time and the one at lower energy side narrows significantly with a negligible shift. These spectral evolutions are induced by protein conformational changes following photolysis that modify structure and electric field of heme pocket, and ligand dynamics in it. The conformational changes affecting the spectrum of photolyzed CO in heme pocket likely modulates ligand-binding activity.

주제어

AI 본문요약
AI-Helper

* AI 자동 식별 결과로 적합하지 않은 문장이 있을 수 있으니, 이용에 유의하시기 바랍니다.

대상 데이터

7) relative to the probe pulse to recover isotropic absorption spectrum. The broadband transmitted probe pulse is detected with a N₂(L)-cooled HgCdTe array detector which consists of 64 elements. The array detector is mounted on the focal plane of a 320 mm IR monochromator with a 150 l/mm grating, resulting in a spectral resolution of ca.
This work was supported by grants from Korea Research Foundation Grant (KRF-2001-015- DP0228). This research used femtosecond aser system in the Central Laboratory at Pusan National University.

참고문헌 (52)

Springer, B. A.; Sligar, S. G.; Olson, J. S.; Phillips, G. N., Jr. Chem. Rev. 1994, 94, 699

상세보기
Perutz, M. F.; Mathews, F. S. J. Mol. Biol. 1966, 21, 199

상세보기
Takano, T. J. Mol. Biol. 1977, 110, 569

상세보기
Stryer, L. Biochemistry; W. H. Freeman and Co.: San Francisco, 1988; Vol. 3rd
Swiss-Prot Protein Database; National Center of Biotechnology Information: Bethesda, 1994
Lim, M.; Jackson, T. A.; Anfinrud, P. A. J. Chem. Phys. 1995, 102, 4355

상세보기
Lim, M.; Jackson, T. A.; Anfinrud, P. A. Science 1995, 269, 962

상세보기
Lim, M.; Jackson, T. A.; Anfinrud, P. A. Nature Struct. Biol. 1997, 4, 209

상세보기
Luisi, B.; Liddington, B.; Fermi, G.; Shibayama, N. J. Mol. Biol. 1990, 214, 7

상세보기
Phillips, S. E. V. J. Mol. Biol. 1980, 142, 531

상세보기
Shaanan, B. J. Mol. Biol. 1983, 171, 31

상세보기
Agmon, N.; Hopfield, J. J. J. Chem. Phys. 1983, 79, 2042

상세보기
Kuczera, K.; Lambry, J. C.; Martin, J. L.; Karplus, M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1993, 90, 5805
Lim, M.; Jackson, T. A.; Anfinrud, P. A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1993, 90, 5801
Petrich, J. W.; Lambry, J. C.; Kuczera, K.; Karplus, M.; Poyart, C.; Martin, J. L. Biochemistry 1991, 30, 3975

상세보기
Hagen, S. J.; Hofrichter, J.; Eaton, W. A. J. Phys. Chem. 1996, 100, 12008

상세보기
Steinbach, P. J.; Ansari, A.; Berendzen, J.; Braunstein, D.; Chu, K.; Cowen, B. R.; Ehrenstein, D.; Frauenfelder, H.; Johnson, J. B. et al. Biochemistry 1991, 30, 3988

상세보기
Tian, W. D.; Sage, J. T.; Srajer, V.; Champion, P. M. Phys. Rev. Lett. 1992, 68, 408

상세보기
Deak, J.; Chiu, H.; Lewis, C. M.; Miller, R. J. D. J. Phys. Chem. B 1998, 102, 6621

상세보기
Genberg, L.; Richard, L.; McLendon, G.; Miller, R. J. D. Science 1991, 251, 1051

상세보기
Findsen, E. W.; Scott, T. W.; Chance, M. R.; Friedman, J. M.; Ondrias, M. R. J. Am. Chem. Soc. 1985, 107, 3355

상세보기
Causgrove, T. P.; Dyer, R. B. Biochemistry 1993, 32, 11985

상세보기
Causgrove, T. P.; Dyer, R. B. J. Phys. Chem. 1996, 100, 3273

상세보기
Kim, S.; Jin, G.; Lim, M. Bull. Korean Chem. Soc. 2003, 24, 1470

원문보기 상세보기
Brunori, M.; Vallone, B.; Cutruzzola, F.; Travaglini-Allocatelli, C.; Berendzen, J.; Chu, K.; Sweet, R. M.; Schlichting, I. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2000, 97, 2058
Chu, K.; Vojtchovsky, J.; McMahon, B. H.; Sweet, R. M.; Berendzen, J.; Schlichting, I. Nature 2000, 403, 921

상세보기
Schott, F.; Lim, M.; Jackson, T. A.; Smirnov, A.; Soman, J.; Olson, J. S.; George, N.; Phillips, J.; Wulff, M.; Anfinrud, P. A. Science 2003, 300, 1944

상세보기
Lim, M.; Jackson, T. A.; Anfinrud, P. A. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 7946

상세보기
Anfinrud, P. A.; Lim, M.; Jackson, T. A. Proc. SPIE-Int. Soc. Opt. Eng. (Longer Wavelength Lasers and Applications) 1994, 2138, 107
Kim, S.; Jin, G.; Lim, M. J. Phys. Chem. B 2005, ASAP
Lim, M.; Wolford, M. F.; Hamm, P.; Hochstrasser, R. M. Chem. Phys. Lett. 1998, 290, 355

상세보기
Hamm, P.; Lim, L.; Hochstrasser, R. M. J. Phys. Chem. B 1998, 102, 6123

상세보기
Hamm, P.; Kaindl, R. A.; Stenger, J. Opt. Lett. 2000, 25, 1798

상세보기
Lim, M. Bull. Korean Chem. Soc. 2002, 23, 865

원문보기 상세보기
Alben, J. O.; Beece, D.; Bowne, S. F.; Doster, W.; Eisenstein, L.; Frauenfelder, H.; Good, D.; McDonald, J. D.; Marden, M. C.; Mo, P. P.; Reinisch, L.; Reynolds, A. H.; Shyamsunder, E.; Yue, K. T. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1982, 79, 3744
Anfinrud, P. A.; Han, C.; Hochstrasser, R. M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1989, 86, 8387
Petrich, J. W.; Poyart, C.; Martin, J. L. Biochemistry 1988, 27, 4049

상세보기
Henry, E. R.; Sommer, J. H.; Hofrichter, J.; Eaton, W. A. J. Mol. Biol. 1983, 166, 443

상세보기
Lian, T.; Locke, B.; Kholodenko, Y.; Hochstrasser, R. M. J. Phys. Chem. 1994, 98, 11648

상세보기
Venyaminov, S. Y.; Prendergast, F. G. Anal. Biochem. 1997, 248, 234

상세보기
Li, P.; Champion, P. M. Biophys. J. 1994, 66, 430

상세보기
Lim, M.; Jackson, T. A.; Anfinrud, P. A. J. Phys. Chem. 1996, 100, 12043

상세보기
Lingle, R., Jr.; Xu, X.; Zhu, H.; Yu, S. C.; Hopkins, J. B. J. Phys. Chem. 1991, 95, 9320

상세보기
Lingle, R., Jr.; Xu, X.; Zhu, H.; Yu, S. C.; Hopkins, J. B.; Straub, K. D. J. Am. Chem. Soc. 1991, 113, 3992

상세보기
Brooks, C. L., III; Karplus, M.; Pettitt, B. M. Proteins: a Theoretical Perspective of Dynamics, Structure and Thermodynamics; John Wiley & Sons: New York, 1988
Jackson, T. A.; Lim, M.; Anfinrud, P. A. Chem. Phys. 1994, 180, 131

상세보기
Ansari, A.; Jones, C. M.; Henry, E. R.; Hofrichter, J.; Eaton, W. A. Biochemistry 1994, 33, 5128

상세보기
Murray, L. P.; Hofrichter, J.; Henry, E. R.; Eaton, W. A. Biophy. Chem. 1988, 29, 63

상세보기
Meuwly, M.; Becker, O. M.; Stote, R.; Karplus, M. Biophys. Chem. 2002, 98, 183

상세보기
McMahon, M. T.; deDios, A. C.; Godbout, N.; Salzmann, R.; Laws, D. D.; Le, H.; Havlin, R. H.; Oldfield, E. J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 4784

상세보기
Rudolph, S. A.; Boyle, S. O.; Dresden, C. F.; Gill, S. J. Biochemistry 1972, 11, 1098

상세보기
Srajer, V.; Champion, P. M. Biochemistry 1991, 30, 7390

상세보기

저자의 다른 논문 :

원문 URL 링크

DOI : 10.5012/bkcs.2005.26.1.151 [무료]
대한화학회 : 저널> 권호
Korea Open Access Journals : 저널
AccessON : 저널

*원문 PDF 파일 및 링크정보가 존재하지 않을 경우 KISTI DDS 시스템에서 제공하는 원문복사서비스를 사용할 수 있습니다.

오픈액세스(OA) 유형

GOLD

오픈액세스 학술지에 출판된 논문

내보내기 메뉴

내보내기 구분

파일저장
인쇄
메일전송

구성항목

기본정보
상세정보

관리번호, 논문명, 저널/프로시딩명, 저자 , 발행년, 권, 호, 시작페이지, 끝페이지, 발행기관

저장형식

Text(ASCII format)
Excel format
RefWorks Direct Export
RIS format (for Reference Manager, ProCite, EndNote), Scholar's Aids, Mendeley

메일정보

받는사람 (필수): @
보내는사람 (선택): @
제목
내용: KISTI 검색결과 이메일 서비스

안내

총 건의 자료가 검색되었습니다.

다운받으실 자료의 인덱스를 입력하세요. (1-10,000)

검색결과의 순서대로 최대 10,000건 까지 다운로드가 가능합니다.

데이타가 많을 경우 속도가 느려질 수 있습니다.(최대 2~3분 소요)

다운로드 파일은 UTF-8 형태로 저장됩니다.
파일의 내용이 제대로 보이지 않을실 때는 웹브라우저 상단의 보기 -> 인코딩 -> 자동선택 여부를 확인하십시오.

Text(ASCII format)
Excel format

표제어: PCR

동의어: Packet Collision Rate

용어 설명 출처 목록 (6)

용어 설명: PCR은 세균 특이성이 있는 primer를 이용하여 적은 수의 세균이 있을지라도 쉽게 검출할 수 있는 유용한 방법이며, 이를 이용하여 구강 내 치면세균막이나 타액에서 직접 세균을 검출할 수 있게 되었다[8].

AI-Helper ※ AI-Helper는 을 사용합니다.

AI-Helper

안녕하세요, AI-Helper입니다. 좌측 "선택된 텍스트"에서 텍스트를 선택하여 요약, 번역, 용어설명을 실행하세요.
※ AI-Helper는 부적절한 답변을 할 수 있습니다.

연합인증