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프로테오믹스 기술의 현황 : 정량 비교 프로테엄 분석툴 원문보기

유전체소식 = KOGO news, v.7 no.3, 2007년, pp.24 - 32  

최종순 (한국기초과학지원연구원 프로테오믹스팀)

초록이 없습니다.

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문제 정의

  • 그러므로 과학자들은 그림 2에서 보는 것처럼 복잡성의 높은 차원은 유전자의 수만이 아니라 다양한 번역후 단백질의 수식화 과정이나 스케일 없는 단백질체 society의 네트워크에 기인한다고 생각한다. 따라서 프로테오믹스는 단백질들을 동정하고 정량하며 궁극적으로 단백질의 위치와 수식화, 상호작용, 활성 그리고 세포내 기능을 연구하는데 그 목적이 있다.
  • 현재, 다수의 유용한 도구들은 우리 손에 놓여 있고 전체 생명계를 들여다 볼 수 있어서 생물학자들이 보다 광범위한 방법으로 생각하기 시작하게 되었다 (그림 1). 현 기고문에서는 이러한 독특한 프로테옴 기술들에 대해서 알아보고 정의하고자하였고 언젠가 산업적으로 적용할 수 있는 통합학문으로서의 가능성에 대해 알아보고자 한다.
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질의응답

핵심어 질문 논문에서 추출한 답변
분석 프로테오믹스는 무엇으로 부터 시작되는가? 분석 프로테오믹스는 대개 단백질 또는 펩티드의 분리로부터 시작된다. 그림 3에서처럼 질량분석기에 의한 프로테옴 분석의 단순한 전략은 단백질 혼합체를 분리하여 trypsin 분해과정과 단백질 혼합체의 전체 효소 분해 후, 온라인 MS에 의한 단백질들의 동정을 위한 분리과정으로 구분된다.
질량분석기에 의한 프로테옴 분석의 단순한 전략은 어떻게 구분되는가? 분석 프로테오믹스는 대개 단백질 또는 펩티드의 분리로부터 시작된다. 그림 3에서처럼 질량분석기에 의한 프로테옴 분석의 단순한 전략은 단백질 혼합체를 분리하여 trypsin 분해과정과 단백질 혼합체의 전체 효소 분해 후, 온라인 MS에 의한 단백질들의 동정을 위한 분리과정으로 구분된다. 전자의 경우는 이차원 전기영동에 의해 단순히 수행되며 후자는 shot-gun proteomics 방법으로서 이차원 액체크로마토그래피가 연결된 온라인 질량분석기 (Liquid Chromatography-Mass Spectrometer)에 의해서 이루어진다.
단백질 혼합체를 분리하여 trypsin 분해과정은 무엇에 의해 이루어지는가? 그림 3에서처럼 질량분석기에 의한 프로테옴 분석의 단순한 전략은 단백질 혼합체를 분리하여 trypsin 분해과정과 단백질 혼합체의 전체 효소 분해 후, 온라인 MS에 의한 단백질들의 동정을 위한 분리과정으로 구분된다. 전자의 경우는 이차원 전기영동에 의해 단순히 수행되며 후자는 shot-gun proteomics 방법으로서 이차원 액체크로마토그래피가 연결된 온라인 질량분석기 (Liquid Chromatography-Mass Spectrometer)에 의해서 이루어진다. 그림 4에서 보는 것처럼 2-DE는 잘 알려진 단백질 분리 방법으로서 단백질들의 등전점 (isoelectric proint, pI)과 분자량 (molecular weight, Mr)의 성질에 따라 분리한다.
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