선택한 단어 수는 입니다.
최소 단어 이상 선택하여야 합니다.
최소 단어 이상 선택하여야 합니다.
선택한 단어 수는 30입니다.
최대 10 단어까지만 선택 가능합니다.
최대 10 단어까지만 선택 가능합니다.
문제 정의
- , 2013). 따라서 본연구는 한국산 곱상어의 분류학적 위치를 명확히 하기 위해 뉴질랜드(남태평양)에서 채집된 S. acanthias와의 형태 및 분자 비교를 수행하였다.
제안 방법
- 2015년 흑산도 근해에서 채집된 곱상어 4개체와 2014년에 뉴질랜드에서 채집된 곱상어 3개체에 대하여 계수 및 계측형질을 조사하였다. 계측은 Compagno (2001)와 Last et al.
- 곱상어속 2종이 별종임을 증명하기 위하여 미토콘드리아 DNA COI영역 540bp의 염기서열을 비교 분석하였다. 그 결과, 한국산 S.
- 7) (Hall, 1999)를 사용하였다. 염기서열 비교를 위해 NCBI에 등록된 북해산 S. acanthias 3개체, 동태평양에서 채집된 S. suckleyi 2개체와 외집단으로 돔발상어속의 도돔발상어(Squalus japonicus), 흉상어과의 무태상어(Carcharhinus brachyurus)의 염기서열을 수집하여 비교하였다. Neighbor- joining (NJ) tree (Saitou and Nei, 1987)는 Mega 5 (Tamura et al.
- , Korea)를 이용하여 정제하였다. 염기서열은 ABI Bigdye terminator cycle sequencing ready reaction kit v3.1 (Applied Biosystems)을 이용하여 판독하였다. 염기서열 정렬은 Clustal W (Thompson et al.
대상 데이터
- , 2007)로 증폭하였다. PCR 산물은 키트(Davinch-K CO. LTD., Korea)를 이용하여 정제하였다. 염기서열은 ABI Bigdye terminator cycle sequencing ready reaction kit v3.
- Neighbor-joining tree constructed from a 540-base pair mitochondrial DNA COI sequences for four Squalus species, with one out group Carcharhinus brachyurus. The tree was constructed using the Kimura 2-parameter model and 1000 bootstrap replications. The bottom bar indicates a genetic distance of 0.
- 관찰표본: PKU 10244, 264 mm total length (TL), 제주도 제주시, 2014년 2월 24일; PKU 10309, 538 mm total length (TL), 전라남도 신안군, 2014년 3월 8일; 2014년 4월 2일; PKU 53779, 1010 mm TL, 전라남도 신안군, 2015년 2월 10일; PKU 53781, 770 mm TL, 전라남도 신안군, 2015년 2월 10일. 비교표본: PKU 11305-11307, 840-920 mm TL, 뉴질랜드, 2014년 9월 17일
이론/모형
- suckleyi 2개체와 외집단으로 돔발상어속의 도돔발상어(Squalus japonicus), 흉상어과의 무태상어(Carcharhinus brachyurus)의 염기서열을 수집하여 비교하였다. Neighbor- joining (NJ) tree (Saitou and Nei, 1987)는 Mega 5 (Tamura et al., 2011)의 Kimura two-parameter model (Kimura, 1980)을 이용하여 작성하였으며 bootstrap을 1, 000번 수행하였다.
- 채집된 곱상어 3개체에 대하여 계수 및 계측형질을 조사하였다. 계측은 Compagno (2001)와 Last et al. (2007)의 방법을 따라 측정하였고, 꼬리지느러미 앞까지 척추골수는 X-ray (Sehwa Medical System SMS-CM, Korea)를 이용하여 계수하였다. 조사 후 표본은 부경대학교(Pukyoung National University, PKU)에 등록, 보관하였다.
- 1 (Applied Biosystems)을 이용하여 판독하였다. 염기서열 정렬은 Clustal W (Thompson et al., 1994)의 BioEdit (ver. 7) (Hall, 1999)를 사용하였다. 염기서열 비교를 위해 NCBI에 등록된 북해산 S.
성능/효과
- COI영역 540bp의 염기서열을 비교 분석하였다. 그 결과, 한국산 S. suckleyi, 뉴질랜드산 S. acanthias는 각각 종내 0.0- 0.4%, 0.0-0.2%의 낮은 유전 변이를 보였으나, S. suckleyi와 S. acanthias간의 유전 변이는 0.7-1.3%으로 종내 변이보다 큰 값을 보였다(Fig. 2). 특히, 540개 염기 중 117, 297, 405, 519번째의 4개 염기에서 두 종은 뚜렷이 구분되었다(Table 2).
- 4%)에서 잘 구분된다고 제안하였다. 그러나, 본 연구 결과는 이전 결과와 약간 차이를 보였는데, 본 연구에서는 PDI (11.4-17.1% TL in S. suckleyi vs. 15.7-16.4% TL in S. acanthias) 의 경우 종간 차이가 없었고, PDO (8.6-12.2% vs. 6.8-7.0%) 는 Ebert et al. (2010)과 반대되는 결과를 보였다. 이러한 차이는 Ebert et al.
- 3%)는 두종이 별종임을 지지해 준다. 나아가 Squalus 속 어류 15종의 COI영역을 비교한 결과, 종간 0.39-9.93%의 유전적 차이를 보이고(Ward et al., 2007), 연골어류는 경골어류와 달리 종간 유전 차이가 크지 않은 점(Martin and Palumbi, 1993) 등에서 두종은 충분히 별종으로 간주할 수 있다. 따라서 한국산 곱상어의 학명을 기존의 S.
- 특히, 540개 염기 중 117, 297, 405, 519번째의 4개 염기에서 두 종은 뚜렷이 구분되었다(Table 2). 동일 속의 Squalus japonicus와 Squalus nasutus간의 유전거리가 0.6% 인 점을 고려한다면 S. suckleyi와 S. acanthias 사이의 유전 거리(0.7-1.3%)는 두종이 별종임을 지지해 준다. 나아가 Squalus 속 어류 15종의 COI영역을 비교한 결과, 종간 0.
- , 2007), 연골어류는 경골어류와 달리 종간 유전 차이가 크지 않은 점(Martin and Palumbi, 1993) 등에서 두종은 충분히 별종으로 간주할 수 있다. 따라서 한국산 곱상어의 학명을 기존의 S. acanthias에서 S. suckleyi로 변경하고자 한다.
- 본 연구는 국내 서식하는 곱상어의 올바른 학명 사용을 위해 뉴질랜드산 곱상어와 형태 및 분자 비교를 수행하였으며, 그 결과 한국산 곱상어는 뉴질랜드산 곱상어(S. acanthias)와 형태( 척추골수 등) 및 분자(mtDNA COI)에서 잘 구분되는 S. suck- leyi인 것으로 확인되었다.
- 향후 보다 다양한 지역에서 더 많은 개체를 대상으로 면밀한 재검토가 필요하다고 생각된다. 본 연구에서는 S. suckleyi와 S. acanthias를 구분하는 계측 형질로 제1등지느러미 기저 중앙에서 배지느러미 기저 후단까지의 길이(DPO= 12.3-16.9 TL in S. suckleyi vs. 17.1-18.5 TL in S.acanthias), 배지느러미 기저 중앙에서 제2등지느러미 기저 후단까지의 길이(PDO= 8.6-12.2 TL in S. suckleyi vs. 6.8-7.0 TL in S. acanthias)로 확인되었다(Table 1). 한편, 꼬리지느러미 앞까지의 척추골수(한국산 S.
- 2). 특히, 540개 염기 중 117, 297, 405, 519번째의 4개 염기에서 두 종은 뚜렷이 구분되었다(Table 2). 동일 속의 Squalus japonicus와 Squalus nasutus간의 유전거리가 0.
후속연구
- acanthias는 미국 매사추세츠주(대서양) 및 호주 타즈매니아(남태평양)에서 채집된 개체를 사용하여 본 조사(뉴질랜드)와 멀리 떨어진 지역에서 채집된 표본을 대상으로 했기 때문으로 사료된다. 향후 보다 다양한 지역에서 더 많은 개체를 대상으로 면밀한 재검토가 필요하다고 생각된다. 본 연구에서는 S.
※ AI-Helper는 부적절한 답변을 할 수 있습니다.