$\require{mediawiki-texvc}$

연합인증

연합인증 가입 기관의 연구자들은 소속기관의 인증정보(ID와 암호)를 이용해 다른 대학, 연구기관, 서비스 공급자의 다양한 온라인 자원과 연구 데이터를 이용할 수 있습니다.

이는 여행자가 자국에서 발행 받은 여권으로 세계 각국을 자유롭게 여행할 수 있는 것과 같습니다.

연합인증으로 이용이 가능한 서비스는 NTIS, DataON, Edison, Kafe, Webinar 등이 있습니다.

한번의 인증절차만으로 연합인증 가입 서비스에 추가 로그인 없이 이용이 가능합니다.

다만, 연합인증을 위해서는 최초 1회만 인증 절차가 필요합니다. (회원이 아닐 경우 회원 가입이 필요합니다.)

연합인증 절차는 다음과 같습니다.

최초이용시에는
ScienceON에 로그인 → 연합인증 서비스 접속 → 로그인 (본인 확인 또는 회원가입) → 서비스 이용

그 이후에는
ScienceON 로그인 → 연합인증 서비스 접속 → 서비스 이용

연합인증을 활용하시면 KISTI가 제공하는 다양한 서비스를 편리하게 이용하실 수 있습니다.

교차결합 실험을 통한 루신 대응 조절 단백질의 4차 구조 분석
Analysis of quaternary structure of leucine-responsive regulatory protein (Lrp) by crosslink experiments 원문보기

Korean journal of microbiology = 미생물학회지, v.53 no.4, 2017년, pp.297 - 303  

이의호 (충남대학교 생화학과) ,  로버트 포쿠 (충남대학교 생화학과) ,  로이 트엔 응구엔 (충남대학교 생화학과) ,  이찬용 (충남대학교 생화학과)

초록
AI-Helper 아이콘AI-Helper

루신-대응 조절 단백질(Lrp)은 18.8 kDa의 분자량을 갖는 글로벌 조절 단백질로서 대장균과 같은 장내세균과에서 많은 대사작용 오페론의 기능적 활성도를 조절한다. 단백질의 4차 구조를 규명하기 위한 목적으로 Lrp단백질 코드하는 유전자가 삽입된 재조합 플라스미드 pQE vector를 발현시킨 6 ${\times}$ His-tag Lrp 야생형과 $^3H$로 표지된 Lrp를 분리 정제한 후 cross linker들인 glutaraldehyde, 1,2,3,4-diepoxy-butane (DEB), ethylene glycol bis (succinimidyl succinate) (EGS)으로 cross link 실험을 수행하여 Lrp가 $0.3{\mu}M$ 이하의 낮은 농도에서나 $5{\mu}M$의 높은 농도에서 이량체, 사량체, 육량체, 팔량체로 존재할 수 있음을 확인하였다.

Abstract ▼ AI-Helper 아이콘AI-Helper

Leucine-responsive regulatory protein (LRP) is a regulatory protein of molecular weight 18.8 kDa and is widely known to regulate many metabolic and functional activities of operons in Escherichia coli. The gene for Lrp from Escherichia coli in pQE system of 6 ${\times}$ His-tagging was ex...

주제어

#crosslink   #global regulatory protein   #leucine   #Lrp  

AI 본문요약
AI-Helper 아이콘 AI-Helper

* AI 자동 식별 결과로 적합하지 않은 문장이 있을 수 있으니, 이용에 유의하시기 바랍니다.

제안 방법

  • To get a more precise quaternary structure of Lrp, we performed cross link experiments with DEB (1, 2, 3, 4-diepoxybutane), a cross linker with space arm of length 4 Å. As shown in Fig.
본문요약 정보가 도움이 되었나요?

참고문헌 (25)

  1. Barton, G.J. 1993. ALSCRIPT: a tool to format multiple sequence alignments. Protein Eng. 6, 37-40. 

    상세보기 crossref

  2. Brinkman, A.B., Ettema, G.J.T., de Vos, W.M., and Van der Oost, J. 2003. The Lrp family of transcriptional regulators. Mol. Microbiol. 48, 287-294. 

    상세보기 crossref

  3. Calvo, J.M. and Matthews, R.G. 1994. The leucine-responsive regulatory protein, a global regulator of metabolism in Escherichia coli. Microbiol. Rev. 58, 466-490. 

    상세보기

  4. Chen, S. and Calvo, J.M. 2002. Leucine-induced dissociation of Escherichia coli Lrp hexadecamers to octamers. J. Mol. Biol. 318, 1031-1042. 

    상세보기 crossref

  5. Chen, S., Rosner, M.H., and Calvo, J.M. 2001. Leucine-regulated self-association of leucine-responsive regulatory protein (Lrp) from Escherichia coli. J. Mol. Biol. 312, 625-635. 

    상세보기 crossref

  6. Chen, S., Iannolo, M., and Calvo, J.M. 2005. Cooperative binding of the leucine-responsive regulatory protein (Lrp) to DNA. J. Mol. Biol. 345, 251-264. 

    상세보기 crossref

  7. Cui, Y., Midkiff, M.A., Wang, Q., and Calvo, J.M. 1996. The leucine responsive regulatory protein (Lrp) from Escherichia coli. Stoichiometry and minimal requirements for binding to DNA. J. Biol. Chem. 271, 6611-6617. 

    상세보기 crossref

  8. Cho, B.K., Barett, C.L., Knight, E.M., Park, Y.S., and Palasson, B.O. 2008. Genome scale reconstruction of the Lrp regulatory network in Escherichia coli. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 105, 19462-19467. 

    상세보기 crossref

  9. Deng, W., Wang, H., and Xie, J. 2011. Regulatory and pathogenesis roles of Mycobacterium Lrp/AsnC family transcriptional factors. J. Cell Biochem. 112, 2655-2662. 

    상세보기 crossref

  10. de los Rios, S. and Perona, J.J. 2007. Structure of the Escherichia coli leucine-responsive regulatory protein (Lrp) reveals a novel octameric assembly. J. Mol. Biol. 366, 1589-1602. 

    상세보기 crossref

  11. Ernsting, B.R., Atkinson, M.R., Matthews, R.G., and Ninfa, A.J. 1992. Characterization of the regulon controlled by the leucine responsive regulatory protein in Escherichia coli. J. Bacteriol. 174, 1109-1118. 

    상세보기 crossref

  12. Ettema, T.J.G., Brinkman, A.B., Tani, T.H., Rafferty, J.B., and van der Oost, J. 2002. A novel ligand-binding domain involved in regulation of amino acid metabolism in prokaryotes. J. Biol. Chem. 277, 37464-37468. 

    상세보기 crossref

  13. Hart, B.R. and Blumenthal, R.M. 2011. Unexpected coregulatory range for the global regulator Lrp of Escherichia coli and Proteus mirabillis. J. Bacteriol. 193, 1054-1064. 

    상세보기 crossref

  14. Hart, B.R., Mishra, P.K., Listner, R.E., Hinerman, J.M., Herr, A.B., and Blumenthal, R.M. 2011. Recognition of DNA by the helix-turn-helix global regulatory protein Lrp is modulated by the amino-terminus. J. Bacteriol. 193, 3794-3803. 

    상세보기 crossref

  15. Hung, S., Pierre, B., and Wesley, H.G. 2002. Global gene expression profiling in Escherichia coli K-12. The effects of leucineresponsive regulatory protein. J. Biol. Chem. 277, 40309-40323. 

    상세보기 crossref

  16. Landgraf, J.R., Wu, J., and Calvo, J.M. 1996. Effects of nutrition and growth rate on Lrp levels in Escherichia coli. J. Bacteriol. 178, 6930-6936. 

    상세보기 crossref

  17. Lee, C.Y., Kim, S.C., and Seo, C.H. 2010. Purification and fluorometric analysis of leucine-responsive regulatory protein from Escherichia coli. Korean J. Microbiol. 46, 104-108. 

  18. Newman, E.B., D'Ari, R., and Lin, R.T. 1992. The leucine-Lrp regulon in Escherichia coli: A global response in search of a raison d'etre. Cell 68, 618-620. 

  19. Newman, E.B, Lin, R.T., and D'Ari, R. 1996. The leucine/Lrp regulon. Annu. Rev. Microbiol. 49, 1513-1525. 

  20. Parry-Smith, D.J., Payne, A.W.R., Mitchie, A.D., and Attwood, T.K. 1998. CINEMA-a novel colour interactive editor for multiple alignments. Gene 221, 57-63. 

  21. Peterson, S.N., Dahlquist, F.W., and Reich, N.O. 2007. The role of high affinity non-specific DNA binding by Lrp in transcriptional regulation and DNA organization. J. Mol. Biol. 369, 1307-1317. 

    상세보기 crossref

  22. Philip, M.L., Sander, H.J.S., Svetlana, E.S., Arie, B.B., Willem, M.D., Van der Oost, J., David, W.R., and John, B.R. 2001. Crystal structure of the Lrp-like transcriptional regulator from the archaeon Pyrococcus furiosus. EMBO J. 20, 990-997. 

    상세보기 crossref

  23. Pokoo, R., Lee, E.H., and Lee, C.Y. 2014. Fluorescence characteristics of a tryptophan mutant of leucine-responsive regulatory protein. Korean J. Microbiol. 50, 275-280. 

    원문보기 상세보기 crossref

  24. Shimada, T., Saito, N., Maeda, M., Tanaka, K., and Ishihama, A. 2015. Expanded roles of leucine responsive regulatory protein in transcription regulation of the Escherichia coli gemome: Genomic SELEX screening regulation targets. Microb. Genom. 1, e000001. 

  25. Wang, Q. and Calvo, J.M. 1993. Lrp, a global regulatory protein of Escherichia coli, binds cooperatively to multiple sites and activates transcription of ilvIH. J. Mol. Biol. 229, 306-318. 

    상세보기 crossref

저자의 다른 논문 :

관련 콘텐츠

오픈액세스(OA) 유형

BRONZE

출판사/학술단체 등이 한시적으로 특별한 프로모션 또는 일정기간 경과 후 접근을 허용하여, 출판사/학술단체 등의 사이트에서 이용 가능한 논문

섹션별 컨텐츠 바로가기

AI-Helper ※ AI-Helper는 오픈소스 모델을 사용합니다.

AI-Helper 아이콘
AI-Helper
안녕하세요, AI-Helper입니다. 좌측 "선택된 텍스트"에서 텍스트를 선택하여 요약, 번역, 용어설명을 실행하세요.
※ AI-Helper는 부적절한 답변을 할 수 있습니다.

선택된 텍스트

맨위로