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다공성 알루미나 필터 표면에 형성된 나노구조물의 형상에 따른 찢어짐에 의한 세포파쇄 특성 평가
Evaluation of Mechanical Tearing based Cell Disruption Capability to Shape Nanostructures formed on Nanoporous Alumina Filter 원문보기

한국생산제조학회지 = Journal of the Korean Society of Manufacturing Technology Engineers, v.26 no.1, 2017년, pp.1 - 5  

이용훈 (Department of Advanced Mechanical Engineering, Kangwon National University) ,  한의돈 (Department of Advanced Mechanical Engineering, Kangwon National University) ,  김병희 (Department of Advanced Mechanical Engineering, Kangwon National University) ,  서영호 (Department of Advanced Mechanical Engineering, Kangwon National University)

Abstract AI-Helper 아이콘AI-Helper

This study investigated the mechanical tearing of a cell membrane using a nanostructured alumina filter for easy and quick mechanical cell disruption. Nanostructured alumina filters were prepared by a multi-step aluminum anodizing process and nanopore etching process. Six different types of nanostru...

주제어

AI 본문요약
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제안 방법

  • 다양한 형상 및 크기를 가지는 나노급 스파이크 알루미나 필터에 대한 세포 파쇄 특성을 비교하기 위하여 제작된 6가지 형상의 나노급 스파이크 알루미나 필터를 이용하여 세포파쇄 실험을 수행하였다. 파쇄 후 얻은 용출액은 각각 DNA, 단백질 정량화 방법을 통하여 용출액 내부의 DNA와 단백질의 농도를 측정하였다.
  • 본 연구에서는 나노구조화 기술 중에 저비용 및 대면적 나노패턴 구현에 용이한 알루미늄 양극산화 공정을 전해액의 종류, 전해액의 농도, 전압차, 온도에 따라 알루미나 나노포어의 직경이 달라지는 것을 이용하여[11,12] 다공성 알루미나 필터 표면에 나노구조물을 제작하고, 주변 전자장치의 도움 없이 단순히 주사기 필터홀더에 연결해 세포가 포함된 완충용액을 이송시켜 세포외피와 세포핵 모두 파쇄 할 수 있는 간단한 기계적 세포파쇄 방법을 제안하였다.
  • 다양한 형상과 크기로 제작된 나노급 스파이크를 가진 알루미나 필터는 상용 필터홀더에 결합된 뒤 주사기에 연결되었으며 공압을 통해 일정한 압력으로 세포가 포함된 PBS 용액을 이송시켰다. 세포 파쇄 후 얻은 용출액 내의 DNA와 단백질의 농도는 정량적으로 측정하여 비교하였다.
  • 파쇄 후 얻은 용출액 내의 DNA의 농도를 확인하기 위하여 DNA 분리키트(DNeasy DNA isolation kit, Qiagen)를 통해 용출액 내의 DNA를 분리한 후 DNA가 260 nm 파장의 빛을 흡수하는 성질을 이용하여 분광광도계로 흡광도를 측정하였다. 용출액 내의 단백질 농도 정량화를 위해 브래드포드 정량법(Bradford method)을 이용하였으며 세포 내 펩타이드, 티로신 등의 방향족 아미노산이 브래드포드 용액의 쿠마시블루 염색약과 반응을 할 때 최대 흡광 파장이 465 nm에서 595 nm로 바뀌게 된다.
  • 다양한 형상 및 크기를 가지는 나노급 스파이크 알루미나 필터에 대한 세포 파쇄 특성을 비교하기 위하여 제작된 6가지 형상의 나노급 스파이크 알루미나 필터를 이용하여 세포파쇄 실험을 수행하였다. 파쇄 후 얻은 용출액은 각각 DNA, 단백질 정량화 방법을 통하여 용출액 내부의 DNA와 단백질의 농도를 측정하였다. Fig.
  • 표면에 나노구조물이 형성된 나노급 스파이크 알루미나 필터를 이용해 세포 외피의 파쇄와 세포핵의 파쇄를 한꺼번에 수행할 수 있는 기계적 세포파쇄를 제안하였다. 다단계 알루미늄 양극산화 공정을 통해 1 µm와 10 µm의 높이를 가진 나노급 스파이크를 각각 다른 형상을 가지도록 제작하였다.

대상 데이터

  • 2(c)는 장벽층이 제거된 나노급 스파이크 알루미나 필터의 바닥 부분이며 관통형 나노채널로 제작된 것을 확인할 수 있다. 다양한 형상 및 크기를 가지는 나노급 스파이크 알루미나 필터에 대한 세포 파쇄 특성을 비교하기 위하여 Table 1과 같이 2차 알루미늄 양극산화 공정을 통하여 1, 10 µm 높이의 나노급 스파이크를 제작하였고, 2차 나노포어 확장 공정 시간을 조절하여 ridge, ridge spike, spike 세 종류를 제작하여 총 6가지 형상으로 세포 파쇄 실험을 준비하였다. Fig.
  • 제작된 나노급 스파이크 알루미나 필터를 통해 세포를 파쇄하기 위하여 NIH3T3 쥐 섬유아세포를 이용하였다. 세포는 37°C, 5% CO₂의 농도가 유지된 인큐베이터(SANYO, MCO19A/C)에10%의 FBS(fetal bovine serum, Lonza)와 1%의 Penicillinstreptomycin(Lonza)이 포함된 DMEM(Dulbecco`s Modified Eagle Medium, Lonza)에서 배양되었으며, 세포파쇄를 위해 완충액(phosphate buffered saline; PBS) 1 ml에 1×106개의 세포를 준비하였다. 다양한 형상과 크기로 제작된 나노급 스파이크를 가진 알루미나 필터는 상용 필터홀더에 결합된 뒤 주사기에 연결되었으며 공압을 통해 일정한 압력으로 세포가 포함된 PBS 용액을 이송시켰다.
  • 제작된 나노급 스파이크 알루미나 필터를 통해 세포를 파쇄하기 위하여 NIH3T3 쥐 섬유아세포를 이용하였다. 세포는 37°C, 5% CO₂의 농도가 유지된 인큐베이터(SANYO, MCO19A/C)에10%의 FBS(fetal bovine serum, Lonza)와 1%의 Penicillinstreptomycin(Lonza)이 포함된 DMEM(Dulbecco`s Modified Eagle Medium, Lonza)에서 배양되었으며, 세포파쇄를 위해 완충액(phosphate buffered saline; PBS) 1 ml에 1×106개의 세포를 준비하였다.

데이터처리

  • 제작된 나노급 스파이크 알루미나 필터를 필터홀더에 결합한 후 주사기로 1×106 개의 세포를 포함한 완충용액을 주입하여 세포 파쇄를 수행하였다. 6가지 형상의 나노급 스파이크 알루미나 필터를 이용하여 세포파쇄 후 얻은 용출액의 DNA와 단백질의 농도는 정량적 방법으로 측정한 뒤 비교하였다. 실험 결과, 세포 외피의 파쇄율은 나노급 스파이크의 형상이 첨예할수록 높았으며, 나노급 스파이크의 길이가 길수록, 파쇄된 세포의 세포막이 적층된 후에도 세포파쇄가 가능하였다.

이론/모형

  • 파쇄 후 얻은 용출액 내의 DNA의 농도를 확인하기 위하여 DNA 분리키트(DNeasy DNA isolation kit, Qiagen)를 통해 용출액 내의 DNA를 분리한 후 DNA가 260 nm 파장의 빛을 흡수하는 성질을 이용하여 분광광도계로 흡광도를 측정하였다. 용출액 내의 단백질 농도 정량화를 위해 브래드포드 정량법(Bradford method)을 이용하였으며 세포 내 펩타이드, 티로신 등의 방향족 아미노산이 브래드포드 용액의 쿠마시블루 염색약과 반응을 할 때 최대 흡광 파장이 465 nm에서 595 nm로 바뀌게 된다. 파쇄 후 얻은 용출액과 브래드포드 용액을 반응시킨 뒤 595 nm 파장에서의 흡광도를 분광광도계로 측정하였다.
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질의응답

핵심어 질문 논문에서 추출한 답변
화학적 세포파쇄 방법의 특징은 무엇인가? 분자생물학, 의료, 바이오 분야 등에서 세포 내에 존재하는 DNA, RNA, 바이러스, 단백질 등을 추출하여 연구하기 위해서는 세포파쇄(cell lysis or cell disruption)는 필수적인 과정이며 원리에 따라 화학적, 전기적, 기계적인 방법으로 나눌 수 있다[1,2]. 화학적 세포파쇄 방법은 일반적으로 세포 용해액을 통해 세포 외피 및 세포핵을 화학적으로 분해시켜 세포를 파쇄 하지만 과정이 복잡하며, 용해액 이외의 잔여물이 발생하고, 용해 과정 중 DNA와 단백질 등이 오염될 수 있는 단점을 가지고 있다[2,3]. 전기적 세포파쇄 방법으로는 전기장을 이용하여 세포를 파쇄 하는 방법이 있으며,세포파쇄에 필요한 1 kV/cm 이상의 높은 전기장을 얻기 위한 외부 전기장치가 필요하고, LOC(lap on a chip)을 위한 소규모 파쇄에 적합하다[1,4].
기계적 세포파쇄 방법의 특징은 무엇인가? 전기적 세포파쇄 방법으로는 전기장을 이용하여 세포를 파쇄 하는 방법이 있으며,세포파쇄에 필요한 1 kV/cm 이상의 높은 전기장을 얻기 위한 외부 전기장치가 필요하고, LOC(lap on a chip)을 위한 소규모 파쇄에 적합하다[1,4]. 기계적 세포파쇄 방법으로는 마이크로 비드에 의한 충격이나 블레이드 회전에 의한 전단력으로 세포를 파쇄[5]하는 등 다양한 방법이 있는데, 세포파쇄를 위한 별도의 장치가 필요하고 파쇄시간이 길며 파쇄 후 용출액에 파쇄 되지 않은 세포들이 존재하는 단점을 가지고 있다. 이러한 기계적 파쇄의 단점을 보완하기 위하여 화학약품이나 외부장비의 도움 없이 실리콘의 습식식각을 통해 제작된 마이크로, 나노 구조물을 이용하여 세포를 파쇄 하는 연구들이 진행되고 있다[6,7].
나노 구조물을 이용하여 세포를 파쇄하는 방법의 장단점은 무엇인가? 이러한 기계적 파쇄의 단점을 보완하기 위하여 화학약품이나 외부장비의 도움 없이 실리콘의 습식식각을 통해 제작된 마이크로, 나노 구조물을 이용하여 세포를 파쇄 하는 연구들이 진행되고 있다[6,7]. 이는 다른 장치 없이 간단하게 유입되는 다량의 세포를 기계적으로 파쇄하고 화학적인 단계를 거치지 않기 때문에 DNA와 단백질을 오염 없이 얻을 수 있는 장점을 가지고 있다. 하지만 마이크로 채널 또는 필터의 간격이 평균 3 µm 이상이기 때문에 10~20 µm 크기의 세포가 변형이 되어 마이크로 채널을 통과하거나 5~10 µm 크기의 세포핵이 파쇄되지 않는 단점이 있다[8-10].
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참고문헌 (13)

  1. Lee, D. W., Cho, Y. H., 2008, A Continuous Electrical Cell lysis Chip using a DC Bias Voltage for Cell Disruption and Electroosmotic Flow, KSME, 32:10 831-835. 

  2. Ha, S. M., Cho, W., Ahn, Y. M., Hwang, S. Y., 2010, Study on Microbiochip for Buccal Cell Lysis and DNA Purification, KSME, 34:12 1785-1791. 

  3. Kim, J., Hong, J. W., Kim, D. P., Shin, Jeniffer H., Park, I. K., 2012, Nanowire-Integrated Microfluidic Devices for Facile and Reagent-free Mechanical Cell Lysis, Lap Chip, 12 2914-2921. 

  4. Jen, C. P., Amstislavskaya, Tamara. g., Liu, Y. H., Hsiao, J. H., Chen, Y. H., 2012, Single-cell Electric Lysis on an Electroosmotic-Driven Fig Microfluidic Chip with Arrays of Microwells, Sensors, 12 6967-6977. 

  5. Yun, S. S., Yoon, S. Y., Song, M. K., Im, S. H., Lee, J. H., Yang, S., 2010, Handheld Mechanical Cell Lysis Chip with Ultra-sharp Silicon Nano-Blade Arrays for Rapid Intracellular Protein Extraction, Lap chip, 10 1442-1446. 

  6. So, H. Y., Lee, K. W., Seo, Y. H., Murthy, N., Pisano, Albert. P., 2014, Hierarchical Silicon Nanospikes Membrane for Rapid and High-Throughput Mechanical Cell Lysis, ACSAMI, 6 6993-6997. 

  7. Carlo, D. D., Jeong, K. H., Lee, Luke. P., 2003, Reagentless Mechanical Cell Lysis by Nanoscale Barbs in Microchannels for Sample Preparation, Lap chip, 3 287-291. 

  8. Brown, R. B., Audet, J., 2008, Current Techniques for Single-cell Lysis, J. R. Soc. Interface, 5 S131-S138. 

  9. Tsukada, K., Sekizuka, E., Oshio, C., Minamitani, H., 2001, Direct Measurement of Erythrocyte Deformability in Diabetes Mellitus with a Transparent Microchannel Capillary Model and High-Speed Video Camera System, Microvascular Research, 61 231-239. 

  10. Hou, H. W., Li, Q. S., Lee, G. Y. H., Kumar, A. P., Ong, C. N., Lim, C. T., 2009, Deformability Study of Breast Cancel Cells Using Microfluidics, Biomed Microdevices, 11 557-564. 

  11. Shin, H, G., Kwon, J. T., Seo, Y. H., Kim, B. H., 2008, Properties of Pore Generation by Variation of Temperature in AAO Process, Proceeding of KSMTE, 371-374. 

  12. Park, Y. M., Shin, H. G., Seo, Y. H., Kim, B. H., 2009, Fabrication of Polymer Replica with Nano Patterns Using Porous Alumina Structure, Proceeding of KSMTE, 456-459. 

  13. Sambrook, J., Russell, David. W., 1982, Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor, New York, USA. 

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