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라만 분광법을 활용한 세균 검측 기술
Rapid bacterial identification using Raman spectroscopy 원문보기

Korean journal of microbiology = 미생물학회지, v.53 no.2, 2017년, pp.71 - 78  

노지현 (연세대학교 환경공학과) ,  이태권 (연세대학교 환경공학과)

초록
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라만 분광법은 레이저가 분자의 공명에 의해 산란되는 특성을 이용하여 세포 내 지질, 핵산, 단백질 등의 구성물질을 신속하게 측정할 수 있어 단세포 수준의 세균 검측에 적합한 기술로 알려져 있다. 세포 구성물질에 대한 높은 특이성과 민감성 때문에 라만 스펙트라(spectra)만으로 일부 종 수준의 세균 계통분석이 가능하다. 또한 탄소-13, 수소-2 등의 동위원소를 동시에 사용하였을 경우 단세포의 생리적 활성 변화에 대한 정량평가에 활용 할 수 있다. 라만 분광법을 이용한 세균 검측 이후에도 광학핀셋과 미세유체칩과 연계하여 관심 있는 난배 양성 세균을 선택적으로 분리하거나 단세포 유전체 연구에 이용할 수 있을 정도로 응용 범위가 넓다. 본 총설에서는 라만 분광법을 활용한 미생물 분석 연구의 정확한 이해를 돕고자 기존의 연구를 중심으로 라만 분광법의 특성과 응용분야에 대해서 검토, 정리하였다.

Abstract AI-Helper 아이콘AI-Helper

Raman microspectroscopy is a promising tool for microbial analysis at single cell level since it can rapidly measure the cell materials including lipids, nucleic acids, and proteins by measuring the inelastic scattering of a molecule irradiated by monochromatic lights. Using Raman spectra provides h...

주제어

AI 본문요약
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문제 정의

  • 1). 본 총설에서는 라만 분광법의 분석 원리, 방법, 미생물 생태학 분야에서 응용 방법에 대해 다루고자 한다.
  • 본 총설에서는 라만 분광법의 원리와 미생물 분석에 응용할 수 있는 다양한 분야에 대해서 기존 연구 결과들을 바탕으로 정리하였다. 라만 분광법은 별도의 전처리 과정 없이 세포 구성물질을 실시간 수준으로 조사 가능하기 때문에 단세포 수준의 검측 기기로써 가치가 매우 높다.
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질의응답

핵심어 질문 논문에서 추출한 답변
라만 분광법의 특징은? 라만 분광법은 레이저가 분자의 공명에 의해 산란되는 특성을 이용하여 세포 내 지질, 핵산, 단백질 등의 구성물질을 신속하게 측정할 수 있어 단세포 수준의 세균 검측에 적합한 기술로 알려져 있다. 세포 구성물질에 대한 높은 특이성과 민감성 때문에 라만 스펙트라(spectra)만으로 일부 종 수준의 세균 계통분석이 가능하다.
세균은 어떠한 환경에서 군집을 이루는가? 세균은 대기, 토양, 물 뿐만 아니라 식물과 동물을 포함한 거의 모든 환경에 군집(community)을 이루며 살아가며, 군집은 그 구조와 다양성에 따라 서로 다른 기능으로 나타나게 된다. 군집을 이루는 기본 단위는 세균 한 종(species)이며, 연구자들은 관심 있는 종을 분리 및 배양 연구를 통해 환경의 기능을 추론한다.
라만 분광법이 세균 계통분석에 사용될 수 있는 이유는? 라만 분광법은 레이저가 분자의 공명에 의해 산란되는 특성을 이용하여 세포 내 지질, 핵산, 단백질 등의 구성물질을 신속하게 측정할 수 있어 단세포 수준의 세균 검측에 적합한 기술로 알려져 있다. 세포 구성물질에 대한 높은 특이성과 민감성 때문에 라만 스펙트라(spectra)만으로 일부 종 수준의 세균 계통분석이 가능하다. 또한 탄소-13, 수소-2 등의 동위원소를 동시에 사용하였을 경우 단세포의 생리적 활성 변화에 대한 정량평가에 활용 할 수 있다.
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참고문헌 (44)

  1. Amann, R. and Fuchs, B.M. 2008. Single-cell identification in microbial communities by improved fluorescence in situ hybridization techniques. Nat. Rev. Microbiol. 6, 339-348. 

  2. Ashton, L., Lau, K., Winder, C.L., and Goodacre, R. 2011. Raman spectroscopy: Lighting up the future of microbial identification. Future Microbiol. 6, 991-997. 

  3. Assaf, A., Cordella, C.B., and Thouand, G. 2014. Raman spectroscopy applied to the horizontal methods ISO 6579: 2002 to identify Salmonella spp. in the food industry. Anal. Bioanal. Chem. 406, 4899-4910. 

  4. Berry, D., Mader, E., Lee, T.K., Woebken, D., Wang, Y., Zhu, D., Palatinszky, M., Schintlmeister, A., Schmid, M.C., Hanson, B. T., et al. 2015. Tracking heavy water (D2O) incorporation for identifying and sorting active microbial cells. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 112, E194-203. 

  5. Buijtels, P.C., Willemse-Erix, H.F., Petit, P.L., Endtz, H.P., Puppels, G.J., Verbrugh, H.A., van Belkum, A., van Soolingen, D., and Maquelin, K. 2008. Rapid identification of mycobacteria by Raman spectroscopy. J. Clin. Microbiol. 46, 961-965. 

  6. Chen, P., Tian, Q., Baek, S., Shang, X., Park, A., Liu, Z., Yao, X., Wang, J., Wang, X., and Cheng, Y. 2011. Laser Raman detection of platelet as a non-invasive approach for early and differential diagnosis of alzheimer's disease. Laser Phys. Lett. 8, 547. 

  7. Deng, H., Bloomfield, V.A., Benevides, J.M., and Thomas, G.J. 1999. Dependence of the Raman signature of genomic B­DNA on nucleotide base sequence. Biopolymers 50, 656-666. 

  8. Eder, S.H., Gigler, A.M., Hanzlik, M., and Winklhofer, M. 2014. Sub-micrometer-scale mapping of magnetite crystals and sulfur globules in magnetotactic bacteria using confocal Raman micro-spectrometry. PLoS One 9, e107356. 

  9. Edwards, H.G.M., Hutchinson, I.B., Ingley, R., Parnell, J., Vitek, P., and Jehli?ka, J. 2013. Raman spectroscopic analysis of geological and biogeological specimens of relevance to the exomars mission. Astrobiology 13, 543-549. 

  10. Eichorst, S.A., Strasser, F., Woyke, T., Schintlmeister, A., Wagner, M., and Woebken, D. 2015. Advancements in the application of NanoSIMS and Raman microspectroscopy to investigate the activity of microbial cells in soils. FEMS Microbiol. Ecol. 91, fiv106. 

  11. Hoppe, P., Cohen, S., and Meibom, A. 2013. Nanosims: Technical aspects and applications in cosmochemistry and biological geochemistry. Geostand. Geoanal. Res. 37, 111-154. 

  12. Huang, W.E., Ferguson, A., Singer, A.C., Lawson, K., Thompson, I.P., Kalin, R.M., Larkin, M.J., Bailey, M.J., and Whiteley, A.S. 2009a. Resolving genetic functions within microbial populations: in situ analyses using rRNA and mRNA stable isotope probing coupled with single-cell Raman-fluorescence in situ hybridization. Appl. Environ. Microbiol. 75, 234-241. 

  13. Huang, W.E., Li, M., Jarvis, R.M., Goodacre, R., and Banwart, S.A. 2010. Shining light on the microbial world: The application of Raman microspectroscopy. Adv. Appl. Microbiol. 70, 153-186. 

  14. Huang, W.E., Stoecker, K., Griffiths, R., Newbold, L., Daims, H., Whiteley, A.S., and Wagner, M. 2007. Raman­FISH: Combining stable­isotope Raman spectroscopy and fluorescence in situ hybridization for the single cell analysis of identity and function. Environ. Microbiol. 9, 1878-1889. 

  15. Huang, W.E., Ward, A.D., and Whiteley, A.S. 2009b. Raman tweezers sorting of single microbial cells. Environ. Microbiol. Rep. 1, 44-49. 

  16. Ibrahim, S.F. and van den Engh, G. 2007. Flow cytometry and cell sorting, pp. 19-39. Cell separation, Springer. 

  17. Klos, S., Kampe, B., Sachse, S., Ro?sch, P., Straube, E., Pfister, W., Kiehntopf, M., and Popp, J. 2013. Culture independent Raman spectroscopic identification of urinary tract infection pathogens: A proof of principle study. Anal. Chem. 85, 9610-9616. 

  18. Kong, K., Kendall, C., Stone, N., and Notingher, I. 2015. Raman spectroscopy for medical diagnostics - from in-vitro biofluid assays to in-vivo cancer detection. Adv. Drug Deliv. Rev. 89, 121-134. 

  19. Kubryk, P., Ko?lschbach, J.S., Marozava, S., Lueders, T., Meckenstock, R.U., Niessner, R., and Ivleva, N.P. 2015. Exploring the potential of stable isotope (resonance) Raman microspectroscopy and surface-enhanced Raman scattering for the analysis of microorganisms at single cell level. Anal. Chem. 87, 6622-6630. 

  20. Lewis, I.R. and Edwards, H. 2001. Handbook of Raman spectroscopy: From the research laboratory to the process line, CRC Press. 

  21. Li, M., Canniffe, D.P., Jackson, P.J., Davison, P.A., FitzGerald, S., Dickman, M.J., Burgess, J.G., Hunter, C.N., and Huang, W.E. 2012. Rapid resonance Raman microspectroscopy to probe carbon dioxide fixation by single cells in microbial communities. ISME J. 6, 875-885. 

  22. Munchberg, U., Rosch, P., Bauer, M., and Popp, J. 2014. Raman spectroscopic identification of single bacterial cells under antibiotic influence. Anal. Bioanal. Chem. 406, 3041-3050. 

  23. Maquelin, K., Kirschner, C., Choo-Smith, L.P., van den Braak, N., Endtz, H.P., Naumann, D., and Puppels, G. 2002. Identification of medically relevant microorganisms by vibrational spectroscopy. J. Microbiol. Methods 51, 255-271. 

  24. Meisel, S., Stockel, S., Elschner, M., Melzer, F., Rosch, P., and Popp, J. 2012. Raman spectroscopy as a potential tool for detection of Brucella spp. in milk. Appl. Environ. Microbiol. 78, 5575-5583. 

  25. Meisel, S., Stockel, S., Elschner, M., Rosch, P., and Popp, J. 2011. Assessment of two isolation techniques for bacteria in milk towards their compatibility with Raman spectroscopy. Analyst. 136, 4997-5005. 

  26. Muhamadali, H., Chisanga, M., Subaihi, A., and Goodacre, R. 2015. Combining Raman and FT-IR spectroscopy with quantitative isotopic labeling for differentiation of E. coli cells at community and single cell levels. Anal. Chem. 87, 4578-4586. 

  27. Pahlow, S., Meisel, S., Cialla-May, D., Weber, K., Rosch, P., and Popp, J. 2015. Isolation and identification of bacteria by means of Raman spectroscopy. Adv. Drug Deliv. Rev. 89, 105-120. 

  28. Pichardo-Molina, J., Frausto-Reyes, C., Barbosa-Garcia, O., Huerta- Franco, R., Gonzalez-Trujillo, J., Ramirez-Alvarado, C., Gutierrez- Juarez, G., and Medina-Gutierrez, C. 2007. Raman spectroscopy and multivariate analysis of serum samples from breast cancer patients. Lasers Med. Sci. 22, 229-236. 

  29. Rosch, P., Harz, M., Schmitt, M., Peschke, K.D., Ronneberger, O., Burkhardt, H., Motzkus, H.W., Lankers, M., Hofer, S., and Thiele, H. 2005. Chemotaxonomic identification of single bacteria by micro-Raman spectroscopy: Application to clean-room-relevant biological contaminations. Appl. Environ. Microbiol. 71, 1626-1637. 

  30. Segata, N., Boernigen, D., Tickle, T.L., Morgan, X.C., Garrett, W.S., and Huttenhower, C. 2013. Computational meta'omics for microbial community studies. Mol. Syst. Biol. 9, 666. 

  31. Sharma, B., Frontiera, R.R., Henry, A.I., Ringe, E., and Van Duyne, R.P. 2012. SERS: Materials, applications, and the future. Mater. Today 15, 16-25. 

  32. Silge, A., Schumacher, W., Rosch, P., Da Costa Filho, P.A., Gerard, C., and Popp, J. 2014. Identification of water-conditioned Pseudomonas aeruginosa by Raman microspectroscopy on a single cell level. Syst. Appl. Microbiol. 37, 360-367. 

  33. Smith, G.D. and Clark, R.J. 2004. Raman microscopy in archaeological science. J. Archaeol. Sci. 31, 1137-1160. 

  34. Stockel, S., Kirchhoff, J., Neugebauer, U., Rosch, P., and Popp, J. 2016. The application of Raman spectroscopy for the detection and identification of microorganisms. J. Raman Spectrosc. 47, 89-109. 

  35. Stepanauskas, R. and Sieracki, M.E. 2007. Matching phylogeny and metabolism in the uncultured marine bacteria, one cell at a time. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 104, 9052-9057. 

  36. Tringe, S.G., Von Mering, C., Kobayashi, A., Salamov, A.A., Chen, K., Chang, H.W., Podar, M., Short, J.M., Mathur, E.J., and Detter, J.C. 2005. Comparative metagenomics of microbial communities. Science 308, 554-557. 

  37. van de Vossenberg, J., Tervahauta, H., Maquelin, K., Blokker-Koopmans, C.H., Uytewaal-Aarts, M., van der Kooij, D., van Wezel, A.P., and van der Gaag, B. 2013. Identification of bacteria in drinking water with Raman spectroscopy. Anal. Methods 5, 2679-2687. 

  38. van Manen, H.J., Lenferink, A., and Otto, C. 2008. Noninvasive imaging of protein metabolic labeling in single human cells using stable isotopes and Raman microscopy. Anal. Chem. 80, 9576-9582. 

  39. Wang, Y., Huang, W.E., Cui, L., and Wagner, M. 2016. Single cell stable isotope probing in microbiology using Raman microspectroscopy. Curr. Opin. Biotechnol. 41, 34-42. 

  40. Wang, Y., Ji, Y., Wharfe, E.S., Meadows, R.S., March, P., Goodacre, R., Xu, J., and Huang, W.E. 2013. Raman activated cell ejection for isolation of single cells. Anal. Chem. 85, 10697-10701. 

  41. Williams, A.C. and Edwards, H.G.M. 1994. Fourier transform raman spectroscopy of bacterial cell walls. J. Raman Spectrosc. 25, 673-677. 

  42. Xie, C., Mace, J., Dinno, M., Li, Y., Tang, W., Newton, R., and Gemperline, P. 2005. Identification of single bacterial cells in aqueous solution using confocal laser tweezers Raman spectroscopy. Anal. Chem. 77, 4390-4397. 

  43. Xie, X.S., Yu, J., and Yang, W.Y. 2006. Living cells as test tubes. Science 312, 228-230. 

  44. Zengler, K. 2009. Central role of the cell in microbial ecology. Microbiol. Mol. Biol. Rev. 73, 712-729. 

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