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한국에서 Sclerotinia minor에 의한 쑥부쟁이 균핵병 발생
Occurrence of Sclerotinia Rot by Sclerotinia minor on Aster yomena in Korea 원문보기

한국균학회지 = The Korean journal of mycology, v.46 no.2, 2018년, pp.200 - 204  

이상엽 (국립농업과학원 농업미생물과) ,  최효원 (국립농업과학원 작물보호과) ,  원항연 (국립농업과학원 농업미생물과) ,  한지희 (국립농업과학원 농업미생물과) ,  김다연 (국립농업과학원 농업미생물과) ,  안성호 (국립농업과학원 농업미생물과)

초록
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2016년 4월에 한국 구례지역에서 재배하는 쑥부쟁이 줄기에 균핵병이 발생하였다. 그 병징은 주로 줄기에 발생하여 물러 썩어서 심하면 식물체가 마른다. 흰색 균사가 감염된 식물체 줄기와 땅 표면에 퍼져있으며, 병든 줄기 내와 병 발생 부위에 작은 흑색 균핵을 형성하였다. 균핵병은 쑥부쟁이 재배 포장에서 20~80% 높게 발생하였다. 분리균의 형태적 특성 및 유전자 분석에 의하여 이 균은 Sclerotinia minor로 동정하였다. 한국에서 쑥부쟁이에서 분리한 Sclerotinia minor에 의한 균핵병 발생을 처음으로 보고한다.

Abstract AI-Helper 아이콘AI-Helper

Sclerotinia rot symptoms were frequently found on the stems of Aster yomena in the Gurye region of Korea in April 2016. The symptom, watery soft rot, mainly appeared on the stems, and severely infected plants blighted. White mycelia spread over the stems of the infected plants and the soil surface. ...

주제어

AI 본문요약
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제안 방법

  • 분리균주의 염기서열 분석을 위하여 genomic DNA를 추출하였다. 분리한 6개 균주(SGB31, SGB41, SGC33, SGC35, SGY31, SGY34)를 PDA배지에 각각 접종하고, 20°C에서 7~10일간 배양한 후, PDA 배지에 형성된 균핵을 수거하여 동결건조하고 마쇄하였다.
  • 분리균주의 염기서열 분석을 위하여 genomic DNA를 추출하였다. 분리한 6개 균주(SGB31, SGB41, SGC33, SGC35, SGY31, SGY34)를 PDA배지에 각각 접종하고, 20°C에서 7~10일간 배양한 후, PDA 배지에 형성된 균핵을 수거하여 동결건조하고 마쇄하였다. CTABphenol/chloroform을 이용한 Choi 등[4]의 방법으로 genomic DNA를 추출하고, ‑ 20°C에 보존하면서 실험에 사용하였다.

대상 데이터

  • 2016년에 전남 구례군의 쑥부쟁이 재배지역별로 비닐하우스 포장과 노지 포장에서 병 걸린 식물체를 채집하여 병 걸린 경계부위 조직을 잘라서 1% 차아염소산나트륨용액(NaOCl)에 20초간 침지한 후 멸균수로 3회 수세하여 건조하였다. 건조한 이병조직을 물한천배지(water agar)에 치상하여 20°C에 배양하면서 자란 단균사를 떼어 내어 potato dextrose agar (PDA;Difco, Detroit, MI, USA) 사면 배지에 치상하여 20°C에서 14일간 배양한 분리균주를 10°C 항온기에 보관하면서 실험에 사용하였다.
  • 또한 쑥부쟁이 균핵병균(Sclerotinia minor) SGC33 (KACC 48270), SGY31 (KACC 48271), SGB31 (KACC 48282) 균주는 농촌진흥청 농업미생물은행(KACC)에 기탁하였다.

데이터처리

  • MEGA6.0 프로그램을 이용하여 분자유전학적인 계통도를 작성하고 분리균주의 분류학적 위치를 확인하였다. 작성한 계통도에서 분리균주는 KF859929 Sclerotinia minor CBS:339.
  • 증폭된 band는 Wizard SV Gel & PCR Clean-Up System kit (Promega, San Luis Obispo, CA, USA)를 사용하여 정제하고, direct sequencing으로 염기 서열을 분석하였다. 분석된 염기서열은 Clustal W 소프트웨어[6]를 이용하여 정렬하였고, 계통수는 MEGA 6.0 프로그램을 이용하여 neighbor-joining법에 의해 작성하였으며, out-group 으로는 Botrytis cinerea CBS:131.28 균주(KF859918)를 사용하였다.

이론/모형

  • 분리한 6개 균주(SGB31, SGB41, SGC33, SGC35, SGY31, SGY34)를 PDA배지에 각각 접종하고, 20°C에서 7~10일간 배양한 후, PDA 배지에 형성된 균핵을 수거하여 동결건조하고 마쇄하였다. CTABphenol/chloroform을 이용한 Choi 등[4]의 방법으로 genomic DNA를 추출하고, ‑ 20°C에 보존하면서 실험에 사용하였다. Internal transcribed spacer (ITS) rDNA 염기서열 분석을 위하여 ITS1F/ITS4 프라이머를 사용하여 polymerase chain reaction (PCR) 증폭을 수행하였다[5].
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질의응답

핵심어 질문 논문에서 추출한 답변
쑥부쟁이의 사용법에는 어떤 것들이 있는가? 쑥부쟁이(Aster yomena)는 국화과에 속하는 다년생 초본으로 한국을 비롯한 일본, 중국, 시베리아에 분포하며 근경이나 종자로 번식한다. 민간에서는 전초는 ‘마란’, 지상부는 ‘백상국' 으로 불리며, 한방에서 소풍, 청열, 해독, 거담진해, 이뇨, 보익, 해소 등의 약으로 이용되어 왔다[1]. 그리고 어린순을 데쳐먹거나 기름에 볶아서 먹기도 하는 산채나물로 이용되어 왔으며, 식욕을 촉진시키는 것으로 알려져 있다[2]. 최근 산채에 대한 기능성 건강식품으로 관심이 높아지면서 각종 산채에 대한 항산화, 항암, 항염증 등 생리활성 연구가 진행되고 있으며, 쑥부쟁이 에탄올 추출물이 간세포 내 지방축적 유전자 발현 억제와 지방 축적 억제 효과가 있다고 보고한 바 있다[3].
쑥부쟁이란 무엇인가? 쑥부쟁이(Aster yomena)는 국화과에 속하는 다년생 초본으로 한국을 비롯한 일본, 중국, 시베리아에 분포하며 근경이나 종자로 번식한다. 민간에서는 전초는 ‘마란’, 지상부는 ‘백상국' 으로 불리며, 한방에서 소풍, 청열, 해독, 거담진해, 이뇨, 보익, 해소 등의 약으로 이용되어 왔다[1].
쑥부쟁이 에탄올 추출물은 어떤 약리작용이 있는가? 그리고 어린순을 데쳐먹거나 기름에 볶아서 먹기도 하는 산채나물로 이용되어 왔으며, 식욕을 촉진시키는 것으로 알려져 있다[2]. 최근 산채에 대한 기능성 건강식품으로 관심이 높아지면서 각종 산채에 대한 항산화, 항암, 항염증 등 생리활성 연구가 진행되고 있으며, 쑥부쟁이 에탄올 추출물이 간세포 내 지방축적 유전자 발현 억제와 지방 축적 억제 효과가 있다고 보고한 바 있다[3].
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참고문헌 (7)

  1. Kang BH. Korea herbal resources ecology pictorial book, 2. Seoul: GEOBOOK Press; 2008. 

  2. Han YB. Korean wild edible plant resources, 1. Seoul: Korea Univ. Press; 2002. 

  3. Kim AR, Jin Q, Jin HG, Ko HJ, Woo ER. Phenolic compounds with IL-6 inhibitory activity from Aster yomena. Arch Pharm Res 2014;37:845-51. 

  4. Choi HW, Kim JM, Hong SK, Kim WG, Chun SC, Yu SH. Mating types and optimum culture conditions for sexual state formation of Fusarium fujikuroi isolates. Mycobiology 2009;37:247-50. 

  5. White TJ, Bruns T, Lee S, Taylor J. Amplification and direct sequencing of fungal ribosomal RNA genes for phylogenetics. In: Innis MA, Gelfand DH, Sninsky JJ, editors. PCR protocols: a guide to methods and applications. San Diego: Academic Press; 1990. p. 315-22. 

  6. Thompson JD, Higgins DG, Gibson TJ. CLUSTAL W: improving the sensitivity of progressive multiple sequence alignment through sequence weighting, position specific gap penalties, and weight matrix choice. Nucleic Acids Res 1994;22:4673-80. 

  7. Damon LS. Sclerotinia monor Jagger [Internet]. Raleigh (NC): Department of Plant pathology, College of Agriculture and Life Sciences, NC State University; 2003 [cited 2018 Apr 2]. Available from: https://projects.ncsu.edu/cals/course/pp728/S_minor/Sclerotinia_ minor.html. 

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