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담수로부터 분리한 단환성 화합물 분해 미생물 Runella sp. ABRDSP2의 전장 유전체 서열
Complete genome sequence of Runella sp. ABRDSP2, a new mono-aromatic compounds degrading bacterium isolated from freshwater 원문보기

Korean journal of microbiology = 미생물학회지, v.55 no.1, 2019년, pp.55 - 57  

강혜경 (국립낙동강생물자원관 자원활용기반연구부) ,  류병곤 (국립낙동강생물자원관 자원활용기반연구부) ,  최경민 (국립낙동강생물자원관 자원활용기반연구부) ,  진현미 (국립낙동강생물자원관 자원활용기반연구부)

초록
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페놀과 같은 단환성 화합물을 분해하는 미생물인 Runella sp. ABRDSP2 균주는 담수로부터 분리되었다. 원형으로 완성된 하나의 chromosome과 3개의 plasmid로 구성된 유전체는 GC 함량이 44.4%인 총 7,613,819 bp의 크기를 나타내며 6,006개의 유전자를 인코딩하고 있다. ABRDSP2 균주는 monooxygenase, ring-cleaving dioxygenase 및 catechol 1,2-dioxygenase 등의 다수의 방향성 탄화수소를 분해하는 유전자를 함유하고 있다. 이런 전장 유전체는 Runella sp. ABRDSP2 균주가 다양한 생분해능력이 있음을 나타낸다.

Abstract ▼ AI-Helper 아이콘AI-Helper

The Runella sp. ABRDSP2, capable of degrading mono-aromatic compounds such as toluene, was isolated from freshwater. The whole genome, consisting of a circular single chromosome and three plasmids, was composed of total 7,613,819 bp length with 44.4% G+C contents and 6,006 genes. The genome of strai...

주제어

#Runella   #bioremediation   #mono-aromatic hydrocarbon degradation  

표/그림 (2)

참고문헌 (4)

  1. Grant JR and Stothard P. 2008. The CGView server: a comparative genomics tool for circular genomes. Nucleic Acids Res. 36, W181-W184. 

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  3. Larkin JM and Williams PM. 1978. Runella slithyformis gen. nov., sp. nov., a curved, nonflexible, pink bacterium. Int. J. Syst. Bacteriol. 28, 32-36. 

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  4. Tatusova T, DiCuccio M, Badretdin A, Chetvernin V, Nawrocki EP, Zaslavsky L, Lomsadze A, Pruitt KD, Borodovsky M, and Ostell J. 2016. NCBI prokaryoticgenome annotation pipeline. Nucleic Acids Res. 44, 6614-6624. 

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