[논문]우포 습지에 분포하는 수지상균근균 포자의 다양성

고강문; 박혁; 가강현; 엄안흠

doi:10.4489/kjm.20190003

우포 습지에 분포하는 수지상균근균 포자의 다양성
Spore Diversity of Arbuscular Mycorrhizal Fungi in Upo Wetland 원문보기

한국균학회지 = The Korean journal of mycology, v.47 no.1, 2019년, pp.19 - 27

고강문 (한국교원대학교 생물교육과) , 박혁 (한국교원대학교 생물교육과) , 가강현 (국립산림과학원 산림소득자원연구과) , 엄안흠 (한국교원대학교 생물교육과)

초록
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우포 습지에 서식하는 식물의 근권 토양에서 수지상균근균(AMF) 포자를 추출하였다. 추출한 포자는 형태적 특성과 18S rDNA 염기서열의 분자적 분석을 이용해 동정하였다. 그 결과 6속 9종의 AMF 포자가 분리된 것을 확인하였으며, 종 다양성 지수를 계산하여 분석한 결과 습지에서 AMF 포자의 종 다양성은 식물에 의해 영향을 받는 것을 확인하였다. 연구 과정에서 국내 미기록종 1종을 확인하였으며, 확인된 종은 Diversispora epigaea이다. 미기록종 AMF 포자의 형태적 특성 및 분자적 분석의 결과에 대해 서술하였다.

Abstract ▼ AI-Helper

We extracted arbuscular mycorrhizal fungal (AMF) spores from rhizospheres of three plants from Upo Wetland, Korea. We identified the isolated AMF spores based on morphological characteristics and phylogenetic analysis of partial 18S rDNA nucleotide sequences. The species diversity of AMF spores was calculated among the study sites and host plants. Consequently, nine species from six genera of AMF spores were identified. We confirmed the species diversity of the AMF spores in rhizospheres affected by host plants in the wetland. In the course of this study, we confirmed a previously unreported AMF species in Korea: Diversispora epigaea. We described the morphological features and molecular characteristics of this previously unreported AMF species.

주제어

표/그림 (7)

그림 Fig. 1. The information about sampling sites based on GPS coordinates. The dotted marks indicate sampling sites.
그림 Fig. 2. Neighbor-joining phylogenetic tree based on 18S partial rDNA sequences. Rhodotorula hordea was used as an outgroup. Numbers on branches indicate bootstrap values (1,000 replicates). Fungal strain isolated in this study is in bold.
표 Table 1. Relative abundance and community sturctures of arbuscular mycorrhizal fungal spores isolated from rhizospheres of different host plants in Upo Wetlands.
그림 Fig. 3. Spores of Diversispora epigaea isolated from rhizosphere. Whole spores (A), spore mounted in PVLG (B, C), characteristics of spore walls (D, E), subtending hyphae (F) (scale bars =100 μm).
표 Table 2. Relative abundance and community sturctures of arbuscular mycorrhizal fungal spores isolated from different sampling sites of Upo Wetlands.
그림 Fig. 4. Neighbor-joining phylogenetic tree based on sequences of Krüger fragment. Acaulospora delicata was used as an outgroup. Numbers on branches indicate bootstrap values (1,000 replicates). Fungal strain isolated in this study is in bold.
그림 Fig. 5. Non-metric multidimensional scaling (NMS) plots for the spore communities of arbuscular mycorrhizal fungi isolated from rhizosphere of three different host plants within sampling sites of Woopo Wetlands.

AI 본문요약
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문제 정의

) Franch.), 잠자리피(Trisetum bifidum (Thunb.) Ohwi) 3종의 식물 근권에서 AMF포자를 분리하여 우포 습지 토양 내의 AMF 다양성을 확인하고, 그 과정에서 확인된 AMF 미기록종의 특성에 대해 보고하고자 한다.
연구 과정에서 국내 미기록종 1종을 확인하였으며, 확인된 종은 Diversispora epigaea이다. 미기록종 AMF 포자의 형태적 특성 및 분자적 분석의 결과에 대해 서술하였다.

제안 방법

1차 PCR 산물을 1/10 로 희석한 DNA를 2차 PCR의 template DNA로 사용하였으며, 2차 PCR은 SSUmCf, LSUmAr 프라이머를 이용하였고 annealing 온도는 63°C 로 설정하여 수행하였다[20].
AMF 포자 PVLG (polyvinyl alcohol-lactic acid-glycerol)와 Melzer’s reagent를 떨어뜨린 후 광학현미경 상에서 포자의 크기, 형태, 표면 등을 관찰하였다[16, 17].
PCR과정은 nested PCR로 2회에 걸쳐 진행되었으며, 1차 PCR은 SSUmAf, LSUmAr 프라이머를 이용하였고, annealing 온도는 60°C로 설정하여 수행하였다[19].
PCR은 AML1, AML2 프라이머를 이용하였으며 annealing 온도는 56°C로 설정하여 수행하였다[18].
PCR은 AML1, AML2 프라이머를 이용하였으며 annealing 온도는 56°C로 설정하여 수행하였다[18]. PCR이 완료된 후 agarose gel에서 20분간 전기영동하여 780 bp 크기의 DNA단편을 확인하여 DNA 염기서열 분석을 의뢰하였다(SolGent, Daejeon, Korea). 분석된 염기서열을 NCBI상에서 BLAST하여 일치도가 가장 높은 종을 확인하고, MEGA7 프로그램을 이용하여[19] neighbor-joinning phylogenetic tree를 작성하였다(Fig.
형태적 특성과 분자적 분석을 종합하여 최종적으로 동정된 AMF 포자의 relative abundance를 구하고, 근권 샘플 별로 AMF의 종 다양성 지수(Shannon’s diversity index), 종 균등도(species evenness)를 구하고 one-way ANOVA 방법을 이용하여 지역 및 기주 식물에 따른 AMF 포자의 다양성을 비교하였다. 또한 nonmetric multidimensional scaling (NMS)를 이용하여 군집 구조를 분석하였다.
야외 토양에서 AMF 포자를 추출하기 위해 65°C의 오븐(WiseVen, DAIHAN Scientific, Korea)에서 72시간 동안 건조했으며, 건조된 토양 10 g씩에서, AMF 포자를 추출하였다 [15].
추출된 AMF 포자는 해부현미경 및 광학현미경 상에서 관찰하여 형태적 특성을 확인하였다. AMF 포자 PVLG (polyvinyl alcohol-lactic acid-glycerol)와 Melzer’s reagent를 떨어뜨린 후 광학현미경 상에서 포자의 크기, 형태, 표면 등을 관찰하였다[16, 17].
우포 습지에 서식하는 식물의 근권 토양에서 수지상균근균(AMF) 포자를 추출하였다. 추출한 포자는 형태적 특성과 18S rDNA 염기서열의 분자적 분석을 이용해 동정하였다. 그 결과 6속 9종의 AMF 포자가 분리된 것을 확인하였으며, 종 다양성 지수를 계산하여 분석한 결과 습지에서 AMF포자의 종 다양성은 식물에 의해 영향을 받는 것을 확인하였다.
AMF 포자 PVLG (polyvinyl alcohol-lactic acid-glycerol)와 Melzer’s reagent를 떨어뜨린 후 광학현미경 상에서 포자의 크기, 형태, 표면 등을 관찰하였다[16, 17]. 형태적 특성을 통해 분류된 포자를 0.2 mlube에 한 개씩 넣고 깨뜨려 genomic DNA를 추출한 뒤 분자적 분석을 위해 18S rDNA지역을 증폭하였다. PCR은 AML1, AML2 프라이머를 이용하였으며 annealing 온도는 56°C로 설정하여 수행하였다[18].

대상 데이터

1). 갈대, 물억새, 잠자리피 3종의 기주 식물을 3곳의 채집위치에서 100 m씩 이동하면서 5샘플씩 반복채집하여 총 45점의 샘플을 확보하였다. 근권 토양은 기주 식물의 뿌리에서 10 cm 이상 토양을 파내어 근권당 1 kg 정도씩 채집하였고, 채집된 토양은 기주식물과 함께 폴리에틸렌 백에 담아 밀봉한 후 24시간 내에 실험실로 운반하였다.
갈대, 물억새, 잠자리피 3종의 기주 식물을 3곳의 채집위치에서 100 m씩 이동하면서 5샘플씩 반복채집하여 총 45점의 샘플을 확보하였다. 근권 토양은 기주 식물의 뿌리에서 10 cm 이상 토양을 파내어 근권당 1 kg 정도씩 채집하였고, 채집된 토양은 기주식물과 함께 폴리에틸렌 백에 담아 밀봉한 후 24시간 내에 실험실로 운반하였다. 야외 토양에서 AMF 포자를 추출하기 위해 65°C의 오븐(WiseVen, DAIHAN Scientific, Korea)에서 72시간 동안 건조했으며, 건조된 토양 10 g씩에서, AMF 포자를 추출하였다 [15].
연구에 사용된 근권 토양의 수집은 2017년 5월 경상남도 창녕군의 우포늪에서 실행되었다. 우포 습지는 크게 우포, 쪽지벌, 목포, 사지포 4곳의 늪과 토평천이라는 하천으로 이루어지는데, 이 중 서로 인접해 있는 지역인 우포(N35°32'48.
우포 습지는 크게 우포, 쪽지벌, 목포, 사지포 4곳의 늪과 토평천이라는 하천으로 이루어지는데, 이 중 서로 인접해 있는 지역인 우포(N35°32'48.8", E28°24'38.2"~N35°32'56.0", E128°24'55.7"), 목포 (N35°33'14.2", E128°24'10.6"~N35°33'27.7", E128°24'12.2"), 쪽지벌(N35°32'52.0", E128°24'18.8"~ N35°32'59.9", E128°24'13.3") 3곳의 늪지 부근에서 채집을 진행하였다(Fig. 1).
우포 습지에 서식하는 식물의 근권 토양에서 수지상균근균(AMF) 포자를 추출하였다. 추출한 포자는 형태적 특성과 18S rDNA 염기서열의 분자적 분석을 이용해 동정하였다.

데이터처리

PCR이 완료된 후 agarose gel에서 20분간 전기영동하여 780 bp 크기의 DNA단편을 확인하여 DNA 염기서열 분석을 의뢰하였다(SolGent, Daejeon, Korea). 분석된 염기서열을 NCBI상에서 BLAST하여 일치도가 가장 높은 종을 확인하고, MEGA7 프로그램을 이용하여[19] neighbor-joinning phylogenetic tree를 작성하였다(Fig. 2). 미기록종 AMF포자의 경우 18S rDNA 와 internal transcribed spacer (ITS) 지역을 포함하는 “Krüger fragment”[20]의 1,500 bp 길이의 DNA절편을 증폭하여 분자적 분석을 위와 동일하게 진행하였다.
형태적 특성과 분자적 분석을 종합하여 최종적으로 동정된 AMF 포자의 relative abundance를 구하고, 근권 샘플 별로 AMF의 종 다양성 지수(Shannon’s diversity index), 종 균등도(species evenness)를 구하고 one-way ANOVA 방법을 이용하여 지역 및 기주 식물에 따른 AMF 포자의 다양성을 비교하였다.

성능/효과

DNA 염기서열 분석 결과 18S rDNA 지역의 염기서열은 D. epigaea X86687.1과 99%의 일치도를, Krüger fragment의 DNA 염기서열은 D. epigaea FR686939.1과 97%의 일치도를 보였으며 모두 같은 계통을 형성하였다(Fig. 4).
추출한 포자는 형태적 특성과 18S rDNA 염기서열의 분자적 분석을 이용해 동정하였다. 그 결과 6속 9종의 AMF 포자가 분리된 것을 확인하였으며, 종 다양성 지수를 계산하여 분석한 결과 습지에서 AMF포자의 종 다양성은 식물에 의해 영향을 받는 것을 확인하였다. 연구 과정에서 국내 미기록종 1종을 확인하였으며, 확인된 종은 Diversispora epigaea이다.
기주 식물별로 종 다양성을 분석한 결과 상대 수도와 포자 수는 서로 유의미한 차이가 없었으나 잠자리피의 근권에서 종 다양성 지수와 종 균등도가 가장 유의미하게 높았으며, 갈대의 근권에서 가장 낮은 것을 확인하였다(Table 1). 채집 지역 별로 종 다양성을 비교하였을 때에는 유의미한 결과가 나타나지 않은 것으로(Table 2) 유추해 볼 때 습지 근권에서 AMF의 종 다양성은 토양의 지역 보다는 기주 식물의 종에 따른 영향이 더 크다고 볼 수 있었다.
또한 NMS분석의 결과 갈대와 물억새 근권의 AMF 군집은 분석된 plot 상에서 서로 가까이 위치 하는 반면에, 잠자리피 근권의 AMF 군집은 보다 멀리 떨어져 위치하는 것을 확인할 수 있었다(Fig.5). 이러한 결과는 습지 내에서의 식물 중 특정 종의 근권에서는 다른 식물들과 다른 형태의 AMF 군집 구조가 발달하며, 기주 식물의 종에 따라 근권 토양 내의 AMF 군집에 변화가 발생할 수 있다는 점을 시사한다[11].
caledonium이 습지의 근권에서 분리된 기록이 상당수 존재한다[23-25]. 야외 토양에서 확인된 AMF 종 중 Diversispora epigaea는 국내 미기록종으로 확인되었다.
그 결과 6속 9종의 AMF 포자가 분리된 것을 확인하였으며, 종 다양성 지수를 계산하여 분석한 결과 습지에서 AMF포자의 종 다양성은 식물에 의해 영향을 받는 것을 확인하였다. 연구 과정에서 국내 미기록종 1종을 확인하였으며, 확인된 종은 Diversispora epigaea이다. 미기록종 AMF 포자의 형태적 특성 및 분자적 분석의 결과에 대해 서술하였다.
우포 습지의 근권 토양 45점에서 AMF 포자를 분리한 결과 6속 9종의 AMF 포자가 확인되었으며, 지역별로는 우포에서 4속 7종, 목포에서 5속 7종, 쪽지벌에서 5속 6종의 포자가 확인되었고, Ambispora leptoticha와 Diversispora aurantia는 잠자리피의 근권에서만 확인되었으며, Claroideoglomus claroideum과 Funneliformis geosporum은 갈대와 잠자리피의 근권에서만 확인되었고 Paraglomus occultum, Septoglomus constrictum은 물억새와 잠자리피의 근권에서만 확인되었다(Table 1). 지역별로는 우포에서 4속 7종, 목포에서 5속 7종, 쪽지벌에서 5속 6종의 포자가 확인되었고 D.
우포 습지의 근권 토양 45점에서 AMF 포자를 분리한 결과 6속 9종의 AMF 포자가 확인되었으며, 지역별로는 우포에서 4속 7종, 목포에서 5속 7종, 쪽지벌에서 5속 6종의 포자가 확인되었고, Ambispora leptoticha와 Diversispora aurantia는 잠자리피의 근권에서만 확인되었으며, Claroideoglomus claroideum과 Funneliformis geosporum은 갈대와 잠자리피의 근권에서만 확인되었고 Paraglomus occultum, Septoglomus constrictum은 물억새와 잠자리피의 근권에서만 확인되었다(Table 1). 지역별로는 우포에서 4속 7종, 목포에서 5속 7종, 쪽지벌에서 5속 6종의 포자가 확인되었고 D. aurantia는 우포의 근권에서만 확인되었으며 S. constrictum은 쪽지벌의 근권에서만 확인되었고, A. leptoticha와 F. geosporum은 우포와 목포의 근권에서만 확인되었으며 P. occultum은 목포와 쪽지벌의 근권에서만 확인되었다(Table 2). 기존의 국내 선행 연구에서는 경기[10], 충북[21], 전남[11] 등의 내륙 산림 토양에서 Acaulospora 속과 Ambispora 속이 우점하였으며 충남의 도서 지역에서도 Acaulospora 속이 우점한다는 결과가 존재하는데[22], 본 연구에서는 이러한 연구들과는 다르게 Acaulospora에 속하는 AMF가 근권 토양 내에서 확인되지 않았으며 Diversispora, Funneliformis 등에 속하는 AMF 포자를 주로 확인할 수 있었다.
기주 식물별로 종 다양성을 분석한 결과 상대 수도와 포자 수는 서로 유의미한 차이가 없었으나 잠자리피의 근권에서 종 다양성 지수와 종 균등도가 가장 유의미하게 높았으며, 갈대의 근권에서 가장 낮은 것을 확인하였다(Table 1). 채집 지역 별로 종 다양성을 비교하였을 때에는 유의미한 결과가 나타나지 않은 것으로(Table 2) 유추해 볼 때 습지 근권에서 AMF의 종 다양성은 토양의 지역 보다는 기주 식물의 종에 따른 영향이 더 크다고 볼 수 있었다.

질의응답

핵심어	질문	논문에서 추출한 답변
	수지상균근균이란?	수지상균근균(Arbuscular Mycorrhizal Fungi, AMF)은 육상 식물과 공생 관계를 이루는 가장 대표적인 균근균이다. Glomeromycota문에 속하는[1] AMF는 토양 내에서는 무성 포자의 형태로 존재하다가 식물의 뿌리 속에 균사를 침투시켜 수지상균근을 형성하며, 80% 이상의 다양한 육상 식물이 이러한 AMF와의 공생 구조를 갖는다[2].
	우포 습지는 어떤 지역인가?	경남 창녕군에 위치하고 있는 우포 습지는 국내 최대의 내륙 습지로써, 수생·습생 식물을 포함하여 총 86과 350여종에 달하는 식물이 서식하고 있는 지역이다[7]. AMF는 본래 습지 생태계에는 영향을 많이 미치지 못하는 것으로 알려져 왔으며[8, 9] 우리나라에서도 대부분의 AMF 관련 연구는 내륙의 산림 토양[10-11] 혹은 경작지[12-13] 등에 국한되어 있었으나, 최근의 연구 결과에서 습지 식물의 뿌리에도 상당 부분 AMF가 영향을 줄 수 있다는 것이 밝혀짐에 따라[14] 습지에서의 AMF에대한 연구가 필요한 실정이다.
	수지상균근균는 식물에 어떤 도움을 주는가?	Glomeromycota문에 속하는[1] AMF는 토양 내에서는 무성 포자의 형태로 존재하다가 식물의 뿌리 속에 균사를 침투시켜 수지상균근을 형성하며, 80% 이상의 다양한 육상 식물이 이러한 AMF와의 공생 구조를 갖는다[2]. AMF는 기주식물에서 광합성 산물을 공급받고 기주식물의 인산 흡수 능력 증가, 식물 뿌리 병원체에 대한 저항성 제공과 수분 및 염분, 중금속 등에 의해 식물이 받는 스트레스에 대한 내성 획득 등의 도움을 제공하여 식물의 적응도를 높인다[3-6].

저자의 다른 논문 :

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표제어: PCR

동의어: Packet Collision Rate

용어 설명 출처 목록 (6)

용어 설명: PCR은 세균 특이성이 있는 primer를 이용하여 적은 수의 세균이 있을지라도 쉽게 검출할 수 있는 유용한 방법이며, 이를 이용하여 구강 내 치면세균막이나 타액에서 직접 세균을 검출할 수 있게 되었다[8].

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