[논문]독도에서 새롭게 발견된 Xylodon flaviporus

조종원; 곽영남; 조성은; 한상국; 한재구; 오승환; 김창선

doi:10.4489/kjm.20190028

독도에서 새롭게 발견된 Xylodon flaviporus
Xylodon flaviporus, a Newly Recorded Macrofungi in Dokdo, South Korea 원문보기

한국균학회지 = The Korean journal of mycology, v.47 no.3, 2019년, pp.241 - 247

조종원 (국립수목원 산림생물다양성연구과) , 곽영남 (국립수목원 산림생물다양성연구과) , 조성은 (국립수목원 산림생물다양성연구과) , 한상국 (국립수목원 산림생물다양성연구과) , 한재구 (농촌진흥청 국립원예특작과학원) , 오승환 (국립수목원 산림생물다양성연구과) , 김창선 (국립수목원 산림생물다양성연구과)

초록
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2017년 독도의 버섯상 조사를 통해 관속식물인 왕호장근의 기부에 발생한 목재부후균 버섯표본을 수집하였다. 수집된 목재부후균은 배착성으로 자라는 가죽질의 자실체를 형성하였고 자실층은 관공형태를 나타내었다. 또한 균사체계는 위이균사형이며 타원형의 담자포자를 형성하였다. 형태적 특징과 균류바코드 영역 (internal transcribed spacer of rDNA) 분석을 통하여 이 버섯을 Xylodon flaviporus (Berk. & M.A. Curtis ex Cooke) Riebesehl & Langer로 동정하였다. 이 버섯은 독도에서 서식이 확인된 두 번째 종이며, 다년생 초본식물인 왕호장근을 X. flaviporus의 새로운 기주식물로 보고하고자한다.

Abstract ▼ AI-Helper

In 2017, we collected a wood-decay fungus growing on a dead and decaying herbaceous plant (Reynoutria sachalinensis (F. Schmidt) Nakai) in Dokdo, the far-eastern island of South Korea. Morphologically, this species is characterized by resupinate, coriaceous to corky basidiocarps, poroid hymenophores, pseudodimitic hyphal system, and ellipsoid basidiospores. Based on morphological observation and internal transcribed spacer of ribosomal DNA, the fungus was identified as Xylodon flaviporus (Berk. & M.A. Curtis ex Cooke) Riebesehl & Langer. It is only the second macrofungal species reported from Dokdo, and R. sachalinensis is the first herbaceous plant to be identified as a host for X. flaviporus.

주제어

표/그림 (3)

표 Table 1. Information of ITS sequences used in this study
그림 Fig. 1. One of nine most parsimonious trees from a heuristic analysis of ITS sequences. Broad black branches indicate maximum parsimony bootstrap support value (MPBS)>70% and Bayesian posterior probabilities (PP) >0.95. Only MPBS values>70% are shown. Kneiffiella decorticans and K. eflbulata were used as the outgroups. ‘T’ indicate sequences of the holotype. CI, consistency index; HI, homoplasy index; RI, retention index.
그림 Fig. 2. Morphological characters of Xylodon flaviporus (KA17-0796) and its host plant (Fallopia sachalinensis).

AI 본문요약
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* AI 자동 식별 결과로 적합하지 않은 문장이 있을 수 있으니, 이용에 유의하시기 바랍니다.

문제 정의

미생물에 대한 조사로는, 식물 근권세균 [12] 과 내생진균 [13] 에 대한 연구가 수행되었지만 버섯의 경우 2013 년 동도에서 발견된 여름찹쌀떡버섯(Bou* aestvais)이 첫 기록으로, 버섯의 분포는 거의 알려져 있지 않다[14]. 본 연구를통하여 독도에 서식하고 있는버섯 1종을추가로발견하였고, 이를새로운 기주식 물과함께 보고하고자 한다.

제안 방법

Cetyl Trimethyl Ammonium Bromide (CTAB) 방법 [15] 을 사용하여 자실체의 조직으로부터 DNA를추줄하였고 rrS5/TTS4 primer[16] 를 사용하여 균류 바코드 영역인 Internal Transcribed Spacer of rDNA (ITS) 염기서열을 분석하였다 Polymerase Chain Reaction (PCR) 조성은 0.5 pM의 각 primer, 0.25 mM 의 dNTR 1.5 mM의 MgCl2, 10 mM의 Tris-HCl, 50 mM KCl, 2.5 U의 Taq DNA polymerase 그리고 15 ng 의 genomic DNA로 하였다. PCR 반응 조건은 initial denaturation을 94℃에서 4 분 시행 후 denaturation을 94°C 40초 annealing을 52℃에서 40초 extension을 72℃에서 60초로 34 cycle을 반응시킨 후 72℃에서 8분간 처리하였다.
PCR 반응 조건은 initial denaturation을 94℃에서 4 분 시행 후 denaturation을 94°C 40초 annealing을 52℃에서 40초 extension을 72℃에서 60초로 34 cycle을 반응시킨 후 72℃에서 8분간 처리하였다. PCR 산물은 Macrogen (Seoul, Korea) 에 의뢰하여 염기서열을 결정하였다. 계통수 작성에 앞서 독도에서 발견된 버섯의 ITS영역 염기서열을 blast search를 통하여 Xylodon (Pers.
PCR 산물은 Macrogen (Seoul, Korea) 에 의뢰하여 염기서열을 결정하였다. 계통수 작성에 앞서 독도에서 발견된 버섯의 ITS영역 염기서열을 blast search를 통하여 Xylodon (Pers.) Gray 속에 속하는 것을 확인하였고 이를 바탕으로 GenBank database에 등록된 Xylodon의 근연속인 Lyomyces, Hyphodonta, Kneifella의 염기서열들을 계통수 분석에 사용하였다 (Table 1). 선택된 염기서열들은 ClustalX v 1.
형태동정을 위해 1% Congo Red 용액으로 자실체의 절편을 염색 후 광학현미경 (Olympus, BX53, Tokyo, Japan) 을 이용하여 담자포자, 담자기, 낭상체 등의 미세구조를 관찰하였다. 또한, ProgRes CapturePro v.2.8.8 (Jenoptik Co.) 프로그램을 이용하여 각 미세구조의 길이를 측정하였다
형태동정을 위해 1% Congo Red 용액으로 자실체의 절편을 염색 후 광학현미경 (Olympus, BX53, Tokyo, Japan) 을 이용하여 담자포자, 담자기, 낭상체 등의 미세구조를 관찰하였다. 또한, ProgRes CapturePro v.

대상 데이터

2017년 9월, 독도의 주요 섬인 동도와 서도의 접근이 용이한 모든 지역을 대상으로 버섯상 조사를수행하였다 채집된 버섯은 사진 촬영 후 채집장소 서식처, 기주 등 정보를 기재하였고 열풍 건조 후국립수목원 산림생물표본관관Herbarium of the Korea National Arboretum; KH) 에 보관하였다. 형태동정을 위해 1% Congo Red 용액으로 자실체의 절편을 염색 후 광학현미경 (Olympus, BX53, Tokyo, Japan) 을 이용하여 담자포자, 담자기, 낭상체 등의 미세구조를 관찰하였다.

데이터처리

) Gray 속에 속하는 것을 확인하였고 이를 바탕으로 GenBank database에 등록된 Xylodon의 근연속인 Lyomyces, Hyphodonta, Kneifella의 염기서열들을 계통수 분석에 사용하였다 (Table 1). 선택된 염기서열들은 ClustalX v 1.81[17]를 이용하여 정렬 후 PHYDIT v 3.2[18] 프로그램으로 편집하였고 계통수 분석은 PAUP_* v 4.0 b10[19] 을 이용한 Maximum parsimony (MP) bootstrap analysis와 MrBayes v 3.1.2을 이용한 Bayesian inference (BI)[20] 에 기반하여 수행하였다. BI 분석에는 jModeltest[21] 를 수행하여 선정된 GTR+I+G 모델을 사용하였다.

이론/모형

2을 이용한 Bayesian inference (BI)[20] 에 기반하여 수행하였다. BI 분석에는 jModeltest[21] 를 수행하여 선정된 GTR+I+G 모델을 사용하였다.

성능/효과

37 개의 taxa를 포함한 ITS dataset에 대한 MP 및 BI 분석 결과는 Fig. 1에 표기하였다 독도에서 발견된 버섯은 X. flaviporus 염기서열들(KJ668462, KJ140637, AF145573, AF145585, AF145574, AF145575) 과 하나의 그룹을 형성하였고(MPBS = 100, PP = 1.0) 형태적으로 유사한 X subfaviporus(KX857803) 그리고 X.paradoxus(AF145572, AF145571)와 명확히 구분되었다(Fig. 1). 또한 형태적으로 X.
favpoms에 비하여 두상형낭상체의 벽이 얇고 담자포자의 길이가 다소 짧은 차이점이 있다23]. 위의 형태적 특징 및 분자생물학적 분석을 통하여 본 연구를 통해 독도에서 발견된버섯을 X. faviporus 로 동정하였다.

후속연구

에서 발견되었다 [32, 33]. 이들 초본식물들은 리그닌 성분을 가지고 있을 가능성이 높을 것으로 추측되며, 추후 성분분석 등의 연구를 통해 관련성을 확인해 보면 좋을 것으로 기대한다

참고문헌 (33)

Sun BY, Park JH, Kwak MJ. Characteristic of vascular flora of Ulleung and Dokdo. Rep Surv Nat Environ Korea 1996;10:113-35.
Sun BY, Sul MR, Im JA, Kim CH, Kim TJ. Evolution of endemic vascular plants of Ulleungdo and Dokdo in Korea-floristic and cytotaxonomic characteristics of vascular flora of Dokdo. Kor J of Plant Taxon 2002;32:143-58.

상세보기
Kim MH, Oh YJ, Kim CS, Han MS, Lee JT, Na YE. The flora and vegetation distribution in Dokdo. Kor J Environ Agric 2007;26:85-93.

원문보기 상세보기
Park SJ, Song IG, Park SJ, Lim DO. The flora and vegetation of Dokdo Island in Ulleung-gun, Gyeongsanbuk-do. Kor J Env Eco 2010;24:264-78.
Jung SY, Byun JG, Park SH, Oh SH, Yang JC, Jang JW, Chang KS, Lee YM. The study of distribution characteristics of vascular and naturalized plants in Dokdo, South Korea. J Asia Pac Biodivers 2014;2:197-205.
Park KT, Suh SJ. Nature and ecosystem of Dokdo Island. Kor Assoc Nat 2005; IV-Insect:13-4.
Kim KG, Yeom JA. Insect fauna of Dokdo. In: Kim JH, Eun Y, editors. Report of Dokdo Island ecosystem survey. Korea: Ministry of Environment; 2006. p. 91-9.
Hwang DU, Suh SJ, Choi KS. Four newly recorded species with a note on insect fauna from the Dokdo Islands, Korea. J Asia-Pac Biodivers 2017;10;587-91.

상세보기
Kim DG, Park BY, Ryu YH. Soil nematode Fauna in Dokdo Island of Korea. Res Plant Dis 2012;18:381-6.

원문보기 상세보기
Lee HW, Hong BK, Sohn MH, Chun YY, Lee DW, Choi YM, Hwang KS. Seasonal variation in species composition of fish collected by trammel net around Dokdo, East Sea of Korea. Kor J Fish Aquat Sci 2010;43:693-704.
Choi CG, Lee HW, Hong BK. Marine algal flora and community structure in Dokdo, East sea, Korea. Kor J Fish Aquat Sci 2009;42:503-8.
Jeon S, Sung HR, Park YM, Pak JH, Ghim SY. Analysis of endospore-forming bacteria or nitrogen-fixing bacteria community isolated from plants rhizosphere in Dokdo Island. Kor J Microbiol Biotechnol 2009;37:189-96.
You YH, Yoon HJ, Lee GS, Woo JR, Rim SO, Shin JH, Lee IJ, Choo YS, Kim JG. Diversity and plant growth-promotion of endophytic fungi isolated from the roots of plants in Dokdo islands. Kor J Life Sci 2011;21:992-6.

원문보기 상세보기
Kim CS, Jo JW, Kwag YN, Sung GH, Lee SG, Kim SY, Shin CH, Han SK. Mushroom flora of Ulleung-gun and a newly recorded Bovista species in the Republic of Korea. Mycobiology 2015;43:239-57.

원문보기 상세보기
Doyle JJ, Doyle JL. A rapid DNA isolation procedure for small quantities of fresh leaf tissue. Phytochem Bull 1987;19:11-5.
White TJ, Bruns T, Lee S, Taylor J. Amplification and direct sequencing of fungal ribosomal RNA genes for phylogenetics. In: Innis DH, Gelfand DH, Sninsky JJ, White TJ, editors. PCR protocols: a guide to methods and application. San Diego: Academic Press; 1990. p. 315-22.
Thompson JD, Gibson TJ, Plewniak F, Jeanmougin F, Higgins DG. The CLUSTAL_X windows interface: flexible strategies for multiple sequence alignment aided by quality analysis tools. Nucleic Acids Res 1997;25:4876-82.

상세보기
Chun J. Computer-assisted classification and identification of Actinomycetes [dissertation]. Newcastle upon Tyne: University of Newcastle; 1995.
Swofford DL. PAUP*: phylogenetic analysis using parsimony (*and other methods). Version 4.0 b10. Sunderland: Sinauer Associates; 2003.
Ronquist F, Huelsenbeck JP. MrBayes 3: Bayesian phylogenetic inference under mixed models. Bioinformatics 2003;19:1572-4.

상세보기
Posada D. jModeltest: phylogenetic model averaging. Mol Biol Evol 25:1253-6.

상세보기
Lim YW, Jung HS. Taxonomic study on Korean Schizopora. Mycobiology 2001;29:194-7.

원문보기 상세보기
Chen CC, Wu SH, Chen CY. Xylodon subflaviporus sp. nov. (Hymenochaetales, Basidiomycota) from East Asia. Mycoscience 2018;59:343-52.

상세보기
Lim YW, Kim YS, Jung HS. The Aphyllophorales of Mungyong Saejae. Mycobiology 2000;28:142-8.

원문보기 상세보기
Riebesehl J, Langer E. Hyphodontia s.l. (Hymenochaetales, Basidiomycota): 35 new combinations and new keys to all 120 current species. Mycol Prog 2017;16:637-66.

상세보기
Kim CM, Lee JS, Jung HS, Lim YW. The wood-rotting fungal flora of three island in the Yellow sea, Korea. Mycobiology 2009;37:147-51.

원문보기 상세보기
Wu SH. Studies on Schizopora flavipora s.l., with special emphasis on specimens from Taiwan. Mycotaxon 2000;76:51-66.

상세보기
Yurchenko E, Wu SH. Three new species of Hyphodontia with peg-like hyphal aggregations. Mycol Prog 2014;13:533-45.

상세보기
Titei V, Cirlig N, Stavarache M, Gutu A, Cosman S. Some biological features and the biochemical composition of Polygonum sachalinense in Moldova. Res J of Agric Sci 2018;50:26-32.
Kotiranta H, Saarenoksa R. Three new species of Hyphodontia (Corticiaceae). Ann Bot Fenn 2000;37:255-78.

상세보기
Riebesehl J, Yurchenko, Nakasone K, Langer E. Phylogenetic and morphological studies in Xylodon (Hymenochaetales, Basidiomycota) with the addition of four new species. MycoKeys 2019;47:97-137.

상세보기
Langer E. Die Gattung Hyphodontia John Eriksson. Bibl Mycol 1994;154:1-289.
Boidin J, Gilles G. Homobasidiomycetes Aphyllophorales non pores a basides dominantes a 2(3) sterigmates. Bull Soc Mycol Fr 2003;119:1-18.

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표제어: PCR

동의어: Packet Collision Rate

용어 설명 출처 목록 (6)

용어 설명: PCR은 세균 특이성이 있는 primer를 이용하여 적은 수의 세균이 있을지라도 쉽게 검출할 수 있는 유용한 방법이며, 이를 이용하여 구강 내 치면세균막이나 타액에서 직접 세균을 검출할 수 있게 되었다[8].

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